Id Trinity | TRINITY_DN46548_c0_g1_i1 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_521451 |
Sequence | ATTTTTGGTTTCGGGCTTTGGAGTATCCAAGATCCGAGAAGAGAGAGAGTGATATATACCCAGAAAGCCTCCACAATCCAACGATGGCCGATTCTGAAGC AAATTCGAAAATGCAAACCGAGAAGAAGACCAAAAAACGAAACCAAAAATTCGACGCCAAATCTCAAAAACCTTCCAAACTTCAAAAAACCGATTCTTCT TCTATTAAACTTCAAGACCTTCAATCTCCATGGAAGAATCTTCAATTGATACGCAACATCCAAGATAAACGCTTTGATCCTCAGAGTAAGGTCATTTCAG CTTTCAAATTTGTGCATTCAACATTGCATGAGGATAGTGATCAGAGCTCTGAAACTGTTAAATTACCTAGACTACTTTGTTTCCTCAATGATTGGGTACA GTCACTGTTGTTCCCGCCAAAAAATGGTAACATACCTCAGCTTGAGGGAATCCATGCGTATATGGATCTTCGTTGTTGGGAGATATTCAACTTCTGTTTG CGGGAATCTTTGAAGTTTCGCGTAATTTTGAGCATGTCGCAGAATCTCTTAAAACCTTTCCAATTGATTGCCAAAAATGCTCTTTCACTGTTAGATGATT CGTCTATAGGTTCAGGGGGATTTTCTATATCTGATGAAAGATATAAGCTTTATGACACTGCACTTGATTGTCTTTCGTTGGTGTTCTCATCCCATGGTGG GGTTTCGAATGAAGATTTGATGTCGTGGATTGACACGGCAAAGCCAGGGCTTGAACTTGTGTTGAAGATTTATAGCTTGAAACTTGATGACAGTAATTTG GGTACTTTTGCACTACGCTTTCTGTGGTTGGTACTTCAGCCATTCTCAAATTTTTTAAATGTGCATCCAGCAAGGAAAGGTAATGCGTTTCGTGACTTTG TGCATGAACTTCTGGAGCCACTCTTGCATTTGTCGGGTGAGTTGACTCTTCGGGTTAATGGAAGTAATTCCATTTGGACAGGGAGGTTGATCAAGGTTGT GAAGGAAGTTCTTTCTCATGGACTGTTTCATCCGGTGCTCATTGGTGAATTTCTAAGTTTGCATGGTTCAGAAAAATATGTTGATTCATGTGATCATAAA CCAAATGACTCAAAAGCCACTATTCAGAGTTATCCTAAACATTTATTTGATGTACTGAACAAAATAATAGCCATAAAGAACGCTACGGCAATGGCTAGCA TGGGTTTGTTATTTCGCTTGTTTGTTAATTCAGCTAGAACTTTCAAGGGAACTTCAGTGTTGTATGAAGAGACCAAGACACCAGAAAAAATGAATGGTGT AAGGCAGCCGGTGCCAGGAGTAAATAGTAGCTCAAATAATATTTCTACAGACACCCAAAAGTCACTTCTTAATATTTTTGTACTGATGATGGAGCCTCTT TTGCTTAAGGTTAATGCCTATTTCCAAGCTAAAGTAGATGCCAAACACCAATTGTTGGATCTTTGTGGGATACTCAAGTCAATTGGTAGTTTGCTTTCTA GTTTTATGCAAGAGAAGGTGTATATGAGAACAGAGGACACATCTGGAGGAGCTTGTCTCAATTTCTTGAAGAAAGTATTTAATGCACTGATAACTAGTTC CACTAGTGTACTCTGCTTGTCCCACTATGATATATCTAACAGGACGGAGATGGAAATATTTATATTGTCAGCTAATGAAATACTAGTTGGTATGGGACAT CTTTTGGAAATTGAATATGAGGTTATTGGAGAAGATTTGGTCAAGTTATGGCTGATTATATTGTCATACTCGGCCATCAACTGTGATTCGGTGAATGGCT TTGATCAATGCTCATTATCTTCCAGTATACCGGCCCTGGGGTGCCAAATAATTAATCTCTATGGTCAACTTCGTCAGGTGAAAATTGCTATTTTGGCATT GTGCAAAGCAATAAGGCTTATTGTGTCTCAGGAGGGCAATGCTGAAGAAGGTTCTTCCAGGCTATTGACATTTCTGTCTAATGAAGTTTATTCTGAATCA GTTGAAAGGCTGTTATCTTCACAGAAGTTCACCCATGTCATTTATAAGGCCATTGAATCTATTCCAGAAGGGCAAGTGAGTGATTGTATTAGACAGATAA CAGATGATATATCAGAATCTCTTAGGTGGATGAAAGACTTCTCCCCTTTGGTTGATGGCAAAAAAATTAGAAAATTTAATCTGCAAATGGAACTCTTGGG TAGAGGGCTGTGTAGACTATATTGTTTAGTGCTTGATTCAGTCACTATCACTGAAGGCAACAGCAATCTTCTTGGAGTTGCTGTAAAAGAACTAATGGCA TTAATGCGTCCCTACTTGAGTACTCTAGTTGGACAACAGGCAGATAGTGTCTACAACTTCCTTTCTTCTGTCATGAGTGAAACTGATGATATGGATGTTG GTAAGAGAAAAGTTTTGAAGAAATTTGGCAGGTCTAGTCAATGGGTTGTTGTCTTCTTTTTTCAGTTGTTTATGTCCTGCCGAAGCTTACTTAGGCAAGC AATCAGCCTTATGCCTCCAGGTGTATCTAAGAAGGTGTCTGCGGAGGTGGGGGATTACACAACATATTCTGCCTTTGAGTTAATGAAGAGGATTGATGAC ATAGACATCGTCTATTTTTCTTGGATTGTTCAACCTTCTGATTCCCTTCTTGTTGTTATGCAATTTATTTCAGACATATATCTTAAGTATGACTCAGATG ATTGTTGTCCTTTGATCTATATATTTCAATCTATGGCTCTTCAGAGGCTTGTTGACTTGAATAAGCAGATTGTGTGCTTCAAGTATTTGCAAAAAAAGCG TTATAGATCACGAATCGAAGCTCTGAAGGAAGAGGCGGCCGGACTTACTAATTTTATGATGGATAACTTATCATGTTTATATGAATCCCCAATCTTTGTT TCTGATGATGTATTTTGTGAAGATGTAATTTCTCTGGCTCCTCAAACCAATGGATGGAATCAAGGTGTTTATGTTGCAAATAAAAAATCATTGCCAACAG CCATTTGGTCAAATCTCTGCAAAAATTTTGATATTTGGGGAAATCATGCTTCCAAGAAGCAGTTGAAGAAATTCCTGTCACAATTGCTTCATACTTCCCT TCACCATGCAACAAGAAATTCCCAACAGCTAGGCGTGCAAGAAATCGATGAGTGCAAGCCGCTCAAGAGAGTCAGTTTGCCACAAATGTTGTCGCAACTT CTAAGTGATTCTGTTCTGTATGAACAAAAATTTGCTCACAGGAATCTGGCCTCGATATTTTGCGGTGCTTTGGAGAAATCTGTACTGCCGTTATTCAGCA ATATTGCATGTAATGATCTCAATCTTCAGTCATCACCGGATTGGCCCACATTTTTTAGTGTCATTGACAAGGCAGCAGATATCAGTAGAAAAGAAAAGCC ATATGCTCTTACAGACAAAAGTTTTACCGTTGCCCACTGTTTGCTTAATCTATTATGTTGGACACCAGATATAAATACCAAATCATTTTCGCATCTCGTG ACTTGTATTTTCAACCTTGAACGGCTTCTTGTCAGTGCCTTACTATGTTTCCAGAGCACAGGGTTCCAGGACTCTTGTGAGTATTTGAGATTATTTGTCT CTTGTCGGAAGGCCTTAAGATATATAATAATTGGATATTGTGAGAAAACAGATGCTATCCAATCCTCACCAAACTCAATAATTTCTGAAAGTTCATTTCC TGCTTTGTGGATTTTGAAGTCTGTATCTGTGACTGTTCGGATTAAAGAAGCATTCTCAGCAGGAAATTCTATTATGTTCAAATCTCTGATGTTTGCCTTA ATGGACCATACATCATATGTCTTATTGGGGATAGGAAAATATCAAGTTATTCATGCATTTTCCATTGGTAAAGAAGGTGAGGAAACTTGTGAAGAGAACC CCAATTATAGAATTAGCCATGAAGAGAATCATTTGCTTCCATCTCCTCAGGATGTAGATTCCCCCAAGATGGAGGCATTGAAATGTTTAACCTTGATGGC AGAGAATTTGAAAGAGCAGATGCAAGGCTTGCCTGTTTCTCTAAAGGATGCCCATTCTTTTATCAATGTGGGATTTGATCTAGCTTCTGAAAACGTTAAT GGACTGTCTTCTGCAGTTTCTTGCTTAAGTGGATTTTTGTGGGGCCTCACATCTGTCAAAGGACAAACAGATGCAGAAGGTAGTGATCATAAAGAAGTGT TGATGAGGAAAAATGAACAAGCCTCTGAAGTAAATAGTTCTATTTTTCCTCTTGTGGAGCTTGTTGATTTTTTTGTAAACAAATTACTTGTCAAGAGTAA TCAACTCTCAAATGACAATGCCTCCAAAAGTGCCAGTGGTCTTGAAAGAATGTCTAGCCTAGAATGTAAGAACTCTATTGCCAGTGTTTTGGCTAGGGCT GATTCCCCAGAGCATCAGGATCTGAATAAACCTTTGTTGAGAAGCTTGCTAAAAGGTGATCATCCTGAAGTAGCCTTCTTACTTAGGCAATTATTTGTTG CTTCCTCAGCTCTTTTGAGGCTAAATTTACAGAAAGATGAATCTTCCTTGCTTTCAAGTTTTGTACCTACTTTCATTGAAATTTCTCAAGTCTTATTACT ACAATTCACAGAGATGGTTGATGTCCCACAACAATCAGTTTTTCTTTTGTTAGATGGTGTTCTGAGCTATCTAAGAGAGTTAGCTAGTTATTTTCCTTTA ACTGATCCTACCTCAACTATGAAAGTGTATGCAAAATTGGTACATATTCATATGAGGGCAATAGGCAAGACCATATTGTTACAAGGAAAAAGGGCAACAC TGACCTTTCATGAAAGACAGTCAAGTACGAAGACACTTCATAAAGGATCATTTGAAGCTAATTCTTCTAACGAATTTTACTGCTTTTACTTGGATGAATT TAAAACTAGGTTGCGGATGTCATTCAGAGCATATATAGAGAGGCCATCAGAGTTGCATATTTTGTCTACTATACAAGCTATCGAGAGAGCTCTAGTGGGA GTAAAAGAAGGATGCACTATGATCTATGACATAGAAACAAGTAAAGATGGTGGTGAAATTTCGTCCCTTGTTGCAGCTAGCATTGATTGCTTTGACATGA TTCTTGAATTTGTCTCAGGTTGGAAAGGCCTGAAGCTGATTAAAAGACACTGTCAGAGTTCAGTATCTGCTGTTTTCAACATTATTATGCATTTACAGAA CCCAGTTATTTTTTATGTGAACAAGACTCCTGGAGCAGTTGCCAGTAATCCAGATCCTGGGTCAACCATTCTTATGTGTGTTGAAGTACTAGTTACAGTT TCAAGGAAACATGCTCTGTTTCCAATGGATGTCTGGCATGTGGGTCACTTGTTACATATCCCTGAAGTAATCTTTCAGAATTTCCACCAGCTTAAAATTT CTAAAGATTCTGGTCTATCAAATACGTTGACAATTTCAGAAGATAAAATTTCTAATCCAGTAGAGGCAGTGAACTTTTGTCATGTAGATCATCGCTTCTC AATTGACCTATTTGTTGCTTGTTGTCAACTATTGTGTACCACTATTAGACATCGCCCAAGTGAATGTAAGCAGTGTATAGCCCATCTTCAAGCTTCTGTT GCTGTTCTACTTAATTGCTTGGAGACATTAGTGGATAATAAATTAGCAGGGAATAAAGGTGGCTTTTCATGGGAAGTAGAAGAGGGTGTTAAATGTGCTT GTTTTCTGAGAAGAATTTATGAAGAGATAAAACAGCAAAAAGATATATTTGGCCGGCAATGTTCTCTGTTTTTATGTAACTACATATGGATTTATTCAGG ACATGGTCCCAAAAGAAGTGGTATCACAAGAGAAATAGATGAAGCTCTGAGACCAGGTGTCTTTGCTTTAATAGATGCTTGCTCAGTGGATGATCTTCAA TATCTTCATACTGTTTTTGGAGAGGGACCTTGCAGAAATACCCTAGCAAGTCTTCAACATGATTACAAACTCAATTTCAAGTATGAAGGAAAAGTGTGAC TAGGAAATCTCTTTGCTGTGTTCTTGTTGGTGACCTTGATTCTTCTATTTATACCATGGTTCTTCTCAAGTGAACCAGAGGCAGAGGAAGTGATGGACTT ATCCCCATTTGTAGCACCAATACTGATAGTAGTAATTCTCCTTTTGATCACATTTTTGGGAAGTTCATGAATGAAGGTTTCTGCCAAGCCACCATGTGGA TGTAATCATGCTTGCTACATTTTTGGTGACATTTTTTTGGTACTACCAACAATATTCTCTTATCTTTTTATGAGTTATGGGTATTTCATGGCATGTATAA ATAAGTTGAGCATGCAATTTATTAGCATATTCCATTCCTTCATAGGAAAACCATAGAGATGGAATGATTCTATGTTACAAATGTATCACCAGATAGCAAC AATTATAATTTTATTTAATTATTTTATTCTTATGGGTCAAGTTGCAGTGTAATTCAAGCAAGTTATATTTTTATAAGATTGATATTTTTT BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_145418; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_521451
Blastp | - |
---|---|
Blastx | - |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0001776) |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019412690.1) |
Pfam | Urb2/Npa2 family (PF10441.8) |
Rfam | - |
GO | - |