Ll_transcript_318823

Id TrinityTRINITY_DN46214_c0_g3_i3
Name TranscriptLl_transcript_318823
SequenceCTACACCATTCATCGCGTGAACAAAATATCCCGTTCCGCTTTTTGCCGCAACACACGTTTCAATCTCTTTCTCTCTCTCTCAAAATATCGCAACTGAAAA ATGGTATCAACAAACCCGAACCCGAAACCCGATGGCTTCTACTTGGATCCCAATGGCATGACCCGAACGGGTCTCAACCCCTTCGCCTCCGCCACCACCG CTTCTTCACCGGTTGATTCCGCCGCGATTTTGTCGGAGGACGCTGCTAAGAAAATCCGAAAGCCATACACTATCACTAAGTCAAGAGAGAATTGGACCGA ACCAGAACATGACAAGTTCCTTGAAGCTCTTCAGCTGTAAAGTTTCTTTCTTTAGTTCTCATTGCTTAATTTAGTGAATCAATTTTAGGGTTCAGTTTAG AAAATGGTTAGTTTTTTTTACACGTTTGTGTTCAGTGATGGTTCTGTGTGTGTTATGTCCAGAATTGTATGTAAAAGTGTATAATTTAGGGTTTCTTGGA TCGGTTTGGTGGGTTTAGGAATGAGCATTTTTTATGATTATTAAGATGTTAGAATGCTTGAATTGTTCGAAATGAGATGGAATGAAATGGAACCTCATTT CATCCAATACCTCAATGTTACTTCCATCCCAATTTGTTTGGGTATTGAGTGGAATTAGATTGAACCGACTAATTATTAACTTTGTTCCATTATAAAATTT ATAAACAATGACATGATATCTTTGTTCCACTCCATTTCACTCATCCTTAGAATTACAGCCATAGTGGTTTTTGTGCCGAGTTAGCACAATGAAATAGTTC ATTTAACATGGAGACTGTCTGTGTTGTTGAATGGCGTATATTAATCTGCTACCTATTGCCTCAAAGGTATGTTTAGTACGATAATCTCTACAAAGTTGTG TAGCCTCTTTCAATATCAGGAATAGAACTTCCCTTGAAACATCAGAGTACCCGAGAGATGACTTAAACACAATTAGATAATGCTACTATCCCATAACAAT TTTGAAGACTAAGGGTCCCCTTCAAAATACGGGCATTTCTGTTTAGTAAATTGACTTTTGGTACTCGACAAAGTGTTTGTTTTCCCCTTTGTTGGTCTCG GTGTCATTATTTTGCATCGGCATTACATTGTCTTGTTCCTTGTCTTGTCCCTTTCTTTCTGTACACAGGTTTGATCGTGACTGGAAAAAGATTGAAGCAT TTGTTGGATCAAAGACAGCAATACAGGTAAGAAATGCATCTCTGTTTTCGATACACTTTTTTGTTTTGAGTCTATGTTTTTCATTCTAATTTTGGCCTTT AACTATTCATTTTTTCAATTTATTTTCAAATATGTGTTTTTTGTACTTGGTAATTGGTATTTTGGGAGGGAAGTCTCGCAAGAAAAAGAGTATTCACTGA TAGATATCAGTTCCTGGTGATTTGTAATGTTCCATGTGAAGGTTAAAAATACATTGGTGGTAGAAAATCCATTCTGTCAGGATGTTGTTTATTGGTTAAC AGGTTAAGACAGAAAATTCGTTGGTGGAAGAAAATGCTTTACTGAAGTCAGCATGATGCAATATATACATTTCTGGAAATATATTAGATAATACTATTTT CTGTTGATTGGTGTTGACTGTCTGCACCTTAGTTGCTTGAAAGATCTTAATGTAAAGGACTGCTTATGAGTTATTGGAACTTTTGTTATTTTCTTATGGA TTTCAATTTAATATGGACCTTTTCCCAAAGAATGAATTGTGCTGACTTTGTAGATACGTAGCCACGCACAGAAATACTTTTTAAAAGTTCAGAAGAGTGG GACGAATGAACATCTTCCCCCACCCAGACCTAAGAGAAAAGCTGCCCATCCATATCCTCAGAAAGCTTCAAAAAATGCTTCTGCACTCTTACAAGTATCA GGACCTTTTGAATCTCCATCTGCTTTGCTTGAGCCTGGATATATCCTGAAGCATGACTCTCCGTCCCCAGCAATGCTTAAAACTCCTATTACAAACACTG TGGTGCCTTCCAGGTCAAACACCACCTTGCAAGCAACTAATCTATCACATGTGCCCAAAGTGAATAATTCTTGCAGCAGCAGTGAGAGCACTCTTGGAGT GAGGCCGGTTGGTGAGTTTAATGGTCAAGGGAATAATAGCCATTCATTGAGAGTTCTTCCAGATTTTACTCATGTATACAGCTTCATTGGCAGTGTATTT GATCCAAATGCAACTGAGCATTTGCAGACGCTAAAAAAGATGGATCGTATAGATGTTGAGACGGTGCTACTATTGATGAGAAACCTGTCTATCAATTTAA