Id Trinity | TRINITY_DN46314_c1_g1_i16 |
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Name Transcript | Ll_transcript_364720 |
Sequence | CCAAAACCACACGTCGTCGTTTCATTTCATTTTCATTCTTCTCAACACACACATTCTCTCTCTCTCTGCGTTTTGGAGCTTAGTAGTGTCGTTTTTCAGA TCAGAGTTTTCTCGCCATGAACGGAAACAAAGCTATGGAAGACGCCAACGTTGAAGTGATAGAGTGCAACGAAAAAATGGTGTACATGTGGGGATACCTT CCCGGAGCTTCATCGGAGAAGATTCCGATACTCTCTCCGACGCAAGTTACGCTCTCTCTGCCTTCAGATTCGTGGAAAGATGTGTGCGGAGGTGGCTGTG GATTCGCTATGGCAATCTCAGAGAAAGGGAAGCTCATAACGTGGGGTTCTGCGGATGATGAAGGCCAAAGCTATTTGGCTTCAGGGAAGCATGGGGATAT TCCAGGGCCTGTTCAGCTTCCCACTGAGGCTTCAGTGGTAAAGGCTGCTGCTGGTTGGGCTCATTGCGCCTCTGTTACCGAAGAAGGTGAAGTATATTCA TGGGGCTGGAAAGAATGTGTGCCTTCTGGAAAAGTTATTATTGATTTCACTACTGGGGGAAGCCTGCAAAAGGATGTTGCTGGGAAACAAAGCTCACCAG TAGCTGAACAAGATGTGAAACAGGAAGCCCACAAAGCTCAAACACTAGTAGCGGGTCGGATTCTCATCATGATAACAAGAAAGTTGGAGCAGATGTTGTG AAGAGAAGGAAGATCTCATTTGCCAGACCGGAATCTGACAGTCCAGCATCTGGAGATGAATTCTTTACTATGTCCCCTTCTCTTGCTACCCTTGGTCATG GGGTGAAAATTACCTCCGTTGCAGCTGGTGGGCGTCATACCTTGGCTCTGTCAGGTTCTATGAAGTACGAAGATATCGAAGGTTTTTGATGTAATGCAAG 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GTATTTATGGCTTTCTTACAGACAATAAGGGTTGCAATAGTGTTTATTATATGGTTGTAATTTACAGCACTTGTTGCGCCCTTAAATTGAACCTTTGCGT GCAATGATGTGACAAAATATTCTAAGTTTTAAATGTGTCACTATACTGATGTTCTAAACTCTTGAGAGTCTTAATTTGAGTCTTGGTGAGTGGAATACTA AAATGGTGTCAAAGAAACAAAAAAGTTTATAAGTTGGTACATTTGACCTTTTTTTATGATGTAACTGACATACCTAATGGAAATAAGACTTTGTTTTTGT TTATTGAATGAGTTTCAAGTAAATTTCAAGTGGTTCATGCTTGATTTCCCTTAAGCAAGATTTCGGGTTCGAGTCTTGTGCATAGGAAAAATGTCCGCTG GAAGAGTTAGTCCAACATATCTGTGGATGTTTCCGGTTCGGACAAAATTGTCTCTAGTACGACGATACATGTGGAA BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_143709; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_364720
Blastp | RCC1 and BTB domain-containing protein 2 from Mus with 30.77% of identity |
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Blastx | RCC1 and BTB domain-containing protein 1 from Mus with 51.72% of identity |
Eggnog | regulator of chromosome condensation(COG5184) |
Kegg | Link to kegg annotations (105670) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019460943.1) |
Pfam | Regulator of chromosome condensation (RCC1) repeat (PF13540.5) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |