Ll_transcript_417861

• Id Trinity: TRINITY_DN46099_c0_g1_i5
• Name Transcript: Ll_transcript_417861
• Sequence: TCGAATCCATCGGAAACTTCTTCACCGGCGGCGAACAGATCCCTTGGTGCGACGGCGATGTCATCGCTGTAACCAATTTCCCTTTAATTTTCCCTTTCTT TCTTCCATCAATATTCAAATATCTGTTTTTTCTTTCTAATTCTGTTGTTTTCTATATTTTCTAAAACCCTAGTTTTGTGCTTAGAAATTATAAAACCTTG AGGTTCATAATTTCTATTGAATCGTGATAGGGAATTGAAATTTAAGCATTTAATCAATCAATCGAGTGTATTTGTTTGACGTTAAGCTTTCTTTCATGGA ATGCATTAAATTGATATTATAATGTTAACATAATCTCAAGCTCGCTGTGATTTTTATACACGATCAACCACCAGTGAATTTCATAACAAGGATATATTCA ATTTTAAATTGTGGTTTGAATGATAGAAATGATATTTGGAAACAGGGTCAGCCGTGAGGGTGTGGGTGTGCACAGCACGGGCCCATAATTAATGATAGAT ATGATATTTGTAATGATCATTGTTTTATATTATCATGTGGTTGATGTATAATAAAATAAGGGTCTGACCTAAAGTGATAAAAATATGGAATTGTTTAAAG CTCATTAAGAAAATGACCTCGTAAAAATATATTGGACTCAAGTCCTCATTAAGTAACAATAATTGAACTCGAATAGTAAGTTTATATTACGATCTCAATT CTTATGATTTGATAGATCTTATTATAAAAATATTACATAATTAAATTATTTGATATACAATGAGCGTTCATTTTTATTTTGTTATCGCAATATGTTTTTT AGTCCTCAATTTTGGTCGAACTTTGATATTCAAGCTTTATATAGTTAAATTAGGGGCCCCAATTTTTTCTCACACTGGGCCTACAAAATGTTAGGACTGG CACTATTGGGAATGAGAATATCTTTATATTAACTTTACCCAAGTTGATATATTAGCTTGATTGCATTGATCCATGGGGTTTAGTTTAATTATACTTGGCA TTCCTCTTGTTTCAATAGCTATACTCAGTTACTCACCACTCTTTAAGAGAGTTGAGGAATTTCGATCACTTTTCCTCTCAGTGAGTAAGTGTAATGAGAA GTGAATCTCCAGTGAGGTGACCATAGCTTCTGGAAAAAGAGGGTGCCAAGAGGTCAGTGTAATTTCCACTTTTTTTGTGGTTTTTTTGCTATTTGCATTT AGGGAACCATTTGTCAACCACATTTAGGAGAAAAACTTGCAAGTTGAGAGAAAGTAGTGAGGAAATCACAATTGCTTATCTGGGTTATGAGTCATTGCAA TAATGGTCGCTGTGATGATTGGGAAAAATTCACTGTTTAAATGCTTACCATGTGTTGGCTATTGTGTTTGCTGTGATTTAATGGCTTGTTTTCAGTCTAA ACTATATTGCATGTATTGAAGGGCTGTGAGAGAGAAGTTGCTGAGGCTTCTAATGGTGACTCCGAGGAACGGAAGAATGAGAGCATAATGAGGTTGTCGT GGGCGCTTGTTCATTCAAGGAAGAAGGAAGATGTTCAGCGCGGGATAGCCATGCTTGAAACTTCTTTGGGCAATGATAAAAGTCCTTTGCATCAAAGAGA GAAGATTTATCTTCTGGCTGTTGGATATTACAGGAGTAATGATTACGGTAGGAGTCGGGAGCTCTTGGGACAATGTTTGGAGGTTGCACCTGATTGGAGG CAGGCACAGTCCCTCAACAAAATAGTCGAAGATCGAATTGCTAAAGATGGTGTTATAGGAATCGGCATCACTGCAACAGGTGTGGCACTCATAGTTGGTG GCATTGCTGCAGCTTTGGCCCGGAAAAACTGAGTCTTAACAACATCTTGTTTATCCTCTTGTTTTCTTTGCTTTCTTCTTGAAACTTGTTAAGATCAATG GAAAATAAACCTCTGTTGAAGACTACAGCTTTTGATGTCTGAATTTGTTAAAAGGAGCATTTTACTGAAGAGCTAATTTCAAATTTCCATGGTGCCAATC ACATTTTAACTTGAATGGCAGTAACTTTAAGTCATTGGATGTGTAAATCATTCGTTAAATTTGGTGTGCACTGAGAAAATCTATATGAATGCGAACCTAT AGAACTGCTTTTGTATGTTATAAGTCATGCATTCTGTCATTTAGAAGCCAAATCTTTATTTCTTTCCCTGTTTCAGGGCAGCCTGGGTTTGATACATGCA TCCTTTGTTCAGATTTAAGACAAATGCAAACCCAGGTTAGTTTGTTGTTGAATGGGGTATGCCGGCTAATCACTACTAGCCTTCAACATTTCTGTTTTGT TTTGTAAGTGTCTGTTTGCGAGTTGGTTTTTTGAGGACAACTGATGGGAGGG
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_142250;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_417861

FPKM

• PAB: 0.7
• PNAB: 0.2
• PS1: 0.3
• PS2: 0.3
• PS3: 0.1
• PW1: 0.2
• PW2: 0.3
• PW3: 0.2

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_417861

• Blastp: Mitochondrial fission 1 protein A from Arabidopsis with 66.67% of identity
• Blastx: Mitochondrial fission 1 protein A from Arabidopsis with 62.5% of identity
• Eggnog: fission 1(ENOG4111PPH)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT3G57090)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019437054.1)
• Pfam: Fis1 N-terminal tetratricopeptide repeat (PF14852.5)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;