| Id Trinity | TRINITY_DN46411_c0_g1_i14 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_391218 |
| Sequence | CAATCATTCATCATGATATAGCCAATGAGATACCTGTTCATGCTCAGAGGCTGCAATATTCAGCATTTGCCAGTTGGTTAGGAATTGTTCTCTGCCTAGT TTTTAATGTAGTTGCTGTGATTGTCTGTTGGGTCAGAGGCGGCGGTGTTAAAATTTTCTTCCTTGCGGTGATTTATACTCTACTTGGAGTTCCACTTTCA TATGTGCTTTGGTACAGACCCCTCTATCGCGCTATGAGGTAAACTACATTGTGGCCTTCTTTTCTTTACAATCATTTAAACACTTCCTAAATATGAACTA CATAATCTTGATTTGTTAAGATTTAGGTCCCACATTCATTGAGTATATGGATAAAAAACCATTTTCAAAGGTCCAGTCTTGGGAGTGAGGGGCGTGTGTG TTACTTTTAAGGTTAAGTCCCACTTTAACCATTTATAGTTATTTAACCTAACTTTTGGGGTGGAGTTAGGCCTGATTCTTCTAATATGATTAAAAAGATG GTTCGAAGAGTTCTGGTGTTTGTATGTGTTCGTCATTGTTGTTTCCTATCACTGCTGCTTTGTGTTGCCGCCACTGTTAGTTTGTTCACTGTTGCTGGTT TTTCCACCACTGCTCTTGGCTCATGGCTTCATGCATCCTGCTTTTTTTGGTACTGCCAAGGGTATCCCTCACCCTTTTGGGAGATCTAGAGGGGCCTTGC ATCACTATACCAATACCTTGTTGGTGGCTTCATACACTCTACTGCCAATGCTAGTACTTGTATCACTGCTGGAAATTGGTGGTTCATTGCTGGAATTGAT TGATTATCCAGGGATTTGGTTTTGATTTATTGATTCATATGAAACTTGAAATGAGGACTCCCAAATTGTGGTGTTAGGGTTCAGAAATCTGGGTATTCAA AGTGACCCACTAATCCAATGGGTTGTCATTGAACCAACCTGGCCCAATCTGATTTAATGTTGAAGCTGTAAAACTTTATACACTGGATGATTTTTGGATG GATCGGCATCAGATTAAGTATCCAACTCAGTGACATCCCTATGCATGGGTCCCTTTTAGTTACTGACAGTTGGACATCATGGATTTATAACCTAGTGACC TGACTTTATATGGTGATGGTTGTTACTTATGTTTGTTTCTAATATGCAGGACGGATAGTGCACTGAAGTTCAGTTGGTTTTTCTTGTTCTACTTGCTTCA TATTGCATTTTGCATCTTCGCCGCAATTGCGCCTCCAATTGTTTTTCATGGAAATTCATTAACAGGCATCCTTGCAGCAATTGGCCTCTTCTCAGACCAT GTCTTAGTTGGTGAATTGGACGTTAATGGAACTAGATTGAGTAGGGCCTTGCTTCCTTAAGTGTAAGCATGGAGGATGGATTTTTGAGCCTGTAAGTTTT AGTTGGATAAAATGATCTGGGTTCCCTTTGACAGAGGGCTTAGAGAGTCTGTTCCTCACATTTTGCAATATGTTGAAGTTGCTGGGAAAATGAAATTTCA TTACCTTTATGTGACACTACGTGAAACATCAAACTCCATAATCTTTTGCCTATTATTGTATGTTTGGGTTCAATCAATTTATTGTTATTCTTGCAGATAT TCTATTTGGTTGGATTTGGCCTGTTTTGCTTGGAGTCTATTCTAAGCTTGTGGGTGCTTCAGGTGAGGGATAGAACATTGAATTGATTTTCATTTTCATT TTTTGTATTGCTACTCAGCAGTGGGATAAATAATAGAAATTAAAACATGAACATTAAACAATGTTAGGACTGAAGGGTAAATTATATTTGCTTGGAAGAG GAACACTTAAAGCTGTTAGTTTAGAGGGGATATTGTACATAAATAAGGGTATTAATGGGGTTGATGGGAATTATTCTAGATTTTTTACCTTGTTCAGAAC TGAGCTTTGGTGAGTTGTGGAAGAGGAAACCCTTTGATGAGAATCCTTTCTCTTATCCTATTCTGATCCAGTTCATCTAGTGGTTATTGTCCCACAATAA AAATAAGTGAAGTTGTCATTGTCCATTTCTACCTCTCTTTTTCTCTCAGCTTTCTAATTTGGGTTCCTAACAAACTGGCACAATTTTTTCGCTCTATGTT