Id Trinity | TRINITY_DN46446_c5_g2_i3 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_390815 |
Sequence | AATTACTCTTTTTTCTTTGTTATTTCTTTAACTTCAACTATGGGTGGAAATCTGGCTTGTTCCTTATAGGGAACAAATTTGCAAAAGAACCATGAATTGG TATGAGAGAACCAATTCGCGGTGTAGAATTGTGTTTCAATGATTCATAGCATTATGTTGCAATTTGCCATGTTTTGTTTTTTGTTTTGGTTTTCTTATGT GGTTTAGATGAATAGTTTGTGATGTGTGATAGTCTTGTAGATATCTTATTTGTATGGTATTGTTTACACAGTTGCACGTCTGGCTTTATTGTAGAGGTAG TAACTACTGTAATTTTATAATGTTTAATTTCTTAAGTGGTGGTTAAGATTACATAGTTACCTGGTACATAGTATGAGTATGTGGTTCCACCTGGATACGC AATTTGTCACTTTTTACATTAATTTTACGAGAAACATTCATTATGATGAACCAATACATGTTATGCGGCAGGGTGAATTCGGTAAGAGGAATGTATGATA AATGAGAGAATTAGATTCAAACATTTCTTGTTTCTTCTTTATATCCTAAAGAAGGTTCAAGATGTTTTGCAATTTAACATAAAGGGTAAGGTTTTACAAG CTATCTTATATTGTGTATGGCAATTTATTGTGATTTTGATAGTAACATGGCTTTCTTGCTTCAGCTATGATAAAGAAGAGATAAGTTGACCAGTAATGCT TGGGATTTGGGAGAACCATTGCCTGTGCATTATTGTTAGGATTGACATCTATAATCTTATTGGGAAGTGTTTTGTACCAGAGTATCAGACTCGTTTTTGT AGTTTAGAATTCTTTTTGTGTTAATGCATAAATTTTTAGCACATATCATATGCATGTATCACTCATATTTAGGTAATTATGATTTGCTAGCCTCTTCTGA TGTTTTTATTCTCTAGAACTGTAATTTCTGTCATATGAAGAAAGCTTCTAGCCAAATTACATTTCGTGCAATGTGCATGCTGTCTGCTTTCTTGAGTGGA ACTGCTGAATGCAACGGGCTGCTTGCACAACCTGTTTAACTAAGCGAAATGTAATATAAATAGATTCATTGTAGTTGTCTTCTTTGATAATTAAAGTTTC ATTGTCTGAAATTGTAAAGGGTGGTCAATGTTCTTTTAAGTGGGGGAAACAGGGTACTTTTTCAAATCATTCAAAAAGCATGTTTAGACATAGTTACATG GTACACAGTATCAGCTCTGGTGTGCGGTACCCGGTACATGGTACATGAAATTCAGTGTGTCATACATAAGCTAAACAAGGGAAAACCTTTGATAAGGGGT TCTGGTAGGAACTGGATCAGAATTCAGAAGTTAAAAGAACTGAAATAATGGGTACATCTCCTCTCTGGACTGATATCAGTATTAGTGGGATCTGTATAGA AGTAACTGAAAGGAAAGAGAAGGAAAAGCATGTATAAATATACTAATAACCCCAACCAATTTAAGAGGTCTTGTTCTCTACTATGCTTCCCTTAGGCACA CCTTTACTACTCTCCATCCTTTCTTTTCCTTATATCAACACAGATCCTAACCGGAGTCCTGCTTCCCTCCACCATGTTCCCCTGCTGGCAGTTAGTTAGC AGTGGCCAAAAAATCAATGTTTTTCCTTGCCCATTTTCCCCCTATCTCCACAGCCAATATTACTTCTCACATATATATATTACTGATAGGCTCCACAGTT AGTACTTAGTAGCACTGATATAGTGGCATTGCGGAGCCTTACATGGCCAGGCCGTTTGTCGTGGTGCAGTTTTCAGCCTGGCCATCACAGCAAATACTTT CATGCAGCTGCTAGAATTAGGGTTTTTCTGATTCCTTCACTTCTTTGTCACAATTTTACCCGCACTATTACATCAAAGTTCTATGTTACCATCTTTAACT TAGCAAAACCCTATTTTTCTCTCGCTTTATCTTATCAAATGTCTTATTTACCCTCACTTAAACATTGTAACCCTCAGTTTTAACCTTACTTAGATTGGCT ATTCCACTGACTGGCCTTTGTCGTGCAAGCTCATAGCACAGACTCAGAGACTCTCTCACCTCCTTCCTTTGGTTCAACAAGTTAGCCAACTACACATTTA GTACTCTCTGCACTCTGTTTTGGCAAGTTCCTAACATAACCATATTTGTATCATGCAGATTCTTGCTCTATCAGCTCCTGTTTCAGGCTTCACTGGCCAT GTTCACCTCTGTATTGATGTAGTTTTTGTTATGATGACTTGTTGTTTTTGGTGACAGTTATGCTTCACATAATGGTTGTCATGTCTGTAAGTTAAAGAAA TAGTATCGGTATTAATGATTACTGTATATGAAAATTATGTTTACTGTATTTGCTATCTTGGGTATAGTGGTTCTGTCCATCCCATTATCCACTATATCAC TAGCATTTTGGGGTTGGCTGCTCCACACTGCCATCTGAGGTTGTCTACTACTTGTAGGGGGTTTTGCTAAGAGATTCTTTCTTTCTCAGACTGCCTTGTT TTAAAAGCTGTTCTCTTTGACTTATTCAAGATGATGAATTTTTTGTTTCCCTTAGTTCTGTTCCAAATATTTTAAATTGGTACTTCTTTTTGTTTCCCTC AGTTCTGTTCCAAATATTTCAAATTCTGGAAAATTATGAAAAAAGAGAGGAAGAAGAAAATAGAACATGGATATGATGATATATATGTGATACAGTGTTA ATACTATACATGGAAATTGGAAACCTAATATTCCTATTCATTCCAGAAGACATGTAATCTTTGTGATACTGTATTGTTGATCAAGTAATAGGTAGTACAA CTAGTTCAAGCCATCCCTATGACACACCTAAGTCCCTCACTTAACAAGATTTCTAAAAAAATGAGAATCTTAATAATCTAACATGTCACATTGCAGCCTG GATCTTCATTCTTTTTCCCCATATGTAAAATATAAAATGATATATAGTTTTAATGACTCTAATTTTGACTGATAGGTATGGTAGTTTTAGTGCAGATGTT CAGTTGAATATGATAGGATTATTGAAGGTAAAAATTGTCTGTTCTACTTGTTGCATGGCACCTTCCAAGTCTAAGTTCTTATGTTACTAGGTTGAATGCA TTTTTTTGGGTAGAAATATAGCATTTTCAGTGCTATTACATAGATCTATATTCTATCTTTAGAAGATATAGCTTTTAATGACTGCCCCTAACCCCCAACC ACACACACAACAAAAGGTTTCTGAACTTCTTGTCTATTGCAATTGACATGTGTGTTCTTCCATACATTTCTGTTATCCACAGATTATTACCCTATCATGT CGTGGCAGACTATGAAGCCGAAGAGGATGATAGGATGCTTGATTCTGACACCACTGGGCAGATGCTTTCTCGCTCCCAGCTATGGGATAATAACATCGCT GCAAAAATTGCCGAGTTCACAGCAACATTTGAAAAGCAAGCACTTGCTTTCAATATAATAACTCGCAAGCGAGCAATGGGGGAATTTCGGTCAGAGGAGA GGTTAATGATTGAGCAGGCTCTTCTCCAAGAGGAAAAACGGGCTATGCTGGAACTAAGAGCAGCAATGGTTCAAGCAGAGCAGGCCCGAGCTGATTCACA GTCTCATGCTGAAATGATGATGGCTCGGACTCCATTAAGAGGAAGTGCACTTGGTTCCCAAGGCAGTGATGACATTGTTCATGATATGGGAGAGCAGGAT CAGGGAGGCAATCACGGTGAGATGATAAATGGATGGGGAAAAAACTCACAGAAGGATGAGAAGGAGCCATCTGACGATTTCTTGAATGATGAAGAAACTG AAAACGGAGAAACTAGCACGCAGGACGGATGGCGCGAAGCTGGTGAATTTGATCTGAATGCCAGATGATCCTAAAAAATGTTCAATGTAGATCATATAAG ACCTCGATGACTAGTCTGGATTTCTTTTTCGGAATAAGATATGAGTATGATTATTTATCCTGGGCTGATATCTGTATAAGAAGTTTATGCATGTTGTAGA CTCTAGTTACATAGTTGGAGCAATTTTAGTTCTATTGGTAAGAAGTCAATTTGTCAGTAAACTGTATCTAGTTAATGTTTTGTTATGCTTCAGGTTTCTA GTTCTTCTGGACATCAAAATTGGTTTTATATGGATTTGGATTCATACATAACCATGAGATCAAAATTTCCCATTGCAAATGATTCCTACATGAAGAGGGA GGTCAAGAAATACGGATCGAATAATAATATTTâBLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_144694; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_390815
Blastp | - |
---|---|
Blastx | - |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019431146.1) |
Pfam | Conserved region of unknown function on GLTSCR protein (PF15249.5) |
Rfam | - |
GO | - |