Id Trinity | TRINITY_DN46294_c2_g1_i6 |
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Name Transcript | Ll_transcript_318779 |
Sequence | GAAAAAAAGACGATGCTGTGCGATCATACGAGTTAGGGTTTTACATTCACTTTGCTTCAAAACCTCCATTTTTTTATTTTAATAATTTTGATTCATACAT CAAATTCCTTCATAGTTCGTTTCGAGAACTCAATTAATCGAAAGATATAATAAGAATTTTGTTCGTTGATATGTTGGCAAAGAGACTAACCTCGTTCCTT AAACTCTCTTCAAAACCTCAATTTTCCAGGTTTGTTTCCTCAAACTATTATATCATCTTGTATTTGGATACCCCTTATTGAAAGTTGAAGTCTTTCTCTC TCAGTTCCTTCAAATTTTGGAACTTTTCATGTTCTATGATTATGCATACTTATTAATTGTTTATGTGTTTGTTGATGGAAGTAGAAAAAAAGTGAGGATT TTGAATCCACTCGTAACTCCAATGACCACAATATTGCAGCTCTGTCGTTTTTTGGGTACTAGCCGTACTACCAAGTGCATCCCTCAGGGTAAGGAACTAA TCACTTTCGGGGTGTGTGATTATTCTATTGAACCGTTGACCTTTTGGTCTTTCTAGGGATATAGTGGCCACATTAGTTGCATTGTTTCCACAGTTGTGGT AAATTGTTGGAACTTGGAAGTCCCACACTGTGTGCCTCAATTCTCGGGGTTCGGTTTATATAGCCGTTGGACAACTCCGCATAATGACATTTGGTTCTAA GATTTTCCACATTGTGGCCACATCAATTGGATTCTTCCCCAATTGCATTAAATTGTTGGAAGTTTTGATACCACCTGTTTCAATTTCTGGGGTGTGGTTT ATATACTCGGTGGAAAACTCCAATTAATGCCAATTGATTTTAAGATAGAAATTAACATGGTATTGGAGCCTATGGCCCATCTGTGTTTCCGTAGTTTGTA TCGTCTGGTCTGGCTATTGTGGAGGGGATCTTGTTGAGATATGTATCAGATTTCTTAGTTACCATATTCTTATCTTAAAGTTTAGGTGAGTAATCCGGTT CTGATGTATACAAATGCGTGTAAAGACCATCGGTGAAAGTCAAGTCATTCATTACTCAATTTCAAGTGATGTATATCATTTCCAGCATGTATCCTCTAGT CCGACATCTATGGATGGTAGGTTTTTTGGAAGTTCCACATCTCCTAATATCAATTCCCGGGGTGCGGTTATATACACGTTGGGCAACTCTACTTCATGTC AATTGATTTTAAGATGGACTATAACAAATCATGACCACTGCCTCATTTTAAAATGATGTGTAACTCATTTATACCTTCAAATCTCAATACATGAATCAAA TTCTGTACCCAAATTAGGGAATTTTACCATTTGCATTGCTCAAAAGGTAGAGTCATGAATTGAGAACATGCTAAAATGAGTCCCAATAATACAAAGGGCT TTTGTATATTTTTTCAGCTAAAAATTGTTTACAGATGAAATATGTATTATACTTGTTAGCATTACTTCGCCAAATTTGAGATAATAATATGGTCCTTCAC TGTGAGTTCTGACTACTGATTTTAAACTGCTGCAGTTCTGCGAAGAAAGTTGATGACGAACAAAGCAAGTATTTTGGCCGCAAGGCAGTATCATTTATTT TGATCACCGTTACAGGTGGTGTTGCTCTTAGTGCCCTTAATGACCTTGCTATCTATCAGGGTTGTAGCAGGTACATGGAGCTGTAATACGATATTATGTT TTAAGAATTGATAATTGCTACTCCTATGTTATATTCATATTAATGCATTTGGCAGACATGATAATAGCTACTTTAATCTCATAAGTACTATATTGTAACA TACCGTGGTTCAGATCAAGAAGCTTAAAGTAGACATTACAATGTATCAACATTTTTTCTTTATTTTGTATATCATGCGTTAATTATTTCTTAAAGAGGAA CAGTTCCTCAAGAAGGTTAATCATTTTGCTTAAAACTGAAACTCAACCATTTTCTTTCCCACTCCTATATTATCATAAGAACGACGATGAGGTTATATAG CTATCTCTTGCTTCTGTATAACTTGGTAAGTCATTTTCATTATTCATAGAAAAGAAAAAAGTCAGTTCATGCAAATCAGATTTGGAATACTAAGTTAATA ATTATACCTTCAGTTTACTAGCTCTAAGTAGTTTCTCAAGGGAGGAGGAGGGCTTCTAAGATCTGTTATTTTTTTCATGTCCTTTTTAGCCTACCTTCCA GATTACAGTTATAGGTTCCTTGTGATATGTTGCTGCGAAAATGATCATAGGTTCCTTGTGATATGTTGCTGCAAGAATGATCATAGGTTCCTTGTGATAT GTTGCTGCGAAAATGATCGTAGGTTCCTTGTGATATGTTGCTATGAAAATGATTCTAGCCCTCTAATTAAGGTTAAGTTAATCAACATTTTCAAATTCTC CACCTTCCCATCCCCCAAAGAAAATTATATATATTATATTTTCAACATCCTTCTGTCTTTACTTACCCGTGGTAAGCTTCTTGAGTTATTGTTCTGTTCA TAGCAAAATTGAAAATGTACCTCCATGGCTCCTAAAATGCCTGTGAAAATTTGCAGGAAGGCTATGGAGAAAGTGATAAATAACCAAGCCGTAAGAGATG CTATTGGAGAACCGATTGTTAAAGGTGCTTGGTACAATGCATCTCTTGCAGTAGCTCATAAGAGGCATTCTGTGTCTTGCTCATTTCCTGTTTCTGGACC ACTAGGCTCGGGTGTCTTGCAGCTGAAGGCAGTCCGCACTGGAGATGACTCTTGGTCTTCTTATTTGGTTCCTCGTGATTGGGAGATATTAATCATGGAT GCTCTCCTCCACGTACCCGGGAATGACGAGCAGAATCGGACATTGCGGATTAATGTTGCTGGCAGTGAGTGCGTAGCTCGTCCATCAGAAAATTCAGAGG CAAGCAAATTGAGTCCCAATCAACAATAGTAAGTGTATTTGGTGAATCATTTTTATGTTTTGAACATTTACATGAGATATTGAGGCTTGGAAGGGAATAA GTTTTCAAATTTTCTATTGGTGCAATATGTTTTAATATTCTTTATCATATTTCATATTTCATAATGATGATAAATGTTGCCTTGTGCAATGAGGTATATT TTCTTTTATTATGCTTCTTTTTTTCTGTGTAATATTGCAAGATAATTTTTTAGATTCAAATTTGTATTTATTTTTCAACTTAAGTGAGGC BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_143541; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_318779
Blastp | - |
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Blastx | - |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0000623) |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019424781.1) |
Pfam | Cytochrome oxidase complex assembly protein 1 (PF08695.9) |
Rfam | - |
GO | - |