CTAAAATACTTTTTTTGGTCTTTGTGTCCGAAATTATTGCCGTGTGAAGTCATTAGCAGTAAATTGGTCTACCCCAAGAGCAAGAGAAAAACCAGAAATA CAAAAGTCTTTTCTTTATTTGTGAACTAATAACTCCAGATTTACCGTGCTAAGAATTCCGATAATCATTCATGTTTGTCAAGAGACGTAAAGGGGCTGGT ATAAGTTAATTATCATACATAATATTCTATTAAGAATTTGGCATTCCTTTTGGAGAGGGAGAATGGAAGATGGAGAAGTTTAAAGACAACAACAACAACT CACTTGAATCCTATTGTTTCCATCTTTGTCAATTTCTCGGCTGTCCTGTATGATTGACTCAAGAGACCTAAATCTAGTGATTTGTGGTATGAGATAATCC CCAATCTTTACTTCTACATTAGAATTGTCCGCCTCTTACTAAACTTAATACTCCATATACACTTCATATATTTCTAAAGCATATCTCCATATCTCTAACT TTCTATTTAATTCCTCCCTCAAGTTGGAGAGATGTAAGGATAAAAAATTAAAATAACTTTTTCTTTTGTACAATGTCCAAAACGTTAGGACTATGCTAAG ATCTTTTAACTCTCCTTCAACTCTGTATTGTCAAAGAAAGACATAAAGTGTGATAAGGCGAACTGGTAGAAATTTTATGAAGAAAAGGATGGAAAAAATG TTGTAACTTATAAGTATTGTTAAGAAATTGTGGTTGTAACTTGTAAGTGTCGTTAAGAAATCCTGGTTGTAGCGAGTTTGTAGTGGTAAAGGGGCACCAC ACTATACGAGGTTTCTACCTAGTGGGGTTTCGGGAAGGTAGAGGTAAATGCATGCATCTTACTTCAGAAAGTGGAGAGAATGTTTTCATATGAACTTGTT TAATTTTAATTTGTTTTTGTTCTTGAGATGAATTCAATGCGTTTATCCCAAAATTATCTTGTTCCAAATAATACTCTTGAACTCATTCATGATTTTAAAC AACTGATGCACTTGTTTAGCTATTATCATATTATTAAGAAAGTATCCAGGGACTTTATTTTGTGCATGTTTTTACTTAACCAGCTAGATTTGCCCACAAC TTCTTTTACAATATGTATGTGACGTTATTGCTTGACAATTGTTTCCTTTACTTATCTCGCTGCAGAAAACATACATGTATTTCCGAGGGCATAAGTGAGA TTGCTCTCAGGTTTTTGATCCATCGGCTTCACTTCCCAGTTTGGCTTTGAGTATATTCTTTCTTTCTTTTGTTTATGCTTTTCTTTTTCCATGCAATATC TTTGTGTGATAGTTTTTGTTGTTTACTTATTTCTCGGGTGATTTTACCAGAGTTCACTCTGTACTGTAATGAATTATGTGTAGTATGTCTTCTACTGTAT TTCCCTCTAGTGAAACGAAAATTTGCTTTTTGAATTTTGATAAAATGTCTATAATCCTTCAAAATCACAACAACAATCAAATTTGTCATTTTTTAGTCAA ATTTTAGGGACAAATTTAGTCACGACATTTGTGTTGGATTTTATTTTAAAAATTGATTGGTTAAGTTTAA BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_144426; |
| Additional information | - |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_391218
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Secretory carrier-associated membrane protein 4 from Arabidopsis with 84.81% of identity |
| Eggnog | secretory carrier membrane protein(ENOG410XSJN) |
| Kegg | Link to kegg annotations (AT1G32050) |
| CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0002201) |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019421871.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |