| Id Trinity | TRINITY_DN46516_c0_g1_i4 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_521605 |
| Sequence | GTAAGAAACAGTCCAAGGTTGAAAGGGCAACACAGGCTTCATTCTAGGAACATGAAGAAGTGGAGCTCTACTGTTCCATGTTCATAACAACAACAAAAGA TGCCTAGAAGGACCACCAACATAAAACACCTGAGTAACCGTGTAGGTTCATTATGGATGCTTACGTCACTAACTCTGTTCCTCTTACGTTAACTAAAATC AAACTTATCCGTTTTTTTATATAAAACCCAACAAATAATAAAAATGTTCCACCGAAGAAAAAAAGAACCTAGTAGCTTGTTATCTCTTTCAGACTCAAAC CCAGATTTAGAGATGCCAATTCCTCCTTCTCACAGTTCCAGTTCTTTGAGAAACTCAACAACAGCGTTTTTCTCTTTCACTCTTTCATTTAAATCCTTCC TTTTTATTCTCTCCCTTCTCCTCAACCTCTACCTTTTTCTAATCCTGTGGGCCCCATCCTTTGTCCCTTTAAACCCCACCCCAACAACCACGCGCGTGTC ATCCTTCACCCCCACCACGCGCCGTCATATTCTCTTCGCTATCGCCTCCTCCTCCCGATCCTGGCCCCGCCGCCACCCATACCTCCGCTTATGGTATTCT CCCAATAACACACGCGCCGTTGCCTTCCTCGACTCTCCCCCTCTCAACAACACTTCTTCTTCTTCCTCCTCCCTCCCGCCGGTGATCATATCCGGTGACA CATCCGACTTCCCGTACACCTTCCACGGTGGTCTCCGCTCGGCGATCCGCGTCGCGCGTGTCGTCAAGGAAGCAGTGGATCGCAACGAATCGGACGTGCG GTGGTTCGTGTTCGGCGACGATGACACAGTGTTTTTCGTGGAAAACGTGGTGAAGGTTCTATCGAAGTACGATCACGATCAATGGTTATACGTAGGGAGA AATTCGGAGAGCTACGATCAGAATGTGAAGTATAGTTTTGAAATGGCGTTTGGGGGTGGAGGATTTGCTATCAGTCACTCGCTTGGTCGGGTTTTGAGTA GGGTTTTGGATTCGTGTTTGAAACGATATGGCCATTTATATGGTAGTGATTCTAGGATTTATTCTTGTGTTGCTGAACTTGGTGTTGGATTAACACATGA ACCTGGGTTTCATCAGGTAATATTTCTTGTTCATTAAAAACAACTTCCTTAAAATTTAATAATTGTGTTGATTTAGATGAGATTTAATGTATTTTTTTTT CCTAATATATTCTTTCTTTCCGTGGTCATTATTTGCCCCATACTATTTACCTGAATCAATAATGATAACTTGTGATGATTTTAATATGTTAACTTTGATT CTTATCCATGTGCGTTGTTGGGTTCATTTACTATTCTGTTTTACTAGTGTTGAACTGACCAACAATTAACTCGATATTTGTGCCCATAATTTGTGGTGAG ATGTATTTGGTAGACATGTTATTAAGAGACAAAAGGTACGGGTCAATATAACTATCGGAATTATATAGTGGGACATTTTGATCATTCCACTAAAAAGGTG AAACCCAAGGGAAGAAAACAAAAAACTATGTTAACACTACCTAAATATCGAGTTGAGAGGTTCAGTGATTATGTAGTCAAATACTCTATGGGTTGCTTTC CACTCTCTTTTGCCCTGCTTGTTTGAGTAGTTGAAGAAGAGGAAGATGGAAAATGAGGAGGGTATTGAAATTTGAGTGGGAATAGAAGCCTTAAATCGCT CTTTGTTGTTATCTATGACTATGAGCAGTAGCTGAGCTTTCTGGTGCACATCTGGGTGATGTTCGGCCACTTTCTTTGAGATGTGGTTATTCTTTCTGCT ATGATGTTGCAATGTGCTGAACTGCTCATGGATGATAACTCATTGCCATTGATAACTATTCATACTAGGATGTTGGAAAATATATGTAGAATTGTAGATA TAAGAGCTGTTTTCAATTACAAAAATGACGACTAACGTTTTCAATTTTGCTGCGGTTGCATTCGGGGCTTGTCTGCGGCATATGTACTTAGTATTAATAC AAAAGTAAATAATACTTTTGTGTCATGCACATTTGAGGTATGCAAGGGATGGTATTTTGATACCTCTATTGATTTGGCTTGATATTTTAACTTATTTTAT TCTTCAGCTTTTCAAACAAATATTACAGGCATTGTCTGAATAATGTTGTTGTGATTTTAATTCTGATTACTTGCCTTCCTTAATTGTGGAATGTGGAGCG TTCTTTATATTTCGATTCAAGCCTGTAACTCATCAAAGTTATGCAACATATTCTATGGATATACTGACCCGTTTAATTTTTTTTACACCAGTTAGATATG CGGGGGAATTTGTTTGGGATGCTGGCTGCACATCCCTTATCTCCTTTGTTGTCCCTTCATCACTTGGATGTGGTGGAGCCTCTCTTCCCTAACATGAACA AAACACAAGCTTTGAAATATCTTATGGCTGCTGCAAACGTTGACCCTGCCAGGATCTTGCAGCAAACTGTCTGCTATGATCAATCCAATTCTTTGACTTT CTCAGTTTCTTGGGGTTTTGCTATCCAGCTTTATCAAGGCAATGAACTTCTGCCAGATCTCCTTTCACTACAGAAAACTTTTGTTCCATGGAAGAGGGGT AGTAAAGTTGATGCCAAATTTATGTTTAACACACGAGACTATCATAGAGATCCTTGTAAAAGACCTTCTGTCTTTTTCTTCAAAAGTGTGACATCTGATG AAAGGGGCATTTGGAGCAGTTACGCTAGGCATGATGTTGAAAACTGTCTTGAATCATATCCTCTAAAACAGCTGAAGCGGATAATAGTTTTTTCAAAGAA GCTAGAGCCTAATATTCAACAGATGAAAGCTCCTCGTCGTCAGTGCTGTAATGTTTTGCCATCTTCTAATGAGTCAATCAGTATTCATATCCGACAGTGT GGAATGAATGAACTGATCGCCATGCGATTGTAGCATTCTTTTAGAGAGTTGCCTCCCTCAAAAGCTTTGATTTTTTCATGAGTGTGAATGTCTGAAGAAT TTGGTCGCATGTTGAAGCTGCCACGAGGTAGGTGCTTCTTTTTTAGGCTGATCTTAGATTTTTCAACATCCTACTCTTAATTTTGATCACGGCTGGAACA GAGCTTCATAAGTTTTATTATATCATTCAACAAGGAATATCTTCATAGGAATCAAGCTGTATGTTTCTCAGCTTACATTTCTGAAGTGAAAATATTCTTA TTAAGCTTTCTTTTCCCTTTCTTTTTTTGCAGTACAGGAAGATCCTTGCCTCTTCGTAGAAGAACAGCATGTACTTGAATATGACCAAATGATCTTGGTG GTGTTCAAACTCTTGAGCAGGTTTTCATTCTTGTGGCGAGTGACGAACCTCTAACAACTTAGATGTGCTTTTCCAATGGTGAATTTCCCTACAGATGTAC ATAACATAACATTTTATTTGCCTCTACTTCTGATGAACAAAATCACAGGGAGGTCAATGTTGTTTTAAGAGTGAGGTAACCTCTCAGCCAAGGACCAATC TTTTGCTACTATGGAATTTGATCCTAATGACACGACCATGTGTCAATGCATGCTACATGCTAACCAGGAAATGGTCTGAAAGTTCTGTAAAATTTGTACT ATATATAACAATTTGCTTGCTGCATAGTTCTTTCCATCTATATTCATTGAACAGTGTGCTGCTACAAGTCTTTTTCAGTGCAAAGTTTAGTATTTTTATG CATTAAATGAAGAGAAGTTCTTCAATTCACCAAACTCTTTCTGATGTATGGATTATTTTTTATGAAACTTCCTCCCTGCCCTAAACACATCCTTCACCAA CACCCCATCCCCACCGCCCTAACCATATCCAGCCTTATCAAAGACCCGCCCCACCATTCGCCACCACCACCACCTTCATGCTATCATCGTTCTCTCCTAG CAGCAAACCACCCATTAACTTATAAATAAGGAAACATAATTTATTTAATGCTATCTAGATATTATAAACTAACTTGTATTTAAGGGGAAATCTTTTAAAA TGAGACTTATAAATCGGGAGAGATGAATGCTTATTTTTGTGCATTACTCAAGAGTAGCCATAGT BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_145187; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_521605
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | - |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019448957.1) |
| Pfam | Protein of unknown function, DUF604 (PF04646.11) |
| Rfam | - |
| GO | - |