Id Trinity | TRINITY_DN46143_c0_g1_i11 |
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Name Transcript | Ll_transcript_281694 |
Sequence | GCCGGTTGCCAGTGCCCGCGGCCTCTTCCAGATGCCCCCACCTCGCCTTTCTAACCGGTAATCACTTATTATTCGTTTTCGAGTTGAGTTTTGGAGATAA AAGAATGTTAAAGGAAAGCTTCAGAGTCGTGAAATACAGTTATGAGATGACACTGAAGTCTTCCATTCTTTCTCTTCCAAAACTCGTTAAAATGAGCTTA TAAAAATGTCATAAACTGTTATATTAATTCCTGTGGTAAGTTTATTTGTACAAGTTATTTCCTTAAATCCAAATAACTTCACTGAAGTAAAGTATTGTCA CAAGTCCAAACAAACTGTTTAATTGTAACCTTGTAATGTTCTTGATAATAACATTATCCCTAGTCATGTTTTCTTAGCATGTATGTATATCTTAGTTTGA GCATATAAGCATTGTTGTTAACTAGGTGGTGTGCTTGGTGAGTAGAAATCTTCTATACCACTAATTTGTATCACTCTCTTTGTCATGAGTTGACTGTATT GCATAGATGGCAAAGAGAGTGGTGCAAATATATTGGTATAGAAAATTTCTGTTCATGTTTGGTGGGGACTGGACAGGTATTTTATGGTCAGGGCTGGGGA GTCAGAGTTTGAAAGCATGGGAGTGATAAATACAAATCCAGTGGCCAAGACTTCGGTGGATAACGGGTTATCCGAGAGAGGGAAGAAGCAGGCGATAAGA GCAGCATTTGATTTGAAAGAAATGGGTGCCTGTGATAAGAGCTGTTGGATCTGGCCTGCTATCACTCAAAGAGCTTACCAGACTGCTGAGATTATTGCAG CTGTTAATGCAGTTCCTCGAAGGTTTCATCCACTTTTCTCTCTTGATCTTATAAAATTCCTGTTGGTATTTCAAATATTCATTTTTCACAATGGCTTCAT TGTTGTAATCTAGCACAATAAAAATTCCTACCTAAAATTTTTGTTGGGTTTGGTCTTATCTTAGGGACAAGCTATGCACTCCAATTCCCAAAATCTGAGC ATATATTTGTCAATTTCTTTGATTTCAGTTATATAGTCCCAGAATATAGCTTTCTGGACGCCCGTGGATTAGGTGCTTATGAAGGAAAAAACTTGGAATC TGTTTCAGAAGTAGGATATCTCTCTCTGTTGTTCTCTTTTAGACTTCAGCTATATTATATACCTTGGCTAAATTGCATGATTATTTTCTCTAGGTTTAAC CCTCTCCTTTAATGACATCAACAAAACATTGGTATCACCTTATCAAACAAGATAGATTCTTAGTTGTTCTCCAAGTAGGAGAACGTTTTTACTATGTACC AATTCAACAACGTTAAAAAAGTTATAAATCCTATCAATTTGTCACAACTTATATTCCCTAGTTTTGGTGAGCACCTCACAGCTTTGTGAAATTTGTACAA CAATGTTATGACTTAAGAATGTCTCTGAGCGAGGGAAATTTGCTACAGATATATGCATCAGATGTTATATCTCCAAACACTAAACCTCCTCCCATTGATG ATGGAACACCAAATGAGAGTGTTGCAGATGTTTTTGTTCGCATAACACAACTCATGTCAATCCTTGAAACTCAGTACTCCGGTGACACAGTTGTTATAGT CTCACCAGATTCTGACAATTTGACAATCCTTCAGGCTGGTTTGATAGGACTGGACTTGCGAAGGTAACTGGTTATAATGTTTAATAATTGCGTATGATTT TGATTATGGCTCCAATTTGAAAATTCATGTTGTTCCATTGGTTACTAGATTATTATTCTGTTATAATTTCAGGCATATGGATCTGTCTTTTGCACCCGGT GAAGTCCGCTTCGTTGACAAAAATGACATTCCTACTTACAAGCAGCCAGCATCTGCTATATATAAATGTTTCAACCCACCGAGTTGTAACTAGTGATTTT CTAAGCTATAGCAGAACAATTGATATTGATGAATGGTTCAAGTTGTTACTACATCTTCTGTTTCATTGTATATTCTTGTCATGTTTTATAAAAAATGAAA