Ll_transcript_391220

• Id Trinity: TRINITY_DN46411_c0_g1_i16
• Name Transcript: Ll_transcript_391220
• Sequence: CAATCATTCATCATGATATAGCCAATGAGATACCTGTTCATGCTCAGAGGCTGCAATATTCAGCATTTGCCAGTTGGTTAGGAATTGTTCTCTGCCTAGT TTTTAATGTAGTTGCTGTGATTGTCTGTTGGGTCAGAGGCGGCGGTGTTAAAATTTTCTTCCTTGCGGTGATTTATACTCTACTTGGAGTTCCACTTTCA TATGTGCTTTGGTACAGACCCCTCTATCGCGCTATGAGGTAAACTACATTGTGGCCTTCTTTTCTTTACAATCATTTAAACACTTCCTAAATATGAACTA CATAATCTTGATTTGTTAAGATTTAGGTCCCACATTCATTGAGTATATGGATAAAAAACCATTTTCAAAGGTCCAGTCTTGGGAGTGAGGGGCGTGTGTG TTACTTTTAAGGTTAAGTCCCACTTTAACCATTTATAGTTATTTAACCTAACTTTTGGGGTGGAGTTAGGCCTGATTCTTCTAATATGATTAAAAAGATG GTTCGAAGAGTTCTGGTGTTTGTATGTGTTCGTCATTGTTGTTTCCTATCACTGCTGCTTTGTGTTGCCGCCACTGTTAGTTTGTTCACTGTTGCTGGTT TTTCCACCACTGCTCTTGGCTCATGGCTTCATGCATCCTGCTTTTTTTGGTACTGCCAAGGGTATCCCTCACCCTTTTGGGTAAGCAACTAATCCCTTTC GGGTGTATGGCTGCCCCTCTCAACAATGTCGCTCCCATGAATCGAGTCTTTGAATTTTTTGTCATCCAGGAGATCTAGAGGGGCCTTGCATCACTATACC AATACCTTGTTGGTGGCTTCATACACTCTACTGCCAATGCTAGTACTTGTATCACTGCTGGAAATTGGTGGTTCATTGCTGGAATTGATTGATTATCCAG GGATTTGGTTTTGATTTATTGATTCATATGAAACTTGAAATGAGGACTCCCAAATTGTGGTGTTAGGGTTCAGAAATCTGGGTATTCAAAGTGACCCACT AATCCAATGGGTTGTCATTGAACCAACCTGGCCCAATCTGATTTAATGTTGAAGCTGTAAAACTTTATACACTGGATGATTTTTGGATGGATCGGCATCA GATTAAGTATCCAACTCAGTGACATCCCTATGCATGGGTCCCTTTTAGTTACTGACAGTTGGACATCATGGATTTATAACCTAGTGACCTGACTTTATAT GGTGATGGTTGTTACTTATGTTTGTTTCTAATATGCAGGACGGATAGTGCACTGAAGTTCAGTTGGTTTTTCTTGTTCTACTTGCTTCATATTGCATTTT GCATCTTCGCCGCAATTGCGCCTCCAATTGTTTTTCATGGAAATTCATTAACAGGCATCCTTGCAGCAATTGGCCTCTTCTCAGACCATGTCTTAGTTGG TGTAAGTTGTACTCCATGTGCATGTATTAGCATTTATTTTCTTTTGGTAAACCTATTTTGCATGCATTTTTAGAATATCACCTTAATGTTAACCAGGTGT TTTTATTTTATAGGGTTGTAAGTTGTAACTGATATGGAATTCATGTTTTTTGTTGTTCTTATAAATTTGCACATGATATTTAGAAGCATTCATATTCATG AATTGATCTCAGATATTGTACTCTATGCTCATTTACTGGTGGAAAAATCTGCATATCAAGTTCTTATATGATGTGTATTTTATAGTACTTAAAAGTAAGG ATGCATGAAGGCTATTCAATTCTCAAGTTAATTGTCCCTTCCCCCTTACCTCCTATAGAATTATCATCTGATGTATGAATGAATAGCAATAAATTCCATG GAGACTGTTGAAGTTAATATTGATGTCAAGCTAGTAACTTGGACTTGATTATTATATGAGAAATCAATGAAAATGATAACCGAGGAAGTTATTTAGGTCT TTCAATTCATATATAAAGGGCTGTAAATTTTGTAGGAATTGGACGTTAATGGAACTAGATTGAGTAGGGCCTTGCTTCCTTAAGTGTAAGCATGGAGGAT GGATTTTTGAGCCTGTAAGTTTTAGTTGGATAAAATGATCTGGGTTCCCTTTGACAGAGGGCTTAGAGAGTCTGTTCCTCACATTTTGCAATATGTTGAA GTTGCTGGGAAAATGAAATTTCATTACCTTTATGTGACACTACGTGAAACATCAAACTCCATAATCTTTTGCCTATTATTGTATGTTTGGGTTCAATCAA TTTATTGTTATTCTTGCAGATATTCTATTTGGTTGGATTTGGTTTGTTTTGCTTGGAGTCTCTTCTAAGCCTGTGGGTGCTTCAGAAAATATACATGTAT TTCCGAGGGCATAAGTGAGATTATTCTGAGGTTGTGATCCATCGGCTTTACTTCCCAGTTTGGCTTAAGTATATTCTTTCTCTTTTGTCTACCTTTTCTT TTCCCATACAATATCTTTGTATGATAGCGCTCCTTGTTACTCCGGCTAATGGGTGATTATACCAGAGTTTAGAGTGTACTGTGATGACCTCTTTGTAGTA TGTCTTCTAGAAATGAAAATTTGCTTTATATAACCATAAATGTATGTAATGGATTTTGAGTGAAGGATTAGTGTGTACTGATATTGAAGTTGTATTGTCG CCCCTCAAAGTTTATTAAATGACGATTTCTACTATTAAAAT
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_144426;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_391220

FPKM

• PAB: 1.2
• PNAB: 5.2
• PS1: 4.2
• PS2: 5.4
• PS3: 6
• PW1: 4.4
• PW2: 6.7
• PW3: 5.4

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_391220

• Blastp: -
• Blastx: Secretory carrier-associated membrane protein 4 from Arabidopsis with 84.81% of identity
• Eggnog: secretory carrier membrane protein(ENOG410XSJN)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT1G32050)
• CantataDB: Link to cantataDB annotations (CNT0002201)
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019421871.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;