CAAGCCCTGATTTTGAGGATCATGTAAGTATTCATGCTACTGATCTTTAAGATTACTATAAATATCTAATATGTCATGATGATTACATGCCATTACCAGA CACACTAGAAGCACCATGCAAGACATTTTTGATAAAATGTTACTTTAACTGTCTTTTTCTTTTTATATTCTGATCATACCCTTTGGAGTAAAATTTTCAG GAGTTCTATAGCAAGACATCATATCTTCTAAACTTCTTATTTTTTCTCCTCTCCTGTTAATGAATCTCTTATCATCTGGCCAAAGAAAACAGAAGGGAAA AGTACAAAAAGCAAATTTTTGGTTTAAGTATTTTAATTTAAGAATAATTCTTAATATTTATATTACTCATTAACCACCTTTGGACATGGTTAATTAGTTG AGTGGTTAACTGTTTTTTATATAAAAAGAAATGTTTGTAAAACCTCCTTTTTATATTTTAAATATTTTTTTTAACCCCCAAGCTCCTTCCCCCTTTTTCC AATTGAAAAAAGAAAGAAAGGTGCACCTTCTGTCACAAAAAGTAAAATTTTAGGACAAATCAGAATCGTTACGTTAACCATTAATTCTTGAATTATTCTT TAATTTGACTGTAAAATGGTTTTTAAAATGGCAATTGATGGTAAATATTTTTTCCAAGGAGAAAAGCAGTAGTCACTTGTTATAGCTTTTTAGGGTACAA AAAGTTGTGTAAGTTTTCATTGGATTGCCTTCTCTATAACTCATTCTACCATCTTTAGCGTAGCATTTTTGTTCATAATGTCCCTGAGCTGGGGTTCATC AATAAATAAGCACCAAACTGGGAGGCTATTATCAATTATTCTTCTACTTAAGGCAGCTTTTACATCCATAGGTCCCATAAAATTTGATATTACATGTGAA GGTTTTGCCATATTTTATATTTATTTTACGGTGAATGCATTCCTTCGTTTATCATTACCTGCTTAAAAGAGGCTGCATTTCGCAATTGTATGTGAAGATT ACTATCATTGATTTATCGACTCCAGAGAATGCATGGTTAAGGAATGATAGTTAACTTCACATTTTTGTTGGTCAATCTATTTACAATTGTGAATGCTGTG AAATCCATGCAGAGAAAGCTGCTTTCATCATATGAGGTTGAACCGGAAACAGATAGCTATATAAATGCTGAAAGACCCGTGTCCGATGATCAGTTGAAGA GTGTTATTTAGATGGAGTGGAGGCTAAAAATCTCCTCAATTTTTAGCTATTGCATGAAGCCAGTGTTTAATGATTTTACATGGTTAAGTGAGATGCCTTC AAAAGCTAACAAGCTGAGAGGTTCCCAGTCAGCCAATGATGATCTTTTAGTTTGTGATTATTGCTCATTATGTCAGCTAAGCAAGGCATTGATTCTCTTC ATCATAATGTCGTGTATAGGAAATATCTTGTAAAAGAAAAAATAATGTATGAATGTACAGTTTTTTGTAGTGCATGTTGGCTGTGTATAGCCGTATAGGT TTTTTTTACTGTTAGTACTTTATCCATCATTCATATGTATGTCGTAGAAATCAACGATGTTTAATATATGAATGATGAATAATGTATTAACAATATAAAA AGAACCGTACTCTCTCAGAGCATATCCTTTTTTTCCCTCTTAATAGTTAAACAAATCTCACAAGAGTCCAGGCTATTCTATCCCTGTAAGCTTTATACTA TCAATTATATTTATCTAGTGAGATTTTTTAGGCTGAACATGGAAAAACTCTATCAAGATACCAAGTTTGATGAAAAGAAGCAATTGGATTATTGTGCTTA TTGCCTTTTTCTTTT BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_142998; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_318823

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_318823
BlastpProtein REVEILLE 6 from Arabidopsis with 52.46% of identity
BlastxProtein REVEILLE 6 from Arabidopsis with 57.95% of identity
EggnogTranscription factor(COG5269)
KeggLink to kegg annotations (AT5G52660)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019449701.1)
Pfam-
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;