| Id Trinity | TRINITY_DN46143_c0_g1_i1 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_281670 |
| Sequence | GCCGGTTGCCAGTGCCCGCGGCCTCTTCCAGATGCCCCCACCTCGCCTTTCTAACCGGTAATCACTTATTATTCGTTTTCGAGTTGAGTTTTGGAGATAA AAGAATGTTAAAGGAAAGCTTCAGAGTCGTGAAATACAGTTATGAGATGACACTGAAGTCTTCCATTCTTTCTCTTCCAAAACTCGTTAAAATGAGCTTA TAAAAATGTCATAAACTGTTATATTAATTCCTGTGGTAAGTTTATTTGTACAAGTTATTTCCTTAAATCCAAATAACTTCACTGAAGTAAAGTATTGTCA CAAGTCCAAACAAACTGTTTAATTGTAACCTTGTAATGTTCTTGATAATAACATTATCCCTAGTCATGTTTTCTTAGCATGTATGTATATCTTAGTTTGA GCATATAAGCATTGTTGTTAACTAGGTGGTGTGCTTGGTGAGTAGAAATCTTCTATACCACTAATTTGTATCACTCTCTTTGTCATGAGTTGACTGTATT GCATAGATGGCAAAGAGAGTGGTGCAAATATATTGGTATAGAAAATTTCTGTTCATGTTTGGTGGGGACTGGACAGGTATTTTATGGTCAGGGCTGGGGA GTCAGAGTTTGAAAGCATGGGAGTGATAAATACAAATCCAGTGGCCAAGACTTCGGTGGATAACGGGTTATCCGAGAGAGGGAAGAAGCAGGCGATAAGA GCAGCATTTGATTTGAAAGAAATGGGTGCCTGTGATAAGAGCTGTTGGATCTGGCCTGCTATCACTCAAAGAGCTTACCAGACTGCTGAGATTATTGCAG CTGTTAATGCAGTTCCTCGAAGGTTTCATCCACTTTTCTCTCTTGATCTTATAAAATTCCTGTTGGTATTTCAAATATTCATTTTTCACAATGGCTTCAT TGTTGTAATCTAGCACAATAAAAATTCCTACCTAAAATTTTTGTTGGGTTTGGTCTTATCTTAGGGACAAGCTATGCACTCCAATTCCCAAAATCTGAGC ATATATTTGTCAATTTCTTTGATTTCAGTTATATAGTCCCAGAATATAGCTTTCTGGACGCCCGTGGATTAGGTGCTTATGAAGGAAAAAACTTGGAATC TGTTTCAGAAGTAGGATATCTCTCTCTGTTGTTCTCTTTTAGACTTCAGCTATATTATATACCTTGGCTAAATTGCATGATTATTTTCTCTAGGTTTAAC CCTCTCCTTTAATGACATCAACAAAACATTGGTATCACCTTATCAAACAAGATAGATTCTTAGTTGTTCTCCAAGTAGGAGAACGTTTTTACTATGTACC AATTCAACAACGTTAAAAAAGTTATAAATCCTATCAATTTGTCACAACTTATATTCCCTAGTTTTGGTGAGCACCTCACAGCTTTGTGAAATTTGTACAA CAATGTTATGACTTAAGAATGTCTCTGAGCGAGGGAAATTTGCTACAGATATATGCATCAGATGTTATATCTCCAAACACTAAACCTCCTCCCATTGATG ATGGAACACCAAATGAGAGTGTTGCAGATGTTTTTGTTCGCATAACACAACTCATGTCAATCCTTGAAACTCAGTACTCCGGTGACACAGTTGTTATAGT CTCACCAGATTCTGACAATTTGACAATCCTTCAGGCTGGTTTGATAGGACTGGACTTGCGAAGGTAACTGGTTATAATGTTTAATAATTGCGTATGATTT TGATTATGGCTCCAATTTGAAAATTCATGTTGTTCCATTGGTTACTAGATTATTATTCTGTTATAATTTCAGGCATATGGATCTGTCTTTTGCACCCGGT GAAGTCCGCTTCGTTGACAAAAATGACATTCCTACTTACAAGCAGCCAGCATCTGCTATATATAAATGTTTCAACCCACCGAGTTGTAACTAGTGATTTT CTAAGCTATAGCAGAACAATTGATATTGATGAATGGTTCAAGTTGTTACTACATCTTCTGTTTCATTGTATATTCTTGTCATGTTTTATAAAAAATGAAA ATCTTGTAAAAAGGAACTGCCTAAACTATTCATGGAATGATACTAGTATAAAAAAACTTGAGATGAACTTGAGCTAAACACCAAGGAGTAAATTATGTGT GCATGTAATTTAATGTTTCATGGAAGGAAAATAGTAAACAGATATTCATCTTGAGTGAAACCTTGAAAGCATATTTCCCCCTCTCTTTCTGGGTTGTATC AGATTCGTTTACAGCAAGCAAAATCACCCAAAATATCAAAATTCTATATACTCTGATGGTTAACTAGTCTACTATACAAATGGGAAATATATATGCTGGA GAATAATGATTAATTTGGTCCTCCATCATGGTTAATACATAATGGAGAGTTAAGTAACAACTGGGCTAGTGACATAAAGATTCACTAGATTTTAGAAAGA CGAAAAGTTAAAATTCTATGTGAAAGTGTTGTTAGTGCACAATTGTCTAACCAGGAAAAAAATGATAAATACTTAGTTTTACTAAAATTGATTTTAATAA AACCCCAATAGGATAGTTTGGATTTTATTGACATTCCGAAAGCCACTAATTAAGACATCAAGTAGAACCCACGGCTTATTAAATGATACTTGTGATTGAA ATGGTGTTACTTTATATTAATGTTAAAACATACTTCAAACTTATACTTATGATTTTGAATTCCATGACTATGCATATCAGTTTCAACTTGAAGATGCTAT TGAAATGGAAGACTCTCTGCAAGGTTGAAAACTGCTATAACAGAAGCAACATCCACAGAGAATGTTGCTGAAATTATGTCACTATTGAAGAACGCCATAG ACGAGGAACGATACCATGATGCTTCAAGATTATGCAGACACACCAGCGGTGGACTGGTAGTATTATCCTGGAATCTGGTGCCATACACATTCATCTTAAA ATTACTCCAAATAGATCAGAATGGTTTATTCCCCTCTGCCCATTCCAGCCGCAGTATTGATAAATTATGCCGTTCTTGACAACTAATTGGCCCATGCTTC ATTTGACTTAGGTTTCAAAAAATGTATGTGAAATGGTCAAACATGCGATCAATGAAGCACAGAAAAGAAGTAGATTATCTGAGTATACATCTTTTAGCCG GATTACCAGTTCAAGAGGGGATTTAGATCCTTTTGATGGACTCTATGTTGATGCATTTGGCCTTTATGGTGCTGACGTAGTTCAATTGAAGTGGAAATTT GGACACTGGAATGATATGGATAGTGAAAAGAATCCTTCAGATGTAGAGTTCATTGAATATGTAGAGGCAGTGAAGTTGACAGGTGACTTTTCATGCTAGA ATTGAGAGAAGCAATTGCAAGGCAAACCTTGGGAGGCATCCCAATGAACTGGGAGTGGATGCATGCTATAAATGGGTTATCAGAATTCAAAATGGGTTGA TGGTGAATTACTTGTACTTAATGGCAAGGGCATTGGACATCATATGAAAGGTGCAGATATTGGTTTCCTTTATATTGTGCCTGATCAAAGTTTTATTGTG CTATTCAACCGGTTGAAACTACCAGAGTGAGCCATAGTTCCCTAATCCAGTCTAATTATTTATCACATTATTTAGAGTGATAGTTTTACCCAAATGCAGC CCTTGTATTTATCTATTTATAATAGAGCATTATGAACATCACTCGATACATATAGCCGTCCCTATTCAGTGGAATTAAGGCTTGATTGTTGTTATTTTAT AAATTTTTCTACCTTCTTCAATCCTTTâBLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_142505; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_281670
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Protein EXECUTER 2, chloroplastic from Arabidopsis with 51.6% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019464075.1) |
| Pfam | Histidine phosphatase superfamily (branch 1) (PF00300.21) |
| Rfam | - |
| GO | - |