Ll_transcript_418523

• Id Trinity: TRINITY_DN46085_c0_g1_i6
• Name Transcript: Ll_transcript_418523
• Sequence: CCTCGCGGTGCTGAAATCAGAAAAGGGTTCAAAATTTGCATCTAGGGTTTATACATTTATATTCAACACCGTCTTCGACAATTCGGAAAACAAAATCGAA AATTTCTTCTCATTCTTCATACCATCAATGACTTCCAGGGATAACGACCAAGCTCCGCCACACCATCACCCACCTCACTTGAGCAGCCTCGTCGTCCGCC CCGAAGCCACCTCCATCGCCGACACCGCCGCTGATCGTGGCGGCGATTTCGAATCTGGAGAGTTCCACCGTGATCACCGTTCCCCTTATTCCCGCTCCGA TCGATATCCCGGTGACACTGCTCTGATGATGAAGGCATGTTGCTGTAAATTCAACTTTGGATCATGATCCGGGGTTGTTTTTTAGTTAAAATGGGTTAAT AAGTGTGTTGGATGATGGAAATAGTCCATTCTGCATGAACTTGTGAAGTTTTGTACCATGAAATCTGTTGTGTGGGTTCTCATTTTGCAGATTCATGAAA ATATGTTTGATTTGGGTTATTTGTGAAGACGGTGTCATGTTTAATGGAATGTGGAATAGAATCACACTGTACCATGTGAGCAATGCGCTAGAACATCAAT TTGGTCACATAATTTGTTGAGGACAGCGACTGACCATTGCGATTTGATTTTGGTGACTAATCTTACACTATAACCAATGTTTGTTTGATATATTTGGGTT CCACGGGATATATTTAGTTTCCACAGCAAGAAGTTCTTTGTAGCTGGATGAATTGTTACCTTTGCTGATACTGTTCTGACATTACGGAATGGTGACATTT ATTGATGATAAGCTTCATATTATTATCAGTCATCTATGGTTATTTCATATCCAGTTACATGTATATGGTTTTGCTTTGGAATAGTCCTTGTAATATTTTT TGGCTGGTGGTTGTCATTTTAGTTTCGTTGGGTCTTTCTTGTTTGGTTGGTTAATTAGGGATGATTCAGCTGGTTATTTATTTGCAACATGGAAAGAAGC TACTCAGATTAGGATTTCCACGTGGATGTTTAGGAATTTTGTTATCATGTGATTGTGTCTGTTGAATCCTTACAATTTTTCATATTGATGTGCATTACCT GGAGGCATTGATATGGTACAGAGAAGGGATGCATATCTGCTAAAATGAGGGAGTGCACTTCTCCATGTCCAATTTCATTCTCCAATTGCTTTGATGTTAC TTGGGGGGTGTTATTGCCATTGTTCTGCACGGGTTCAGTGGGGTTTATCTGCATGGGCCATTGTTTTGCATGGCTTGCTACAAATTTATGAGCTATGCTG CTCTGTATCTACCTTTGGGTGTCACAACATACAGGGAAGATGGTTGCTAAAAGAGTCAAAGAGGTGTTATGGTGGCAAGATGCCAAACTTTGGGAACCTT CACTCTGCAGTGGTATTTGTTGGTGGTTATTTCTTTGTGGCCTGCTTTCTGTTCTTGTGCCCCTGAATATGATTACTTTATAAAGGGTGAAATGACGCAG GACTATTGTTTGTCATGTCGGATTAGTTTTTTTAGGAGCGTTAGCTTGTACTGTTGACCAGGTTTTGAACTTAGTTCTCACTTTATGCTTCAGCGTATAG GTCCAAAATTTGGATTTAATATTTCAGATGCTTAGGTTAAATGATTTGTGTGTTTAACTATATCCTGGTCTGATATATCATTTGGAGATTGATAGAATTG GGATCAAGGATATAAGGGAGGTAGCTTATGTGTTATGGAAAGCCCTGCCCATAGAACCGGTTTAATTTTTGGTAATATGGATCGGGTTTTTGTGAAGTGA CATCCAAGGTGCTATCATGTGAACTTTCTGCACTTTTTAATCTACATATCCTTGAGGAGGAGACGCCCTGTGTGGTGGTAACCTTCCCTTTGAAATGTCA