| Id Trinity | TRINITY_DN46507_c0_g5_i1 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_520402 |
| Sequence | TGCTTAATAAATTATTATTACTTTGAAAGATGCATATTGCATAGTGCACTTTGTTAACCGTGAACACCAACCATCCAATTACAGTACCAAATTTATTTTC CATCTTTTGTTTTTGTTTCTTCCAAAATCCAACAACTCGGTGTGATGGCTCACCACCACCGATTCACAAACTCAGTGACACCCCAAAGCCACTTATTGAT TCCTCAGTGTGCTTGTCCATGCCGTCCATTTCCATCTCAATCTCAATCTCACCGTTCAATTTCATCCTCGAATCTCACCAACTTCCCTTTCTTTTTCACC AAACCTAAACCCATTTTCCTCCGGTTCAATCATCGGTCCGGTTCACCGGTTTACCCTCGCGCCATCGCGCACCCTGAACCGGAACATAGCCTCCCTCAAC AAAATGTACAAAAGGTACTACTTTCCTTAATTCACCTCAATGTTGAAAATTCAAATTGAAGGAGGATTTACTCCAGAAATCTCAACAGCAAGTTAGTCAG TTTAGGAACAGAGTTGTTTATGGACTTGGCATTGGGATAACTGTAGGTGGTGTTGTTTTGGCTGGAGGATGGGTTTTCGCAGTGGCCTTGGCTGCTACTG TCTTTGCTGGTGCACGTGAATATTTTGAATTGGTTCGGAGCCGTGGAATTACTGAAGGAATGACACCTCCTCCACGCTATGTGTCACGAGTCTGCTCTGT CATTTGTGCCTTAATGCCCTTATTTATCATGTATCGTGGTCATATTGATGTTTCTGTGACTTCTGCTGCTTTTGTTTTGGCCATGGCGTTACTCTTACAA AGAGGAAGTGCCCGCTTTTCACAGCTAAGTAGTGCTATCTTTGGGCTATTTTATTGTGGCTATCTTCCTTGCTTCTGGGTTAAGCTTCGATGTGGCTTAG CAGCTCCAGCCTTGAACACAGGTAAGTTACCGTAGTTTTCAGTAGTGTTTCAGTTTTAGTTCTGTCCATTATGGGGCTGGGAAAGAACATATGCATTTCT TTTTAATCAAATAAGAAAATTACCGAAGGCATTCTGTCATTAGTTCTCCACTTCAAGGTTATCAAGTCGAGGTTCATATTTTGAGTCGAGTCAAATCGTG TATCATGCGATACATGATCAATAATTTAAAAATAGATATGTATAGAAATTGAGAAATAATAGATATTAAAATTATAAAGTCATATAATTCATTACTAACC AACAACTAAAAACAGAAACTTCAGTATAACAAAAATTCAAAGTGATAATAAAGACTTATTCAAGTGTCATGAGAAAGAGAGGAGTGCAACAGAACAAAAG TCAGCTTTGGTAACTGAGAACAAAACACAGTTGTGGTATGGTACGGGCATACAGGCAAAGTGTGAAGTTTGAAAGAGATAAAGTGGCGACTCTTGTCCCA ATCGAAAAATCCGTCGGCCCAGGTATTTCATTGTCAGCAATTCTTTGTTTACACTCTTCTCTTTAGTTTAGTCTATGGTCTTTAAAAGTGAGACTCGTAC GAAAATTCTCTTTGGCCGTTCTGTTGGTTTAGCAACTCCTAGAGTCCCTTACAACTAGTGGACTAAATTTACAACCCTTGTTAACATCTCCTAGTCAAGT TGACTAAGCCAAATATCCCATTGTAACTTGTGCTTCAATGGCCTTATATATACTCCAGCACTCTAGCTATTTTTTTTTCTTGTCTGCAATGCATTAGCAT GTTGTGAGGTTGTATTCAAAATTCAAATTTGACATGCCCTACTATTGATGATCTACAGTGAATGATTGCATTGTCAGCCATTTTATATATTGGTTAATGG TTATATCCTTGTGTGTTAATTCAAACCACATACCACTGATGCTCGATCCTTTAGATAGATTTTTTAACTTGTCTCTCCATTAAGAACTGTCCTTCCTTGA TTGATTATTATTTTGTAGGAATAGGATCAGCGTGGCCTGTACTTCTTGGTGGTCAAGCTCATTGGACAGTTGGTCTTGTGGCAACTTTGATTTCCATGAG TAGCATAATCGCAGCTGATACATTTGCGTTTCTTGGTGGCAAGGCATTTGGTAAAACACCACTTACGCGTATAAGTCCAAAGAAGACATGGGAGGGTACT ATTATAGGCTTTGGTGGTTGCATTGTTACTTCTGTTGTACTAGCAAAACTTTTCAGATGGCCGATATCATTGTCAAGGTACCTACCTGACCTCGAAGTTA ATGTCAGTGTGTTAGTGTTACTCATTTAAATTATGATGCAACTATTGTAATTATTTGCCTGGTAAAATATATAAGTAGAATATTACAAAATATTTAAGAG GGTGAGCCTTGGTGCAATTGCTTGCCCTATGACCTGGAGGTCATGGGATAAAATCCTAAAAACAACCTCTTTGTTTGTAAGGGTATGCTGCGTACGTCTA TCCTCCCCAGATCCACTAGATGTAAGCCTTCTGCATTGGGTCAACCTTTATTACATAATATTTACAAATTGCATTGGTCTGATGAGATTATATGATTGTA ATTGATCAGTACTGAAGAAATCATATGAAAGTGACTTATGCAATGATCACCTTATGAGAGAAACCTTTCCAACCAGATAATAAGGGAGTTTCTTAAAAGT TTCTAGACATGCTGGTTCTTGATCTTCATATTACTGCTGTGTTGAGTGTATACAGCATATAATTTTTCTACGTAGAGTATGTACAGCAAGGTTTGCTATG TGTTGTTCCCTTGGCTCCACTTGTTTAAAAATTAAGATGTTCAAATAGCATCTTTTTTGTTTGATGCAACTTGCAAGGTTACTTGTTTTCTGGTAATCAG TTAACACGCCATATTCTAGTTTAAGTTGAACATTTGTTGTGCAATTTTTTTTAGCCTGAGCACAGTCATTCTCACCTTTTTTAATTCAGAGTATTTACAC TTTTTTGTCAGCGC BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_145132; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_520402
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Phosphatidate cytidylyltransferase 5, chloroplastic from Arabidopsis with 72.33% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019425808.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |