| Id Trinity | TRINITY_DN46085_c0_g1_i10 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_418527 |
| Sequence | TTTGCTATGTTTGCTTCGAATTAAGGGCTTTGAAGTTGTTTGTTTAAAGAAATCTTCAATTTATGTGAATCTAATTTTTTTTTTTTTTTATTCCCGAGAG AGGATATATAAGATTTATTTGGGGTTGGGTGACACAAAAACTGCCATTTTTTTTGTTTTATTTTGCCATCTTTGCCTACTGCTCTCTGTAGAATATATTC CGGAGATTTTGTTAACGTTGTGTGTATTCATTATATGCCAAGCATATGGATCTCCTATCGATTACAGTGTGTCAACAGTGAATAAATTTTACGTTTATGT GTTACAGCTCTGATGATGAAGGCATGTTGCTGTAAATTCAACTTTGGATCATGATCCGGGGTTGTTTTTTAGTTAAAATGGGTTAATAAGTGTGTTGGAT GATGGAAATAGTCCATTCTGCATGAACTTGTGAAGTTTTGTACCATGAAATCTGTTGTGTGGGTTCTCATTTTGCAGATTCATGAAAATATGTTTGATTT GGGTTATTTGTGAAGACGGTGTCATGTTTAATGGAATGTGGAATAGAATCACACTGTACCATGTGAGCAATGCGCTAGAACATCAATTTGGTCACATAAT TTGTTGAGGACAGCGACTGACCATTGCGATTTGATTTTGGTGACTAATCTTACACTATAACCAATGTTTGTTTGATATATTTGGGTTCCACGGGATATAT TTAGTTTCCACAGCAAGAAGTTCTTTGTAGCTGGATGAATTGTTACCTTTGCTGATACTGTTCTGACATTACGGAATGGTGACATTTATTGATGATAAGC TTCATATTATTATCAGTCATCTATGGTTATTTCATATCCAGTTACATGTATATGGTTTTGCTTTGGAATAGTCCTTGTAATATTTTTTGGCTGGTGGTTG TCATTTTAGTTTCGTTGGGTCTTTCTTGTTTGGTTGGTTAATTAGGGATGATTCAGCTGGTTATTTATTTGCAACATGGAAAGAAGCTACTCAGATTAGG ATTTCCACGTGGATGTTTAGGAATTTTGTTATCATGTGATTGTGTCTGTTGAATCCTTACAATTTTTCATATTGATGTGCATTACCTGGAGGCATTGATA TGGTACAGAGAAGGGATGCATATCTGCTAAAATGAGGGAGTGCACTTCTCCATGTCCAATTTCATTCTCCAATTGCTTTGATGTTACTTGGGGGGTGTTA TTGCCATTGTTCTGCACGGGTTCAGTGGGGTTTATCTGCATGGGCCATTGTTTTGCATGGCTTGCTACAAATTTATGAGCTATGCTGCTCTGTATCTACC TTTGGGTGTCACAACATACAGGGAAGATGGTTGCTAAAAGAGTCAAAGAGGTGTTATGGTGGCAAGATGCCAAACTTTGGGAACCTTCACTCTGCAGTGG TATTTGTTGGTGGTTATTTCTTTGTGGCCTGCTTTCTGTTCTTGTGCCCCTGAATATGATTACTTTATAAAGGGTGAAATGACGCAGGACTATTGTTTGT CATGTCGGATTAGTTTTTTTAGGAGCGTTAGCTTGTACTGTTGACCAGGTTTTGAACTTAGTTCTCACTTTATGCTTCAGCGTATAGGTCCAAAATTTGG ATTTAATATTTCAGATGCTTAGGTTAAATGATTTGTGTGTTTAACTATATCCTGGTCTGATATATCATTTGGAGATTGATAGAATTGGGATCAAGGATAT AAGGGAGGTAGCTTATGTGTTATGGAAAGCCCTGCCCATAGAACCGGTTTAATTTTTGGTAATATGGATCGGGTTTTTGTGAAGTGACATCCAAGGTGCT ATCATGTGAACTTTCTGCACTTTTTAATCTACATATCCTTGAGGAGGAGACGCCCTGTGTGGTGGTAACCTTCCCTTTGAAATGTCAAAGTGGTTATATG GCTGTTGCACGACCACATATTTTTTGGATTCTACATTACATTGCAATGCTACATTATGCCTCATTCTCTGTAAGTTGCTTATTTTTCAGATTTCACTGTC TTTGTTTTCCCAGGATATAGAATTTGTGCAGGTTCTGCGTCTCCAGTTCACCGCAGAGGTGCAAATGACCGCCTCGGTTCTGATTACAATCACTTGTCAC GAAGCCGTGGATTTGGCAGTGGGAGAGATCCTGGTAGATATCGAGACCCTTCACCTCCATATATTCGAGGAAGAGTTGGTGGCAGACCAATTGGCAGAGC TTTTGATAGGCCTGGCTTTGTTCCTGGGCCAACTAGAGGAGAGGGCAACAGTAGAAACAATCCCAATGTGCGTCCAAGGGAGGGTGATTGGATTTGTCCT GATCTACGGTGTGGTAATCTTAACTTTGCAAGGAGGGACCACTGTAACAAGTGTAATAGATCTCGACCTGCGCCTGCTGGAAGTCCCCGGAGGGCATATC CTGGTCCTCCACCACTTCGTACCCCTCATAGACGCTTTCCTGGTTCGCCGGAAAGGACTGTGGTTGGCTATAGATCTCCTCCTCGTGGGTTGGCAAGGGA TGGGCCTAGAGAGTATGGATCTGCTGCTCTGCCACCCCTCAGGCATGAAGACAGGTTCGCAGAACCTCATGTGCACAGAGACAGGATTGATTACCTAGAA GATGCCTACAGGGGGAGGAACAAGTTCGATAGGCCACCACCCCCGATGGACTGGGATGGTAGGGACCGTGGACGGGATGTTTTTTCTAATGAAAGGAAAG GATTTGAGAGGAGGCCACTGTCTCCCCCGGCACCACTATTGCCATCACTTCCTCCACACCATGGTGGTCGGTGGACTCAAGATGTGAGAGAGAGGAGCCG CTCTCCAATAAGAGGTGGCCCACCATCGAAAGACCACCGCCGTGATATGTTTGTGAATCGTGGAAGAGATGATAGGCGTGCCTTGGGACGTGATAGAATT GGAGGAATGTATTAGCCTCTGCCCTTTCCTGTAATTTGTGATGTGAACTTTAGCCCCATTAAATGTTGAAGAGATTAGCTCTTGAATCTCCGGATTAGGG TACACTGAAAAATCATTGGTAGTATGTTCATAGCTGCGGATCATATTTAGTCCTTTGTTCTGATCTGTCATACTGTTTGAAAATGGAGAATACACATTTT TTGACTCCACTTCCTGAATCTCCACTCTACATTTAAACTTGTGTTTGGTTGCCAATGTAATTTAGATTATATTCCTGAGAATGTGATACATGAGAAATCA CATTCTAACTTAAAAGATGAGAATCTAAACTTTCATTCCAGGAATGTGAAAATGTTTAAGTCTCTTTTTCAAGGTAGATAGCAAATTAAGCTGCCTTATT CTTCTGTCTCAAGAATTTCAAAGAAAAATGTGATACCATGTCTAAA BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_142188; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_418527
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | TATA-binding protein-associated factor 2N from Homo with 64.29% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019436628.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |