Ll_transcript_366823

• Id Trinity: TRINITY_DN46366_c4_g4_i4
• Name Transcript: Ll_transcript_366823
• Sequence: TTTGATACCAAAGCGGTCTGATGCGGCCCAAATGCGGTCCAATGCGGTTGTGTTGTGGTCGCATAATTGTGATTCACTGTCATACTGCATTTGCAGTGTG ATGTGGTTGCGGCGGCCACCATAATATTGTGGCCGCATCACGTGATACGGTCAGCAATTTGAAACATTGGGCATAAGTATGGGAGCTTTCACCAAATTAT GTCTGTATATTTTTTAGAGAAAGGTGTTAAACATTTCCTAACTCTTCTTAAGACAGTGAAGCCAACATTTTATCCCTTTTTTGGGAAAATTACCAAAAAG AAACTCCTGATATAATATTTATAGCCATATTTTTCACAATGACTACACTTTCTTACACAGAATCACCACATTTTATTCCTTTGTTGTCCTTTTTACCAGA AGTTTCTCTTTTGTGGTTGGTTGGACTAACTTGATAATATGTGTATTACATATATCGAAATCAACTAAACTACTGAAGTTAGCTAGGTCCTTTTTGTTAT TTTTTGTGGGGATTGGGGGTGCTGCTGTATGCATTACCTTAATCATTTTTACTAAGGTTTTACTTTATTAAAAAATAAAAGAAAACTTTGACCGATGAAA AGCAGACATAATAATCTTGGACTGTATTTAAGTCAATCAAATTATTATAATTGCCCCATAATATTGTACTTTATTTAAGTCAATGACTGGAGCAGCCCAT TACTACTGCTATCGCAGCCGCTATGTAAAGTGCTGACATTGTTGCACTCCTGTGGCACTCTGTTTCTTCTCCATCAGGATGATGGTGATGGCTTAACCAC CATGGTTTAAAATTGTGGTTGTGCTGTCAGTGGGGTTATGCTGTGGTCATTGCAGTTGCGGGATAATGCGGCTACAATTGCGATCAAGATTGAATTGTGG AGAGTCCAAAAACCGCGGCTGAAATTGTGGTTGCGGACCACAATTTAAAACTATGAAGCACAAAGAAAGAAAACAGTTTGTCTTTAGAAAGTAGAGATGT TAAATATGAGTAGTGTAAGACTTTCTGGTATATGAATCTGCATACCTTGATATTATGCTGCTTTAAGTTTTAAAGAATGAGAAATTTTGGTGACTCATCT AAGAGGGCACACATACAAAGAGATTTCATGGATTCTTCTCTTTTCAGGAAAAATTAAATTAGTATGCATGTATTTAGTTGACAGTGTGTTAGGAATTGGT TCAGAAATAGGGGGAAATATGATTATATATATGAACTGTAGAATTTTTTATTGAATGGCTGCCACTAGTGGAACAGTGATGATCCAGAACAGGGAATAAC TGACGAATACATTATACAAGAATAAACTCTTCAGGACTTCGAGAACCTGAATCTCTCCCACTAAATTCAGTTACATTATACAATAAGCACAATTTTTGCA TTGTATTTGCTATCTAAGCAAAGACAAAAAAAGGTCGCGCAAAGCTTTTTCATATGATTCCTTTCTAGGACTTTCTTAATTAATTTGTTGTATGTGGAAC TTGTTGCTAATACTGAGAAGAATATGAAGATAATGTTTTTTTTAATTTGCTGGGCATACCAGGTACTGCTCTCTATCTGCTCGCTGCTCACTGATCCAAA TCCCGACGACCCTCTCGTACCGGAGATTGCTCGCATGTACAAAACTGACCGCACCAAGTATGAGGCCACGGCTCGCAGCTGGACCCAGAAGTATGCTATG GGCTGATCCATGTTTAGACCTTGTATACTCAATGACATATCCATGAATATTGTTGTGGGTTTGGTTTTGTTTCACTTGATGTTTTCTAGGGTAAGATTAT GTTTCTTGTTATGCAAGGAAATGGAAGGTGGTGTTATAATTTGATAAAAAAATTGACTCCTGTGTTGAAGTTCAACAACTGTGATGTTGTATGATGATAC AAAAGGATTAGTAAGATGTTTTATTTGTGTCATGGTTGTGTTGGCTTCATTGACATCATCATGAGTGGCAAGGTCTTAATGGTTTGTTTCACAAAGGTGA CACTCATGTTCTGTTCCATCTTACTGCAATGTGTTCAGTTGGAAGAGAAACCACCCATAGCACAAATTAGCGTGGACATCATTATTCCAACAAAGTTGGA TATGGATTTATTCTCTATTCCTAAATTTTTTATCTAATATTAAAAAGAAAAAGTACGCAAGGAATAAAACGTTTCCT
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_144146;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_366823

FPKM

• PAB: 0
• PNAB: 0.4
• PS1: 0
• PS2: 0
• PS3: 0.5
• PW1: 0.4
• PW2: 0
• PW3: 0.7

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_366823

• Blastp: -
• Blastx: Ubiquitin-conjugating enzyme E2 11 from Arabidopsis with 91.67% of identity
• Eggnog: ubiquitin-conjugating enzyme(COG5078)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT3G08690)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_003626536.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;