Ll_transcript_521062

• Id Trinity: TRINITY_DN46534_c4_g1_i11
• Name Transcript: Ll_transcript_521062
• Sequence: AGATATTTGAGCAGGAGTTAACAAAAAAATAAAAATAAAAAGTAGTTGAAGGGAGAGGTTATGGATAAGTGTTGAAACGAAGAGGCGGAGAGCATATTGA GTTGCAGATATTATTTTTTTGCGTGAGGGATAATTCCAACTGCAATGATGGAATCATCAGTTTTTGTTTCTCACGTGGACACACTCCGGCTCCTAGCCGC CGCTATTCCCTCCGCCACTCACCGCTCATCTTGGACTGTTTCCCGGTGCTTACACCGCTCTGCCGCTCCTCTTCCCACCCTTCGTCTCTCCCCGCTTCTC GCTTCCAACACCCTCACCGCCAATTCCGCTCCAAAAAGTGGAGTGTACACTGTTGGCGACTTTATGACAAAGAAACAGAGTTTGCATGTAGTAAAGCCTA CAACATCTGTTGACGAAGCTCTGGAACTTCTTGTGGAACACAGGATAACTGGTTTTCCTGTGATTGATGATAACTGGAAACTTGTTGGTGTTGTTTCAGA CTATGACTTGCTAGCTCTGGACTCCATATCTGGTAATAGGCAACAAGACAATAGCATGTTTCCAGAAGTGGACAGTAATTGGAAAGTATGTTTAACATTC TTTCTCTTTGATAGTTAATTCATCTTGTATCATGGACTTTAATGCACTCATTGGTAGGATAAGACTAGTCTATGGTTTTTATACTTAAGATTACTAAACA AGATGAGTTTACTGAAAATATATTTTGATAGTTGCCCAACCTCTTAGGGAGCTGGAGTAGTCTTGTTCAGAAATGCAAAATCTGTATGTCACTACTGCTA AATTTGAAATACAGCAGGGTATTCAAACATTCATACTAGATGGTTTCTTATACGATGTTTTGCAGTTTTCAACTCTTATAGTCACCGTCTCCTTTCGAAA GAAACACAAGAATCAACGTCTATTCCCATTAGGGGGTGACTTTAGCTATATATATCAAACCATGCAATTATCTTCTATCAAAGGCCAAACGTTCTTATTG TTCATTTAGTGCTAACTGCTAAGTCCTTTGTAATGGTTTCTCACGATTCTTGTATGGTAGTAATGAATATTTATAGGCTGTGGAACATGCCACAGAACAA AAGTAGACGTGCTGTGTGTATCTTGACATGTTTTGTGTCTTGCCTACTCCTTTTAATTTTAATGTGTAATATATGGGAATTTTTATCGTGCCTGAGTGAA GAAAAGGAAATTTTTTATAGGGAAACTATGTATATTAGTTTAGATGTATTAAAACATAAATTTCGGATAAAAAACATTTTTTTTTCCTGAATAGGTTTTC TAAGTAGTTAGCATTCTCCTTGTTCTCATTAGGAAGGGTTAATTTCTAATGTTATTGAAAGCTGTGGGCATGAACGTCAGTTACAATAAAGCAAGATCAG CTTCTTAGAGGGAATGTTAATGAAATATAGTTAAGCGAGCTAAGACAAAACCCTGTGTTTGAAAATGGTGTGTACAAACACAGTAAGAATTTAAAACTGT GATTTGCAGTGTTTTTATTTTTCTATTCCTTAATCAATGCCATAAATACTAATAAGGCACAACGGAAGGGTGCTGCTAGGTTCATTAATGCCGTAAATAC AGTAAGAACAAGTTATTCAGGAAGGGTGAGAGTCCTAGTTAATTAGAGTTTGAATAAAGTGAAGTTCACTAATATGATTGGAGTCCTGCAGACTTTCAAT GAGATTCAGCAACTGCTGAGTAAGACCAACGGAAAGTTGATCGGTGAAGTAATGACCACTTCCCCTATGGTTGTTCGAGAGACCACCAATCTCGAGGATG CTGCTAGGTTCTATCTTTTTCCTTATTCTCTAGTTAAACATTCCTGTCTTTTTTCAACTGTGTTCTAGTATTTTTTGTAAGCTGCCACATGAAAATGTGA CCTTATTAAATTTTAATCTTTAGGTTGTTGCTGGAAACAAAATTTCGACGCCTTCCAGTTGTAGATGCCGATAATAGGCTCGTAAGAGACTCCCCCATTC TATTATCTCTGGTTTCTTTATCCTAGCATTTTTAAGGGGTTATTAGCCGATCCCACTTAGTAGGATCAAGGTTTGGTTGTGTTGCTGTTTCTAAGGGGTG ATTATTACTGATCTGCAGGTTGGGATTCTCACAAGAGGAAATGTGGTGAGAGCCGCACTTCAAATTAAACAAGCTACCCAAACGACATAGGATTTAGAAA ACCATTAAAAATGGTGCTGGGTTTCGTGCTGTAGTTAATTTAAGTGTTACCAGAAGCTAGCTTCAATTGGAATTAAAATTTTAGCTTAGACATGTGAATC TTATAATATTGTTTTACTGTTACACGAATGCTTGTCACTGTCAATATTTCTAATAGGCAATTTGTATCGTGAAAGATCAAAATGTCAAATGGGTTGAAAG ATTTGTGATTAACCAATTTAATATCTCGGATTATGTTTATAAATTAAGCCCCTTAAATAGTCATATTTGTATTATGTTA
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_145306;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_521062

FPKM

• PAB: 1.3
• PNAB: 0.4
• PS1: 0.2
• PS2: 0.1
• PS3: 0.1
• PW1: 0.2
• PW2: 0.5
• PW3: 0.8

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_521062

• Blastp: CBS domain-containing protein CBSX1, chloroplastic from Arabidopsis with 76.84% of identity
• Blastx: CBS domain-containing protein CBSX1, chloroplastic from Arabidopsis with 76.84% of identity
• Eggnog: (CBS) domain(ENOG4111TWY)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT4G36910)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019420202.1)
• Pfam: CBS domain (PF00571.27)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;