Id Trinity | TRINITY_DN46204_c1_g1_i9 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_319828 |
Sequence | GTTCTAACACAACCATGGCTGTAGCTTCAAGATTCATGTGTACAACTCTTACTCATCACGGTTTTAGCTCAACAACACATAGAACCCATTTGGGTCATGC TCAGTTAACTCTTTCTTCACGCAAGAATCAAATTATTCATTGTTCAGTTTCTGCAAGTGATGCCACAAAAACCTCCTCAGTGATGGAACCCGTTATTCCA TGGGGCTGTGATATTGATTCAGTAGAAATTGCATCAGCTTTGCAGAAATGGTTGTCAGAGTCAGGCCTTCCACCACAGAAGATGGGAATACAAAGAGTTG ATGTTGGAGAGAGAGGACTTGTTGCATTGAAGAATATAAGGAAAAGGGAAAAGCTTCTCTTTGTTCCTCCCTCACTAGTCATAACTGCAGATTCTGTAAG CTTTTCTTTATGTTAGTGTTAATTAAAGTCCCTTGTCTGATTGAACTTCTAAGTTGTATTTACCGCCACTGAGGCAGTTGTGTTGTAGCCCGATACTGTC GCATCATTATGATCTAGTGTCACACTAAAATTTTGGTCTATAATTTGAAAAAAATGGTTGTATCTGCAAGCAAATTTAGTAAGAGTTGCATATAAAGAGC TGGGAGAGAGAAAGATTTGTGTTGATTATTGGACTCATAATTCCATAAATGATATAAATTTATTCAATAACTTAAGCATTTAATCTTACATAAAGTAGCA TTATTGGAGGGGAATCTGCTTATAAGTTATTGCAAAATGGTTAGCAGAAGAGAATTCAAAAAACACTTGTACTCAACTCTACTGAGTTGCAAATGCTCAG TGTTTTAAATTGCAGTTGCGATTGCGATTGCGTTAACGGTTCTGTTTGCTGCGATTAAGGTCATTGTGGTTGTTGTAATGCGGATTGTGGCTGTTGCAGT GTGAATTATTTTGTAATTAAAAAACTACTTTCGAATTCGATCCGACCTGATGTGGTCCAAATGCGGTCTGATGCTGTCATTGTGATTCGGAATCACACCG CAATTGCGGTGTGATGCAGTTGTGGCGGTCACTGCAACCACAATATTACGGCCGCAATTTAAATCACTGACATGCTCTTACTATATTTCAAACAAATATA AAGTAGAGCATTATATAAGGACGTGGCTGTCAACACCAGTACTTGATTTGATCCAAGAAAGTTTCCCTGTGAATTGGTCTGCATAAGAAGTTAGAATGCT ACTCATAATTTAGGTCTTAAATTGTAAAGCACATACTATCTGTGTCAATAGCTTCTTTCCTAAAACTATATGCGATGCCATATGAAGAAGCAGAACAATC ATGGTTGAGTAAGTATCTTCTTTCCTAAAATTATATGTGATGCCATATGAAGAAGCAGAACAATAATGGTTGAGTCGAATGATCTGTTATTTTGGTTTCC GCTTTCTGGTGTTCGGTGAGATGAAATTTTTTTATTGATATATGGAAACTTTTTTTAAAGTTATACTAAAACACCCGAGTTGGTTCATCATATTGATCTG GGTCAGGTACTTATGCATCTGTATGGGTTATGTCTCTGTATTATGATTGTTAGGAGTGGAGTTGTCCAGAAGCCGGTGAAGTATTGAAAAGGAATTCAGT GCCCGATTGGCCATTCATTGCAACTTACCTCATAAGTGAAGCTAGCCGCATGAAATCTTCTAGATGGAGCAATTATATATCAGCCTTACCTCGGCAACCT TACTCACTTCTTTACTGGTAATTGGATTGTATGATGAAATCTTTTGAGAGCTTGTTACAGAAGGATACGAGATAATAATATTGATGAGTGAGGAATTGAA GTTAGGAGCTTATTACTTTGCTATGGAGAGTTATGGGAGATTTGGAAATGAGGAGACTATTTTCCAATGTGAGCCTATCCAGGGGAGTGAAAATGAAGAC AAGATTAGAACATGATGTATTAAATATTATAACTTTATAGCATTCTGAGCGTATCATTTCGATAAAAATACACGAGATGCTTTTCTGATTTCTCATTTTC ATTAACTTCACTTTTTCTGGTGTTAATTTTGGTCTAAAGCAAAACATAATACTCGATGGGCTTTTCATCTTATTTTCATAAATAATGAAGGAATCTACTC TCAAAATTCTCCCAATACTTTATTTATGCCATTTCAGGTCACAAGCAGAACTAGATCGCTACTTGGAAGCTTCACAGATTAGAGAGAGAGCAATTGAAAG GATTAACAATGTGATTGGAACGTATGGTCCAATTATTTGTACCTCATGTTTCATCAGGGATTCTAATGTGCTTTCTTGATTGAATAATCCTTTGTCTTGG TATAATTTATGTTCGTCCCGTTTTTCCACAGATACAATGATTTGAGGCTGAGAATATTTTCCAAATACCCTGATTTATTCCCTGAAGAGGTGTTCAACAT AGACTCCTTCATATGGTCATTTGGCATTCTTTTTTCTCGCATGGTTCGGTTACCCTCCATGGATGGAAAAGTTGCCTTGGTTCCTTGGGCAGATATGCTG AATCATAGTTGTGATGTATGGTCTCTTCCAAAGAAGATTCATAACAAGTTTTTCCCCAGGAAGTTTAATTTGTTTTCACTGGTCTAGGTGGGGACATATT TGGATTATGATAAATCGTCGAAGGGGATTGTTTTTACGACAGATCGAGTCTATCAACCAGGTGAGCAGGTGTTTATTTCATATGGAAAAAAATCAAATGG AGAGCTTCTGTTATCTTATGGATTTGTTCCAAGGGAAGGTGCTAATCCTAGTGATTCAGTTGAGTTGCCACTGTCACTCGAGAAATCTGATGAGTCCTAT GAGCAGAAGTCAGAACTCTTGAAGAAGTATGGTTTATCAGAATCTCAGTGTTTTCCTATACAGATTACTGGTTGGCCAGTGGAGTTGATGGCTTATGCTT ATTTAGCTGTTAGTCCTTCAAGCTTGAGTGGGAAATTTGAAGAGATGGCTGCTGCAGCATCAAATAAAATTACAAACAAGAAGGATTTGCGATATCCTGA AATAGAGGAGCAAGCATTACAATTCATACTTGATAGCTGTGAATTCAGTATATCAAAATACAACAAGTTCTTGCAGGTAAGTGGATCACTGGATTTGGAT GTGACTTCTCCAAAACAGCTCAACAGAAGACTCTTTCTGAAACAGCTAGCTGTGGATTTGAGTACTAGCGAGCGAAGGATATTGTTTCGTACTCAATATA TATTGCGAAGGAGGCTGAGGGATATGAGATCTGGCGAATTAAGAGCTCTAAAAATCTTCGATGGGTTTCGGAATCTTTTCCAATGAGGGCATTCGCTAGT GCATTATTGTTCAATTCATACATGTTGGGATTCATTTGTTGGTCAAGTTTTAAGTGATGAAATATTACAATCCATTTTGAATAAAGCAAGAGGGGGAAAA TGAATGACTGCAATAGCAGTTTTGCTTGATCCAAACTACTTATTTTCTTTTCCTTTGATGTTTAAACTGTCAAGGTGAAAATTCTATAATCTTATGAAAA TAGGCATTGTAGTGTCCTGTGCTAGGATAAGGGCCATGACCCTTGTGAGATTTTTTCTTTTTGGGTCTGTCTTCATATTCCATGATCAAGTAAGAAAACT TGCATGAGTTTTTAAATATCTGAAAAATCACATATCATGCACTAGTTTTCTGCAACAACCTGATTACACTGTCAAATAAAGCTATAAAAAAG BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_142929; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_319828
Blastp | - |
---|---|
Blastx | Histone-lysine N-methyltransferase setd3 from Silurana with 26.24% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019420730.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | - |