| Id Trinity | TRINITY_DN46398_c1_g1_i3 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_364677 |
| Sequence | CCCTTCTCTTAGCACCATTATCACCACAATGATGCTCCCTTTTGCAACTTGACAAACACACAACCAGCTCATCTCATAATAAAAATTGAAGTTGACATAT CCAACTACATTCTCTGATCTAGTTTTGTCTTCTACATTATATACTTATTTATATATTATGTAATACTATAGTAGAAGATATATAGTGAACAAATTAGATA CTATACCTTAGAAAATGGGAAGAGCTCCTTGTTGTGAGAAAGTGGGTTTGAAGAAAGGAAGGTGGACAGCAGAGGAAGATGAAATCTTGACAAAGTATAT TCAGGCCAATGGTGAAGGCTCTTGGAGATCATTGCCAAAAAATGCAGGTTTATTGAGATGTGGTAAGAGTTGCAGATTAAGATGGATCAACTACTTAAGA ACTGATTTAAAAAGAGGCAACATTTCTATTGAAGAGGAAAGTCTCATTACTAAGTTGCATGCTTCATTTGGAAACAGGTAAGTGTTTCATCAAGAGGTAC ATTCCAGAAATTTCTAACATATATAACAAACCAAGTAGGTACATTCCAGAAATTTCTAACATATATAACTAACCAAGTAGGTACAATGATATAATGATTC ATTTTTTCACATATTTAGGCTTCTTTGATTAATACTGTTACTGAAATTCAATCCACTCCCGTTTTTTTCTTTTTGAAAAATTCACACTTCGTCTAGATTG TATGAGTTTTATATATTGTCATTGTGTCATTCATTATTTATTATCGTATAAAGTTTAAGTTTAACACCATGGAGACATGGATATTACACTTTTATTTTAA ATGATGGGACTATAATGCTACAATTATGGTGATGGTAACAATAATGTGGTTGAAGCCCATAAAATGAAAAAATAAAATTTTAATTACATAAATAATCACA CTATAATTTAAAACATTAGTTGAAATTAAATTTTCATATTTCTAATTATTACTTTCAGGGAGATGTTTTTTCTATATTTAGTTATAATATTTATACATAA GAACTTCAAAATGTTGATTAATTGAGGGATTCGAGTTTCGAGACGATGCATGCATCTCGTGTTCTGAATATAATAATGAAGATAATATTTTAAAGCTCAT AAAGTTTTTCATAATTCTTTCGGGGAAAGTCGTATGGTGAATTAGAGCTACCGTACGAAATGATAGTGTCTGCCCCTTCTTAAATGGCATTGTTAGATGT ATTCGTTCACACTTCCCATCTAATATATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTATTAATAATTTTATATTACTTTTTGATAAGAAATTAATTTATTTAGAG TTTATGATTATCCTCTGTATCATTTTTAAGAATCGAATTTTCAATCTTAAGAATATATTAGAGCCTAAACTAAGTCTATACCCAAAAAAATATATTACCA ATTTTATTTTTTAATCGAAAAAATGTATACACCAACAATGCGTTAAAAAATTTAAAACTGTTAGAAATGTTAAATTCAACTTTTCTTTGTTATTTTTCTT CACAAATCACATGTTGTAAGACATAAGTTAACAAAAACCATTATTATTTTGTAATAGTATATAATATAAAATGCCATAAGTGTATATTTGTTTAATACTT GTTAGGGTCTCTCCGGTTTACTAATGAAAATTGTAGATATGATTAGACACTCACATTAAGTATATATGGGAGTATAAAATTTATAGACAGATAGTATAAA GATTTATATATATGCATTATATCATTCACTATTTATTTGGATTATTTTTGAAAAATCAATAATATTTAAATATCAATAATAAATGATAAAATAAAATATA TAAAACTCACACATTATTCATACATGTATCTTTTTCTCTATCTATAGTAGACCAATAGATGAAAAGTGCATAGATGAATCCATGAGATTGTTATAACTTT AGCACAAGTCTTGGCTCGGATGAGATCACATATCTCAAATGGTGTTTCATATATTATCTCAACTCAATCACATATTGTCAAGTGGATAAAAGAAAAATTT AAAAAACAAAAGGTAATAAAAAGTAACATTATGATTAGTTTGAGATAGAATACAAGATATTATTGGGGACATGTGATTTCTATTCTTCTGTTGAATGGTT AAAAGTGGTTTTGATCAATTTGGACATGATTCTCCTTAGTGAAGATTACAATTTTCTTCTAACCTCGATGTTGTATATATTTTTGTTTAAAGTTTAATTT