| Id Trinity | TRINITY_DN46507_c0_g5_i5 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_520417 |
| Sequence | CTTTACTTTGGCAAAAATAAAGTTCCCAACAATGACGAGAATGTTCGTTAATGTTGAAAGTTCCGTATAATGTCTGTGCATAATTAGAGGTTAATTAGGT TATATAGGTGTGTATATTTATTTAATATTTTAATTGAATAATCTGCTAAGTTTCAGTTTTATGTGCAAGAATAGTGTAACTGTAATATGATGCATGTAAT TTGGTTTTGTTGCTTTGATGGTTAAAAATTGAGGAAAGTTGAAGTTTATTTGAAAATTTAATTGAATTTAACGGTGAACTAAAAACTTAGATCTCAATGG CCTTTCTAAAGACTAGCTTTATGAATACATTGGTGTCATTTGATCCATAAAGCCACGTCTCTAGCGGGTAAAAGATTTTCTTGCAGCGGAGGTGCTGGTG ACAATGAACTGAAAACTTACTTATGCTTTCATTAACTTAAAACATAAGGAACCAATGAGAAATTATGTTAGATGCATTTCCTATGTTTTATGGGAATGTA TGTATTACAGCTTATAGAACATAGGTACCTAAAGTGAGTGGTCCTAAGAACTTGATGGAAGTCATAATTTTGCCCTTGTAGGAGGATTTACTCCAGAAAT CTCAACAGCAAGTTAGTCAGTTTAGGAACAGAGTTGTTTATGGACTTGGCATTGGGATAACTGTAGGTGGTGTTGTTTTGGCTGGAGGATGGGTTTTCGC AGTGGCCTTGGCTGCTACTGTCTTTGCTGGTGCACGTGAATATTTTGAATTGGTTCGGAGCCGTGGAATTACTGAAGGAATGACACCTCCTCCACGCTAT GTGTCACGAGTCTGCTCTGTCATTTGTGCCTTAATGCCCTTATTTATCATGTATCGTGGTCATATTGATGTTTCTGTGACTTCTGCTGCTTTTGTTTTGG CCATGGCGTTACTCTTACAAAGAGGAAGTGCCCGCTTTTCACAGCTAAGTAGTGCTATCTTTGGGCTATTTTATTGTGGCTATCTTCCTTGCTTCTGGGT TAAGCTTCGATGTGGCTTAGCAGCTCCAGCCTTGAACACAGGTAAGTTACCGTAGTTTTCAGTAGTGTTTCAGTTTTAGTTCTGTCCATTATGGGGCTGG GAAAGAACATATGCATTTCTTTTTAATCAAATAAGAAAATTACCGAAGGCATTCTGTCATTAGTTCTCCACTTCAAGGTTATCAAGTCGAGGTTCATATT TTGAGTCGAGTCAAATCGTGTATCATGCGATACATGATCAATAATTTAAAAATAGATATGTATAGAAATTGAGAAATAATAGATATTAAAATTATAAAGT CATATAATTCATTACTAACCAACAACTAAAAACAGAAACTTCAGTATAACAAAAATTCAAAGTGATAATAAAGACTTATTCAAGTGTCATGAGAAAGAGA GGAGTGCAACAGAACAAAAGTCAGCTTTGGTAACTGAGAACAAAACACAGTTGTGGTATGGTACGGGCATACAGGCAAAGTGTGAAGTTTGAAAGAGATA AAGTGGCGACTCTTGTCCCAATCGAAAAATCCGTCGGCCCAGGTATTTCATTGTCAGCAATTCTTTGTTTACACTCTTCTCTTTAGTTTAGTCTATGGTC TTTAAAAGTGAGACTCGTACGAAAATTCTCTTTGGCCGTTCTGTTGGTTTAGCAACTCCTAGAGTCCCTTACAACTAGTGGACTAAATTTACAACCCTTG TTAACATCTCCTAGTCAAGTTGACTAAGCCAAATATCCCATTGTAACTTGTGCTTCAATGGCCTTATATATACTCCAGCACTCTAGCTATTTTTTTTTCT TGTCTGCAATGCATTAGCATGTTGTGAGGTTGTATTCAAAATTCAAATTTGACATGCCCTACTATTGATGATCTACAGTGAATGATTGCATTGTCAGCCA TTTTATATATTGGTTAATGGTTATATCCTTGTGTGTTAATTCAAACCACATACCACTGATGCTCGATCCTTTAGATAGATTTTTTAACTTGTCTCTCCAT TAAGAACTGTCCTTCCTTGATTGATTATTATTTTGTAGGAATAGGATCAGCGTGGCCTGTACTTCTTGGTGGTCAAGCTCATTGGACAGTTGGTCTTGTG GCAACTTTGATTTCCATGAGTAGCATAATCGCAGCTGATACATTTGCGTTTCTTGGTGGCAAGGCATTTGGTAAAACACCACTTACGCGTATAAGTCCAA AGAAGACATGGGAGGGTACTATTATAGGCTTTGGTGGTTGCATTGTTACTTCTGTTGTACTAGCAAAACTTTTCAGATGGCCGATATCATTGTCAAGGTA CCTACCTGACCTCGAAGTTAATGTCAGTGTGTTAGTGTTACTCATTTAAATTATGATGCAACTATTGTAATTATTTGCCTGGTAAAATATATAAGTAGAA TATTACAAAATATTTAAGAGGGTGAGCCTTGGTGCAATTGCTTGCCCTATGACCTGGAGGTCATGGGATAAAATCCTAAAAACAACCTCTTTGTTTGTAA GGGTATGCTGCGTACGTCTATCCTCCCCAGATCCACTAGATGTAAGCCTTCTGCATTGGGTCAACCTTTATTACATAATATTTACAAATTGCATTGGTCT GATGAGATTATATGATTGTAATTGATCAGTACTGAAGAAATCATATGAAAGTGACTTATGCAATGATCACCTTATGAGAGAAACCTTTCCAACCAGATAA TAAGGGAGTTTCTTAAAAGTTTCTAGACATGCTGGTTCTTGATCTTCATATTACTGCTGTGTTGAGTGTATACAGCATATAATTTTTCTACGTAGAGTAT GTACAGCAAGGTTTGCTATGTGTTGTTCCCTTGGCTCCACTTGTTTAAAAATTAAGATGTTCAAATAGCATCTTTTTTGTTTGATGCAACTTGCAAGGTT ACTTGTTTTCTGGTAATCAGTTAACACGCCATATTCTAGTTTAAGTTGAACATTTGTTGTGCAATTTTTTTTAGCCTGAGCACAGTCATTCTCACCTTTT TTAATTCAGAGTATTTACACTTTTTTGTCAGCGC BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_145132; |
| Additional information | - |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_520417
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Phosphatidate cytidylyltransferase 5, chloroplastic from Arabidopsis with 73.38% of identity |
| Eggnog | phosphatidate Cytidylyltransferase(COG0575) |
| Kegg | Link to kegg annotations (AT3G60620) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019425808.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |