| Id Trinity | TRINITY_DN46143_c0_g1_i3 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_281675 |
| Sequence | TTAAATTCTATTTTTTAATAGTGTGCAGAAGTTCTGGAAAAAACATCTCTTTCCAGCATCGTCCTTTGCGGAGGATATACGATGATAACTGATAAGGTTG TAATAAACCACCGCCATTAAAAATGCGAGTGGTAAGAAAATGTTAGCACCAAATCATACGCATCAAACCCTTCCTCTGCCACCACAGCAACCGCCGTGTC TTCCTCCCAACCTCCTCCGTCGCCACCTCCTCACTAGTACTACAGCACTCACCATCTCCTTCAATTTCAATGTCTCTTTTACATCCATTTCAGAGCCGGT TGCCAGTGCCCGCGGCCTCTTCCAGATGCCCCCACCTCGCCTTTCTAACCGGTATTTTATGGTCAGGGCTGGGGAGTCAGAGTTTGAAAGCATGGGAGTG ATAAATACAAATCCAGTGGCCAAGACTTCGGTGGATAACGGGTTATCCGAGAGAGGGAAGAAGCAGGCGATAAGAGCAGCATTTGATTTGAAAGAAATGG GTGCCTGTGATAAGAGCTGTTGGATCTGGCCTGCTATCACTCAAAGAGCTTACCAGACTGCTGAGATTATTGCAGCTGTTAATGCAGTTCCTCGAAGGTT TCATCCACTTTTCTCTCTTGATCTTATAAAATTCCTGTTGGTATTTCAAATATTCATTTTTCACAATGGCTTCATTGTTGTAATCTAGCACAATAAAAAT TCCTACCTAAAATTTTTGTTGGGTTTGGTCTTATCTTAGGGACAAGCTATGCACTCCAATTCCCAAAATCTGAGCATATATTTGTCAATTTCTTTGATTT CAGTTATATAGTCCCAGAATATAGCTTTCTGGACGCCCGTGGATTAGGTGCTTATGAAGGAAAAAACTTGGAATCTGTTTCAGAAGTAGGATATCTCTCT CTGTTGTTCTCTTTTAGACTTCAGCTATATTATATACCTTGGCTAAATTGCATGATTATTTTCTCTAGGTTTAACCCTCTCCTTTAATGACATCAACAAA ACATTGGTATCACCTTATCAAACAAGATAGATTCTTAGTTGTTCTCCAAGTAGGAGAACGTTTTTACTATGTACCAATTCAACAACGTTAAAAAAGTTAT AAATCCTATCAATTTGTCACAACTTATATTCCCTAGTTTTGGTGAGCACCTCACAGCTTTGTGAAATTTGTACAACAATGTTATGACTTAAGAATGTCTC TGAGCGAGGGAAATTTGCTACAGATATATGCATCAGATGTTATATCTCCAAACACTAAACCTCCTCCCATTGATGATGGAACACCAAATGAGAGTGTTGC AGATGTTTTTGTTCGCATAACACAACTCATGTCAATCCTTGAAACTCAGTACTCCGGTGACACAGTTGTTATAGTCTCACCAGATTCTGACAATTTGACA ATCCTTCAGGCTGGTTTGATAGGACTGGACTTGCGAAGGTAACTGGTTATAATGTTTAATAATTGCGTATGATTTTGATTATGGCTCCAATTTGAAAATT CATGTTGTTCCATTGGTTACTAGATTATTATTCTGTTATAATTTCAGGCATATGGATCTGTCTTTTGCACCCGGTGAAGTCCGCTTCGTTGACAAAAATG ACATTCCTACTTACAAGCAGCCAGCATCTGCTATATATAAATGTTTCAACCCACCGAGTTGTAACTAGTGATTTTCTAAGCTATAGCAGAACAATTGATA TTGATGAATGGTTCAAGTTGTTACTACATCTTCTGTTTCATTGTATATTCTTGTCATGTTTTATAAAAAATGAAAATCTTGTAAAAAGGAACTGCCTAAA CTATTCATGGAATGATACTAGTATAAAAAAACTTGAGATGAACTTGAGCTAAACACCAAGGAGTAAATTATGTGTGCATGTAATTTAATGTTTCATGGAA GGAAAATAGTAAACAGATATTCATCTTGAGTGAAACCTTGAAAGCATATTTCCCCCTCTCTTTCTGGGTTGTATCAGATTCGTTTACAGCAAGCAAAATC ACCCAAAATATCAAAATTCTATATACTCTGATGGTTAACTAGTCTACTATACAAATGGGAAATATATATGCTGGAGAATAATGATTAATTTGGTCCTCCA TCATGGTTAATACATAATGGAGAGTTAAGTAACAACTGGGCTAGTGACATAAAGATTCACTAGATTTTAGAAAGACGAAAAGTTAAAATTCTATGTGAAA GTGTTGTTAGTGCACAATTGTCTAACCAGGAAAAAAATGATAAATACTTAGTTTTACTAAAATTGATTTTAATAAAACCCCAATAGGATAGTTTGGATTT TATTGACATTCCGAAAGCCACTAATTAAGACATCAAGTAGAACCCACGGCTTATTAAATGATACTTGTGATTGAAATGGTGTTACTTTATATTAATGTTA AAACATACTTCAAACTTATACTTATGATTTTGAATTCCATGACTATGCATATCAGTTTCAACTTGAAGATGCTATTGAAATGGAAGACTCTCTGCAAGGT TGAAAACTGCTATAACAGAAGCAACATCCACAGAGAATGTTGCTGAAATTATGTCACTATTGAAGAACGCCATAGACGAGGAACGATACCATGATGCTTC AAGATTATGCAGACACACCAGCGGTGGACTGGTTTCAAAAAATGTATGTGAAATGGTCAAACATGCGATCAATGAAGCACAGAAAAGAAGTAGATTATCT GAGTATACATCTTTTAGCCGGATTACCAGTTCAAGAGGGGATTTAGATCCTTTTGATGGACTCTATGTTGATGCATTTGGCCTTTATGGTGCTGACGTAG TTCAATTGAAGTGGAAATTTGGACACTGGAATGATATGGATAGTGAAAAGAATCCTTCAGATGTAGAGTTCATTGAATATGTAGAGGCAGTGAAGTTGAC AGGTGACTTTTCATGCTAGAATTGAGAGAAGCAATTGCAAGGCAAACCTTGGGAGGCATCCCAATGAACTGGGAGTGGATGCATGCTATAAATGGGTTAT CAGAATTCAAAATGGGTTGATGGTGAATTACTTGTACTTAATGGCAAGGGCATTGGACATCATATGAAAGGTGCAGATATTGGTTTCCTTTATATTCTGC CTGATCAAAGTTTTATTGTGCTATTCAACCGGTTGAAACTACCAGAGTGAGCCATAGTTCCCTAATCCAGTCTAATTATTTATCACATTATTTAGAGTGA TAGTTTTACCCAAATGCAGCCCTTGTATT BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_142505; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_281675
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Protein EXECUTER 2, chloroplastic from Arabidopsis with 51.6% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019463780.1) |
| Pfam | Histidine phosphatase superfamily (branch 1) (PF00300.21) |
| Rfam | - |
| GO | - |