Id Trinity | TRINITY_DN46563_c2_g1_i11 |
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Name Transcript | Ll_transcript_522295 |
Sequence | AGAACATCGATGCACTGAACCCTAACGAAAAATGCCTCCAAGGAAAAAATCCAACGCTTCTTCTTCCTCTTCCTCTTCCAAGAAACCTTCCAAATTCGGC ATTCAACACTTCTTCGATCGCCACACCGCTTCTCAGCAGAAGATTCAGCATTCCAATGATGCAAACCCCAACACTGCTTCCGATTCCAAATCAGCCACTC ATTTTACGGTTTTACCCTCGCCGAATCTTCCAGAACCTTCTGGATCGTCGAAACCAGGATGTGTTGCTCTCAGAACGGATGCGCTGGATGTTTCGCATAG CAGTGGTGGTAGTAGCAGTAACAATGATGTTAATCGGACGGCTGAGGTTACTCCGCCGGAGAATTTGGTGTTGCCGGGGATTGGTAATGTGGCGACTGAG AGTTTCGCGGCCGAGGAGTCTCCGGAGATGTCTAAGTCTGTGTCACTTAAACGCTTCAAATTCTCACCTGGGATGTTTATAAAGCAAAGTCAGGATGACG GGGCTGATGAGGTTACATGGAAGATATCTCCAGTGAATGAAAGACTCCAAGCAGTTTCGAAACAGATGCCTGCGATAATTAAAGCACTGTCTGACACTTC GAGAATCAACTTGCTGCCACTCCGTAGCTGCTCAGAAAATAAGGATTCTCTTGATAAAGATGGAAAGGTTGAAAAGTTGTTTACTTCACCTCCTCCCAAG GCTTCTTCAAAAGCTCTGGTGTCAATGAGTAAATTAGGGTTGAAAAGGATAAACCCAGATCGTGACGTGGATTCTAATATCAGTGCAGGTGCTGTGAGTA ACTCTGGAGCATCTAGAGGAGAGAGCCCCTTCAGAACTCCACCATCTTTGTCTTATTGCTCTGATAAGCTTGGCAAGGATATTGAGCACAGTGGACCACC 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CATTGAGTTCTACATTGCTTGCCTCATTGTCACGGGTCAAAGGTAACCCACATCGATTGCCTCATTGTCTTAAGAGTGGTTCAAATATCTGTTGGGTTAC TCCTGTCATTGCTTTTGAGATGTATCCTTGACATGTTCCAAGTTCCAACTGCTTAACACAACACTTCTCTTTTATCCAAACTTGGGGACTGCCTTATGTA CAGAACGACAATAAAGCATGATATAATAAGGGCTAAGAAAAACAATAGTTTATGTGGATGTATTTATGCTTCAAATATTGTTATTCCAGGTATCCTTGGG CCCTCTAACTTTTGCTTCGGTGTTTGTACTTGTTGGGGATCATTATCAACTACCTCCACTTGTCCAGAGTACAGAGGCACGAGAGAATGGCATGGGGGTA AGTTTGTTTCGTAGACTCTCAGAGGCACATCCACAAGCAATTTCAGCATTACAGAGTCAGTACCGGATGTGTCAGAGCATTATGGACCTGTCAAATGCCT TGATATATGGTGACAGGTTGAGGTGTGGTTCGTCCGAGATAGCTAACAGAAAACTTGAATTTTCTGACTTAAAATGTGGTTTTCCTTGGCTAGAAGATGT TTTAAGCCCAAGCAGGCCAGTGGTATTTATTGATACTGGTTTGTAAATATCATTTTCCTTTTTCAGCATTGATCGAATAGGTCATTGTGGATAGGTTTGA TTATATAATTGTTTGTTTTTTGGGGTTTTAGACATGTTGCCTGCTTTAGAGACAAGAGATCAGAAGATTATAAAAAACCCTCTTGAAGCTCACATAATTG CCGAGGTTTCAAAGGAATTGGTCAACAATGGGATTGCAGTAGAACAAATTGGTGTTATTACCCCCTATAATGCTCAGGCAAACCTCATTCGGCATGCTGC TTGCATGACTTCCTTGGAGATACATACCATTGACAAATACCAGGGTAGAGATAAGGATTGCATTTTAGTATCTTTTGTAAGGTCTAGTGAAGGCCCAACA AGCAGTGCTGCTTCTTTGCTTGGAGACTGGCACAGGATAAATGTGGCTCTCACTCGTGCAAAGAGAAAGTTGATCATGGTGGGGTCTCCTAGAACTCTAT CAAAGGTTCCACTATTGAAGCTTCTCATTAAGAAGGTTGAGAGGCAGTCTGGAATTCTAAGTGTCTCTAAGAAGGACATCTTTCAAACAGGTGAGCTTAA GAGATGTTCCCAATTGAGATGAGTGAATATTCTTTTCCCTTTATTAAGAAAGGTTGTGCAATTTTGTTACTATCACCCATCAAATGCCATGTTTTAATGG TGATTTTGATTTAGAAATGTAAATATAGAATATTTAATAAGATAACCATTCTTTTA BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_145520; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_522295
Blastp | DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2 from Xenopus with 31.92% of identity |
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Blastx | DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2 from Xenopus with 31.92% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | Link to kegg annotations (378492) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019452537.1) |
Pfam | DNA replication factor Dna2 (PF08696.10) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |