Id Trinity | TRINITY_DN46134_c1_g1_i3 |
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Name Transcript | Ll_transcript_281894 |
Sequence | GTTAATGACCTAAATAACCTTTGAATGTGTGTTTTGTGAGAGAGGAAGGGGTTGGAATGTTAATGACCTAAATAACCTTTGAATGTGTGTTTTGTGAGAG AGGAAGGGGTTGGAATGTTAATGACCTAAATAACCTTTGTTGAGATTGTCGAGCGAACAGAAAAAACAAAACCCTCACATCACAGTGTTTCGATGGAGCT CTGAATTCATTGATTCATTTCATATTCAATTCATACGCTGATGGCTCACAATCAGATTCAGAATCAAAATCCTCATCTTCACCTCAAGGATTTGGGATCC AAGCTCCACACTCTTCCCTCTTCTAAGGACTCTCTCATCAAGCTTTTGAAGCAAGCATCCACATGCCTGACAGAACTGGATCAGTCACCTTCAGCTTCAA TATTGGATCCAATTAGGCCCTTTTTTAATGCAATTGTTAAGCCTGAGTTGCTGAAGCATCAAGACAGGGATGTCAAGCTTCTGGTTGCAACATGTATTAG TGAGATAACTCGGATTACTGCCCCGGAAGCTCCTTATAGTGATGATGTTCTAAAGGATACTTTTCAATTAATTGTGAGCACTTTCAGTGGGCTAAGTGAT ACCAATGGTCCATCTTTTGGCCGGAGAGTTTTTATATTGGAGACTCTTGCAAAATATAGGTCATGTGTTGTAATGTTGGACCTTGAATGTGATGATCTGG TGAATGAGATGTTCAGTACTTTCTTTGTTGTTGCCAGAGATGATCATAGAGAAAGTGTTCTATCATCTATGCAAACTATAATGACGGTTCTCTTAGAAGA GAGCGAGGATGTCCGTGAGGATCTTTTGTATATTCTACTGTCTAAACTAGGTCGTGAAAAAAAGGGTGTTACTATGGCTGCAAGGAGGCTTGCTATGAAT 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Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_142421; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_281894
Blastp | Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B from Homo with 25.31% of identity |
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Blastx | Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B from Homo with 25.02% of identity |
Eggnog | PDS5, regulator of cohesion maintenance, homolog(ENOG410XQW7) |
Kegg | Link to kegg annotations (23047) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019463685.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |