Ll_transcript_282453

• Id Trinity: TRINITY_DN46142_c4_g1_i1
• Name Transcript: Ll_transcript_282453
• Sequence: GCCTTACTTAAAAATTAAAAATAAAGCAAAGGTGTTAACATAAGTTTTCACTTAACAAAATAAATGACGAGAAGGAAATATTATAGAAATTGGTGGAAGC GGAATTTCTAGAAGAATCGGTCGTCGTGCATAAGAAGAGGATTTCGCTATTTAAAAACCCAATTTCTCTTTTCATCTTCTTCAATTCAATCTTTTACCGC AAAACCAAAACCCTAGCTTTCTCTGTTATTGTACACCAAGGTTTCAACATAATGGCTACACCTTTGATGGCAGGACTTGCTGTAGCGGCTGCTGCTTATG CCGGTAGGTATGGTATCCAGGCTTGGCAAGCATTCAAGGCAAGACCACCTACTATGCGTAAATTTTACGAAGGTGGTTTCCAGCCTACCATGACTAGGAG GGAGGCAGCTCTCATACTCGGTGTTAGGTATTGAAATTTTTGTTTGAGGATTCTGGTATGTTTGATTTTGTATACTCATTGACGTTTTTTGTATGAAGAT TCTAATATATTTGATGTGTAGACTCATTGTGATTAAAACTTGAAAAAGGAAAGGAAAAATCTAGACATTAAATTGTCGTTAATGATAAGCTGAAGCTTTT TCTTTCAATTGAATATATTTATTGTATTTCTTAATTTGAAATGTTGCTCTTTCTCCTGATATCTCTACAATCCTCAAGATAGTAATGCCCGATACATAAT GAAACTTAAGGCTCTTAATGTTAAAAATTAAACGTCAAAATATCAGTCCTAATCATTTATTCGGCCTAGGCTGAGTTGCAATGATATAAGTTATAGGGAA TTCTAAGGACTACTGCAACCATAATGCAGGTGTGCATTACATGTCTTTCATTAATTATTTAAGGACCACGGGGCATATAACCAAGGTTGTCAAGTTTGAG GCATAAGACCAAAAAATGCAGTTAGACACATAAAATGTGAGATTGTAACATGGACTTGTAAGGTCATATACCTATAATAATATAAATTATGTTTCTTGAT CTACTAGTTGAAAGGACTAACTTATTGCAAACTTAAAATATGCTATTAGTCCACATTTAAAGATTTCATCAAGCTATTAAAGAAACCCCGTATATCAGCC CAAGGCTGCATCTAAAACTAAACAACTAAACTGTGCATTTTATAAGAAGCTATTAGGTTTTTCTATGCTTCCTCCACCTCTATTGCAGTGCCGCTCATGC TTATGCAGTTCTTCCTCGTAATTTCTCTGTTCCTTGTCTTTGTCCTTTGACTATGGAGTTCCATATAATTCAGCACAGCTCACATTTTCTGATGCTATCC GTCCTTGCTTCTGCTTTTGTTAAATGCTTGGGTCCAATTGTTACTTCTTTCACCAAATTCCAAAATGCAGAATGTGTTCTATGTCCAATTGAGGAGATAA GCAGAACCAGTTCTGCAGTTAAAGTTCAGTGATGGTTGTACATTTTTTTCCTAACATTTCCAGTTTTCCCATGTGATTCCATTGTTCCTGTAATCTGCAG ACTGTAGTTCTACACTGTGTACTGTTTTCTGTTCCAGTGATGTTATTTATTAAGGACCATTGTCAAAACTGTCCATGCAATGAAGGGGGCATGGCTTCTA CAAGCTCCAAAATGCCGAGCCAACACCCTTTATATTTCCTAGTAACAAATCTTTCGTGTCATTAATCTTTGATGCCGGGTAATGACTACCCTCCTGTGAG CTTCTTTGATTTTATCTGTTGGAGTGCACTCTCTGCAATAATCGCAATTGAAAATCAAAACAAGGAAAAAAGGACCGTAAATAAGCACACAAAAAATCCT GTACGAATCTTGATATGCCATATGATATCATATTCTTAAATATGATAGGACATTATGTATATGCCATATCATATTCCATTTTTTTACTTGACTGCATTTG AGTTTTATTGCATTGTTATTGCATCCCATCTCCATGCTTCATAAGAGATTATGGTTCATGATTGTGAAATTATGTTACTATTGATAATATTCACCTTTCT GTTCTGTATTAGTATCGACATTCACACATACATGGTGGGTTTTTGCTTATCACCTGCATTGTGTCTTTCTTTGATTATATTTTCATTTCATCTTGTATCT AATGGATCATTATTAATATATATTTTTTGTTCTTAGACGTCCAACAAATATTTTACCAAATGTTTTCTTTTTGCATTTAATTTTTCTGTTGATTTTTTTG ACACTATGCAGAGAGCGGACTCCAACTGATAAAATCAAAGAAGCTCACAGAAGGGTGATGATTGCAAACCATCCTGATGCCGGTGGCAGTCATTACCTGG CATCAAAAATTAATGAAGCAAAAGACATGTTAGTAGGAAAGACAAAGGGTAGTGGCTCAGCATTTTGAAACTTATACTTGGCCATATCGCCGAATGTATC GACAGTTTTGACATTGATTCTTATCAAGTAAAACCATGAATGTTTTGGTCTTCTACCAATTATTTCTTGTAGACTTGATCACATTGTGAGAAAATTAGAC ATGCTTATGAATTTATCTATATGCTACAGCTCTGTTGTTGTAACTTGGGTTTATCAATTATTGTGCTTGTACCAAAAAAACAGAATTGTACCAAAAAAAC TTGGGTTTATCAATTATTGTGCCCACTACGACATAATTGAGTCTATACCTTATCCAAAAGTGCAAAATAGAAATTTATGATGTTTGCTTGCTTTTAAACA GATGGGAATTTCGGTTATTAATGTACTGGTTTTAGTTTATTTGTATGGCAAAACTCAC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_142496;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_282453

FPKM

• PAB: 2.9
• PNAB: 1.3
• PS1: 0.5
• PS2: 0.6
• PS3: 0.7
• PW1: 0.3
• PW2: 0.4
• PW3: 0.8

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_282453

• Blastp: -
• Blastx: Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM14-2 from Arabidopsis with 79.25% of identity
• Eggnog: DNAj domain protein(COG2214)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT3G09700)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019459165.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;