TTTTTAATTACATATAAATAACAAGGTTTCTAAATTAACATAATAATATTGAAATATATTAGTTTGCTCTTCAATTTATTTAATTATATCATTTGCTTAT ATTTGAATTCATACATTATATAACATCAATATATAAATAAATGGGTTTAAGTAATAAATCAATGGTTGTGGTCCATGTTTTTACCCCTATAAAAGAAATT GTTCAAGTTAAAAGTATACACGTGGTCCAAAAAATCCCGACAATAAAATTATCAACCAGTGTGGCCCCTGTCTAGTGTGAGAATTTCAATATTTTTCTTT CAAACAATACATTTTTTAGTTTATAATTTATATATCATTGGCTGCATTTAGGATCTAAGGTTTCAGATTTTAAAAAAAAGAATTTCCTGATTCTCACAAG TAATGAAAGAGTATTGTGACACACTACAAAAAAAAACTCTTTAACAACTATAATTTTATATTATTTTTCAACAACAAAAATTAAGAAAATTTATAAATAT TTTCTACTTATATTTCAGTATTCACCTCTCCGATTTTTCATCATACTTCATTTTTGTTGCATAGAGTCACAAAAAGTGATTGCAACAAATCCACAACCAA CTACCAAGTACCTACATTTTTAGAAAGAAAAAGTATAGAACCTTTCCCTAGAATCACTCATCCATGAATATCAATTTACTTTACATCATTTTCTTGGTAA TAAATTTTCTCTCATTCCATGCTGGCAAAAAAAATCTTGATATTAAAGTTAAAAAAATTAATATGATGAAGCTTTTGACCTAGTAACAACATTTTCAGAT GGTCATTGATTGCTAGTCATTTGCCCGGTAGAACGGACAACGAGATAAAAAACTACTGGAATTCACATTTGAGTAGAAAGATTTTTTGCTATCATGGCAC TACTAGTAATAAACATGACGCCACCACCACGATCGAGCCTCGGATAATAGCTTTCCCTCCCAAGCGAAGAGGCGGTAGAACTAGCCGATGGGCTATGAAG AAGAACAAAACCTATGCCCTAAAAACAAAGTTCAATAATCATCAACAAAGTCCAAAAGAAATTCATCATCAGAATAATAATGAAGCAGTTCCTCTACCAC CTACTCCATCACTTGAAAGTGAGAACTTGACAATGATAATGGATTTCATGGCTTTGGACCCAGAGAAAGAAGAAGAAGTAGAAGTGGGTGAAGGGTTAGG TAAAAGTTCCTCTCAAGAAGAAGAAGAAAATACAAGAGGTACATTAGTTGAAGAGGAACAGTACTGTGTAGTGGAGGAAGGTGAAAGAATAAATGAGATG TTATGCATTGAAGGTTGGAAAGAAAAAAGTGATTATGAGATTTTGGGACAGTACCAAGAAGTGATTAATGGCTGTGGGGAGTTGAGTTTTAATGAGTTCA TGGACACTTGCTTTGTGGAACAAGAAAGTGGGGTTTTGTCATTGACATTTGGAGAAGAAATTCTTCAAAGTAATAATAAGAATAGTGATAATAATAGTAA TAATAATGAAGAAGAAGAAGAAGTGGTGGGAAATGGTGCAATAAGAAATGAACCAAGATGTACAACTAACCTAGAGAGTAGTTTAAACCAAAGCTCAAAT GGGGAGTGTAGAGATTTGTGTTCTTCCATGGCTTTGGAGGATAAAGAAAACTTGTTGACATGGCTATGGGAAGATGATGATGATCGTTGGGGAAAGGATT GTGATCAATTTGGAGATATTGATTCTGAATTGGATGTAATGGTTTCTTGGTTTAGTTGAACTAGATGTTATACTTTTAGGGTCTTTTTACTAGTTAATTT TTACGATGTAAAAACATCATGGCATTGGTTTCCTTTTTGTTTTGAATAGTATGTAATCATGTAGATAAATAAATTATAGTAGATAACTTTTTTGTGCTAG TATAGTTTGTAATTACACAAGTATTTCTAGACCACTCTTGTAGTATATGCTTTAATTAATTATTTCATTGATTGACA BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_144363; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_364677
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Transcription factor MYB12 from Arabidopsis with 81.82% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0002398) |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019438935.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |