Ll_transcript_418139

• Id Trinity: TRINITY_DN46095_c1_g2_i6
• Name Transcript: Ll_transcript_418139
• Sequence: TCCTAATATAAGGGGGTCACATACACACACAACTATATCACATTGAATCATTTATCAATCAACATTTTTCTCTCTCCTTTTGTTCACTCCAACCTATGAC TAAAGCATAACATAGTTGGAGAGTAACTTCTTCATATCTTCCTCAAAATGAGCCAATGTGTTCCTAGCTGGGATGTTGATGATAACAACCCACCACCTCC TAGACTCTCTCTTCGTTCCAACTCCAACTCCACTGCCACCGATGTTCCCATGTTAGACTATGAAGTTGCTGAGTTGACATGGGAAAATGGACAACCTTCA ATGCATGGCTTAGGATTGTCACGACATCCGGGGAAACCATCCATTACTTCGACGGCTACCACTAACACCGCTTCCAGGTATACATGGGAGAAGCCTCGTG CAAGTGGCACCTTAGAGTCCATAGTAAACCAAGCTACTAACTTACCCCATCATGGCAAATTAATGTTTGACGGTGTTGGTGCTGGTGGTGTCGGCCATGG TGGTGAAGCTTATGGAAACATGTTAGCCCCATGGTTGGCTCCTCACAGTGCTTCTGCAGTGGCTGCTGCCTCAAACACTGTGACCAAGGTCATGGAATCC AATATTCATCATGGTATTGGAGGATGCATGGTAGGCAGCTCTACACATATAAGGCCTCGTACTGGAGCTGCCATTACTACTGCCGACCAAAGTGCCATTT TTGCCGCTACAGCAAAGCGTGACAGGATGACACGAGTGTCGGCAGTAGCTAGCAGGGATCAGAGTGTGAGTGGCAGTGCCACCGTTGGGAGAGACAGTCA GTACCTGACACTAGACACGTGTGATAGGGAATTTGACTTGGGTTTCACTTCCACCTCCATGGGGTCCCCGGAAAACACCAGCTCTGCCAAGCAGTGTACC AAGAACACTGTGGATGACCATGATTCTGTTTGCCATAGTAGACCAATGAGGGAAGATTTAGATGAGGAAGAGAAAAAGAAAGGAATAGGAAAATCATCTG TGTGCACCAAAAGGAGTAGGGCTGCTGCTATACATAACCAATCTGAAAGGAAAAGGAGGGATAAGATCAACCAAAGAATGAAGACATTACAAAAGCTGGT CCCAAATTCCAGCAAGAATGATAAAGCATCAATGTTGGATGAGGTGATAGAATATTTGAAACAATTACAAGCACAATTACAAATGATGAATAGAATCAAC ATGTCATCTATGATGTTACCAATGGCCATGCAACAACAACTTCAAATGTCAATGATGGCTGGTCCAATGGGAATGGGTATGGGGATGGGTATGGGTATGA ACATTCCTGGCATGGATATGAACACAATGAACCGTTCTAATATTCCAGGCATGCCTCCAATACTTCATCCTTCTGCCTTCATGTCGATGCCTTCGTGGGA CGGCGGCGGCGGCGACCGTGTTCAAGGGCCTCCGGCACCGGTGATGCCTGACCCTTCTATGTTCCCATTTTTTGGATGCCAAGCACAGGTGAGCAAATAT TATGATTCCTTTGCTAACATTTAAATTATTTAGTGTTTAAATATTCCAAGAACATCCATAAGAAAATTATTTGTTGTTAATTAAGACTACCGTTCTCTTA TAGTTAAGGAATTAATTTTCTTTTTGGTGCAATATTATCATTTCCAACAAGTATCACTTGTTGGAATTAAATATTTGACATTTAGGCTAAACTATTAGTA TAATATATGAGATCCAATGAAACCTCATACTACTTGATCCACACATCATTAGTATAGGAAAAGTGTTTTAAGGATGTAGTTTAATGATTTAAAATTTTTA TTGAAAAGTATATATTCAAAATTTAAAGCAGTGGTTATAATATTAGTTTTATTTTTTGAGTCTTTAAAAAATAAAATTTGAGAGCTTGTTAGCAAAAAAC AAATACTATAAAACATAAATGTTGTAGAATGAAGGGAGTATACATCTATTCATTATTTTCCTTATATTAACAAAATAATAAACTTTAACTTCACTTCTCT AATAATTTTTTCATGAAATTTTTTCTTAATAAAATTTAGAGAAGGCTAATGAGTGCTAATAGAATTATTTAAAGTTTTAAAAAATAAAACTATATCTTGA AATTGATGTACTTGAAATCTAAAAATATTGAAGTTATAACTTTCAATCCAATTTTTTTTATAATCCTTAACAATATATTGAGAAACTCATTATTGGGCCA ATAAATTTTAACCTTTGTATTTTTTTAACTCTATGTTATTTGAGATAAGGGTGGAGATGTTCAAATTTCTTATAATTATGATAGAAAGCAACTTGATTTA TTAATGCTGTTTTGGTAGGGACTGAATTTAAGAAGCAGTATTGATAAGGTTATAGAAACCAGTCAAATCAAATTCATTGTGTTTTGTTTTGTTAGAAAAC CAATGACAAGATTAATTGATTAATATTTGTATCTAGTTTTATACCATGTCACTGTTTAAACTCCAAAGCTGTAATGGAAAGAGAGTAATCCTTATGAGGT TCCAAATAATTCCACCAAAATTTATCCAAATATTGGTTTAAAATGTTCTCATCCTTGTTAATAAAACATTGATAAAATGATATAAGGCTTGAGAAGATCT CTAAAAATACCAAAAGATTAAGGGTTTGATTATTGAGAACGATATTTATTGGGAAAGACAGCTACACATCCGAAAAAGATTAGTTCATTATTTATTAGGT GATAAAATATTTTGGTATTACAAAAAAAATGTTCCCATCCCTTAATTAATTAAACAAGATACAACACTTTCACTTATGGGTCTGCATGGATGTAAACCAA TTAGAATACATTTATTTTACATTTTGAAACAACTTTTTGGTATGCCATTTTAAACCTATTTGTGTTTCCCTTCTAATATTTATATTTGATTAAAATATTA TTATTTGCATGAAGCCCATGAACATGGATGCCTATAGTAGGATTGCTGCCATGTATCAACAGATGCACCAACCTCCACCTTCTGGTTCTAAGAACTGAGC AGCTTGGAATTATTCTACTGTTGTGGCAGTGATTTTCAGCTTCAACATGAGTATGGACATTTATTCTTAGTCAAGAGGTTGTGAAATTGATGAATAACAA GACTAATGAGCATTTTATTTCATGTGAGAAGTATGTATACTAATTTCCAACTCAAGTAATGAGAAAAATTGAATATATATTTATTTTTTTCTTGAGGTGA GCAAGATGTTGAAATTTGG
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_142219;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_418139

FPKM

• PAB: 2.1
• PNAB: 1
• PS1: 0.1
• PS2: 0
• PS3: 0.1
• PW1: 2.5
• PW2: 3.7
• PW3: 4.8

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_418139

• Blastp: Transcription factor UNE10 from Arabidopsis with 43.91% of identity
• Blastx: Transcription factor UNE10 from Arabidopsis with 42.17% of identity
• Eggnog: Transcription factor(ENOG4111B0G)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT4G00050)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019414021.1)
• Pfam: Helix-loop-helix DNA-binding domain (PF00010.25)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;