AAGTGGTTATATGGCTGTTGCACGACCACATATTTTTTGGATTCTACATTACATTGCAATGCTACATTATGCCTCATTCTCTGTAAGTTGCTTATTTTTC AGATTTCACTGTCTTTGTTTTCCCAGGATATAGAATTTGTGCAGGTTCTGCGTCTCCAGTTCACCGCAGAGGTGCAAATGACCGCCTCGGTTCTGATTAC AATCACTTGTCACGAAGCCGTGGATTTGGCAGTGGGAGAGATCCTGGTAGATATCGAGACCCTTCACCTCCATATATTCGAGGAAGAGTTGGTGGCAGAC CAATTGGCAGAGCTTTTGATAGGCCTGGCTTTGTTCCTGGGCCAACTAGAGGAGAGGGCAACAGTAGAAACAATCCCAATGTGCGTCCAAGGGAGGGTGA TTGGATTTGTCCTGATCTACGGTGTGGTAATCTTAACTTTGCAAGGAGGGACCACTGTAACAAGTGTAATAGATCTCGACCTGCGCCTGCTGGAAGTCCC CGGAGGGCATATCCTGGTCCTCCACCACTTCGTACCCCTCATAGACGCTTTCCTGGTTCGCCGGAAAGGACTGTGGTTGGCTATAGATCTCCTCCTCGTG GGTTGGCAAGGGATGGGCCTAGAGAGTATGGATCTGCTGCTCTGCCACCCCTCAGGCATGAAGACAGGTTCGCAGAACCTCATGTGCACAGAGACAGGAT TGATTACCTAGAAGATGCCTACAGGGGGAGGAACAAGTTCGATAGGCCACCACCCCCGATGGACTGGGATGGTAGGGACCGTGGACGGGATGTTTTTTCT AATGAAAGGAAAGGATTTGAGAGGAGGCCACTGTCTCCCCCGGCACCACTATTGCCATCACTTCCTCCACACCATGGTGGTCGGTGGACTCAAGATGTGA GAGAGAGGAGCCGCTCTCCAATAAGAGGTGGCCCACCATCGAAAGACCACCGCCGTGATATGTTTGTGAATCGTGGAAGAGATGATAGGCGTGCCTTGGG ACGTGATAGAATTGGAGGAATGTATTAGCCTCTGCCCTTTCCTGTAATTTGTGATGTGAACTTTAGCCCCATTAAATGTTGAAGAGATTAGCTCTTGAAT CTCCGGATTAGGGTACACTGAAAAATCATTGGTAGTATGTTCATAGCTGCGGATCATATTTAGTCCTTTGTTCTGATCTGTCATACTGTTTGAAAATGGA GAATACACATTTTTTGACTCCACTTCCTGAATCTCCACTCTACATTTAAACTTGTGTTTGGTTGCCAATGTAATTTAGATTATATTCCTGAGAATGTGAT ACATGAGAAATCACATTCTAACTTAAAAGATGAGAATCTAAACTTTCATTCCAGGAATGTGAAAATGTTTAAGTCTCTTTTTCAAGGTAGATAGCAAATT AAGCTGCCTTATTCTTCTGTCTCAAGAATTTCAAAGAAAAATGTGATACCATGTCTAAA
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_142188;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_418523

FPKM

• PAB: 15.1
• PNAB: 6.1
• PS1: 9.3
• PS2: 8
• PS3: 10.3
• PW1: 6.7
• PW2: 7
• PW3: 7.8

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_418523

• Blastp: -
• Blastx: TATA-binding protein-associated factor 2N from Homo with 64.29% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: -
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019436628.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: -