ATCTTGTAAAAAGGAACTGCCTAAACTATTCATGGAATGATACTAGTATAAAAAAACTTGAGATGAACTTGAGCTAAACACCAAGGAGTAAATTATGTGT GCATGTAATTTAATGTTTCATGGAAGGAAAATAGTAAACAGATATTCATCTTGAGTGAAACCTTGAAAGCATATTTCCCCCTCTCTTTCTGGGTTGTATC AGATTCGTTTACAGCAAGCAAAATCACCCAAAATATCAAAATTCTATATACTCTGATGGTTAACTAGTCTACTATACAAATGGGAAATATATATGCTGGA GAATAATGATTAATTTGGTCCTCCATCATGGTTAATACATAATGGAGAGTTAAGTAACAACTGGGCTAGTGACATAAAGATTCACTAGATTTTAGAAAGA CGAAAAGTTAAAATTCTATGTGAAAGTGTTGTTAGTGCACAATTGTCTAACCAGGAAAAAAATGATAAATACTTAGTTTTACTAAAATTGATTTTAATAA AACCCCAATAGGATAGTTTGGATTTTATTGACATTCCGAAAGCCACTAATTAAGACATCAAGTAGAACCCACGGCTTATTAAATGATACTTGTGATTGAA ATGGTGTTACTTTATATTAATGTTAAAACATACTTCAAACTTATACTTATGATTTTGAATTCCATGACTATGCATATCAGTTTCAACTTGAAGATGCTAT TGAAATGGAAGACTCTCTGCAAGGTTGAAAACTGCTATAACAGAAGCAACATCCACAGAGAATGTTGCTGAAATTATGTCACTATTGAAGAACGCCATAG ACGAGGAACGATACCATGATGCTTCAAGATTATGCAGACACACCAGCGGTGGACTGGTTTCAAAAAATGTATGTGAAATGGTCAAACATGCGATCAATGA AGCACAGAAAAGAAGTAGATTATCTGAGTATACATCTTTTAGCCGGATTACCAGTTCAAGAGGGGATTTAGATCCTTTTGATGGACTCTATGTTGATGCA TTTGGCCTTTATGGTGCTGACGTAGTTCAATTGAAGTGGAAATTTGGACACTGGAATGATATGGATAGTGAAAAGAATCCTTCAGATGTAGAGTTCATTG AATATGTAGAGGCAGTGAAGTTGACAGGTGACTTTTCATGCTAGAATTGAGAGAAGCAATTGCAAGGCAAACCTTGGGAGGCATCCCAATGAACTGGGAG TGGATGCATGCTATAAATGGGTTATCAGAATTCAAAATGGGTTGATGGTGAATTACTTGTACTTAATGGCAAGGGCATTGGACATCATATGAAAGGTGCA GATATTGGTTTCCTTTATATTGTGCCTGATCAAAGTTTTATTGTGCTATTCAACCGGTTGAAACTACCAGAGTGAGCCATAGTTCCCTAATCCAGTCTAA TTATTTATCACATTATTTAGAGTGATAGTTTTACCCAAATGCAGCCCTTGTATTTATCTATTTATAATAGAGCATTATGAACATCACTCGATACATATAG CCGTCCCTATTCAGTGGAATTAAGGCTTGATTGTTGTTATTTTATAAATTTTTCTACCTTCTTCAATCCTTT BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_142505; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_281694
Blastp | Protein EXECUTER 2, chloroplastic from Arabidopsis with 64.13% of identity |
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Blastx | Protein EXECUTER 2, chloroplastic from Arabidopsis with 51.6% of identity |
Eggnog | protein EXECUTER 1, chloroplastic-like(ENOG410ZHAF) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT1G27510) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019464075.1) |
Pfam | Domain of unknown function (DUF3506) (PF12014.7) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |