Ll_transcript_391209

Id TrinityTRINITY_DN46411_c0_g1_i5
Name TranscriptLl_transcript_391209
SequenceGGCCTCTCTATCGTGCTATGAGGTAAACTACATTGTCGCCTCCTTTTCTTTACAAACATTTAAACACTGCCTAAGCAAGCACACAAGATGTTAAACTGTC AGGCTTGGGGCCTATCTAACCTAATTAACCTAATTCGAACATAAGCAATGGGGTTGGAGCCTTGATCCAGACTGATCCAATCCAAACTTGACTGAATCTG ATCTGTCCGATAACCCAACATGCAAGCCAGACCCCAAACCTCAAGATCTTGGTTCAAAGTTACAGAGCTAGATTCAATTATGAATTCTACATGGTCTTGG TTTTGTTGAGAGTCAGGTCCCACATTTATTGACATTACAAGTAAAAGAGATCATTTATCACTTTTGTGATCCTCCAAGTGAGTTTACAAGAAGGTTTACA GAAGAAAGATCAAATGTTTCAATAGCTAGCTAATTGAGGTTAAGGGAAGGCTATTTATGGAGCCTGTGTATATGCAGAAACAAAGGAAGGGTGCTAGGGA ACTAACTAATTTTCCCGCCAATTAAATACTTAACTAATTGATTCAGATTACACGTGAAACTTGAGACGAGGACACCCAATTTGTGGAGCTAGTGTTCAGA AATCTGGATATTCAAAGTGACCCAATAATCCAATGGTCTTTGTTGATCCAACTTGACCCAATCTGATTGATGGTAGAAGCTGTAAAATTTTATACACTGG ATTATTTTGTACATGGTGATGGTTGTTGCTTATGGTTGTTTCTGGTATGCAGGACGGATAGCGCATTGAAGTTCACCTGGTTTTTCTTGTTCTACTTGCT TCACATTGCATTTTGTATCTTTGCCGCAATTGCACCTCCAGTTGTTTTTCATGGAAAATCATTAACGGGCATCCTTGCAGCAATTGATGTCTTCTCAGAC CATGTATTGGTTGGGGTAAGTTCTATTCCATGTGTCTGTATTACTGTATTAACATTTATTTTCTTTTTGGGTAAAACTGTTCTGCATGCACTTTTAGAAT ATCACCTAAATGTTAACAAGGTGTTTTTGTTTTATCAGGTCGTATGTTGTAACTAATATGGAACTCATGTTTTTTTTGTTTTTCTATATTGTACAAGATT TTTAGAAGCATTCATATTCATGCATTAATCTCAAATGTTTTAATTTATGTTCATTTACCGGTGAAAAAGTCTGAATATCAAGTCCTTATACTATGTGTAT TTTCTAGAACTGAAAATGTAAAGAGATACGGAGGTTATTTGTTTTCTCAAGTTGATTGCCCCCTTCTATAGAATTATGATCTGATGTGCGAATCAATAAC AATAAATTCCACGGAGACAGTTAATGTTAACGTCAAGCTAGTCACTTCGACTTGAATATTGTATGAGAAACCGGTCAAAATGATAACCAAGTCACTGAGG CTTTCAATTCATATATGTGGGGATAATAGTTTGTAGGAATTGACCATTAACAGAACTAGATTGAGTGGTGCCTTGCTTCCCTAAGTGTAAGCCCAGAGCT TTTTGTTAGATAAAGATGATCTGGATTCCCTTTGACAAACAGAGGCATAGAGAGGCTGTTCATTGCATTTTGCTACATGTTGAAGTTGCTGGAAAAGTGA AATTTCAATATCTTTGTGTGATACTTTAGTAAACATCAAACTCCATAATCTTTTGCCTATTATTGTATGTTTGGGTTCAATCAATTTATTGTTATTCTTG CAGATATTCTATTTGGTTGGATTTGGTTTGTTTTGCTTGGAGTCTCTTCTAAGCCTGTGGGTGCTTCAGGTGAGGGATATATCATTTGAATGGATTTTCA TTCTCAGTTTTCATATTGCTTCTGAGCAATGGGATAAATAAGACAAATTAAAACAGCATGAACATTTAACTATGTTAGAACTGAAGGGTAAAATGGTATT TGCTTGGAGGAGTAAAGCGTAACAGCAGTTAGTTTAGAGAGGATCTTGTAGATAAGTAACTATAAGGATAATAAGGGTTTGATGGAGATACGTGTTCAAA ATGTGGGGACTATGCTAAGAACCTTTAACTCCAACTCTCTATATTGTCAAATAAAGACACCAAGGTGTGATAGGAAGGACTGGTAGATTTTTTTATCAAG AAAAGGACTGAAAGAGGGTTGTAATTATCTTTAAGAAAGCTTGGTTGTAGAGAGGTTCTCATGGTAAAGAGCAGTCCACTGCATGAGTCTTTCATATATT GGGATTTGGGGAGGGTAGAAAGTAGAGGTAGATATATACAACTTTACCTGTAAATGTACAGTCTTACTCCTGCAGGCAGAGGCTGTTTTCACAAGAGAGG TTATAATTTTGAGTATGAAATGTGTGATTTTTGGTGTGCATTCCAAAAAGAAGGAAGGTGTACTGCTGTAAATTTTGTTTCATCTGGGAATTTTTCTTGA TTCCGTATGAAAGATGAGTTCAATACCTTTATCCGGAATTATCTCCTTTTAAATAATACTCTTGAACTCAATCATGAGTTGAAAGTTGAAACAACTGTTG CAGTTGATTAGCTAATTATCCTATTAGGAAAGTGGGGACTTTGTTATGTGCATGATTTTACTTAAGCTGCTAGATTTGCCCATAACTTTTTTCAGAATAT GTATTCGACATTATTGCTTGATGCTTATTTCCTTTTCTTTTGTGTGCAGAAAATATACATGTATTTCCGAGGGCATAAGTGAGATTATTCTGAGGTTGTG ATCCATCGGCTTTACTTCCCAGTTTGGCTTAAGTATATTCTTTCTCTTTTGTCTACCTTTTCTTTTCCCATACAATATCTTTGTATGATAGCGCTCCTTG TTACTCCGGCTAATGGGTGATTATACCAGAGTTTAGAGTGTACTGTGATGACCTCTTTGTAGTATGTCTTCTAGAAATGAAAATTTGCTTTATATAACCA TAAATGTATGTAATGGATTTTGAGTGAAGGATTAGTGTGTACTGATATTGAAGTTGTATTGTCGCCCCTCAAAGTTTATTAAATGACGATTTCTACTATT AAAAT BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_144426; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_391209

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_391209

BlastpSecretory carrier-associated membrane protein 5 from Oryza sativa with 57.47% of identity
BlastxSecretory carrier-associated membrane protein 5 from Oryza sativa with 57.47% of identity
Eggnogsecretory carrier membrane protein(ENOG410XSJN)
KeggLink to kegg annotations (9266378)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019445255.1)
PfamSCAMP family (PF04144.12)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;