| Id Trinity | TRINITY_DN46563_c2_g1_i2 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_522284 |
| Sequence | AGAACATCGATGCACTGAACCCTAACGAAAAATGCCTCCAAGGAAAAAATCCAACGCTTCTTCTTCCTCTTCCTCTTCCAAGAAACCTTCCAAATTCGGC ATTCAACACTTCTTCGATCGCCACACCGCTTCTCAGCAGAAGATTCAGCATTCCAATGATGCAAACCCCAACACTGCTTCCGATTCCAAATCAGCCACTC ATTTTACGGTTTTACCCTCGCCGAATCTTCCAGAACCTTCTGGATCGTCGAAACCAGGATGTGTTGCTCTCAGAACGGATGCGCTGGATGTTTCGCATAG CAGTGGTGGTAGTAGCAGTAACAATGATGTTAATCGGACGGCTGAGGTTACTCCGCCGGAGAATTTGGTGTTGCCGGGGATTGGTAATGTGGCGACTGAG AGTTTCGCGGCCGAGGAGTCTCCGGAGATGTCTAAGTCTGTGTCACTTAAACGCTTCAAATTCTCACCTGGGATGTTTATAAAGCAAAGTCAGGATGACG GGGCTGATGAGGTTACATGGAAGATATCTCCAGTGAATGAAAGACTCCAAGCAGTTTCGAAACAGATGCCTGCGATAATTAAAGCACTGTCTGACACTTC GAGAATCAACTTGCTGCCACTCCGTAGCTGCTCAGAAAATAAGGATTCTCTTGATAAAGATGGAAAGGTTGAAAAGTTGTTTACTTCACCTCCTCCCAAG GCTTCTTCAAAAGCTCTGGTGTCAATGAGTAAATTAGGGTTGAAAAGGATAAACCCAGATCGTGACGTGGATTCTAATATCAGTGCAGGTGCTGTGAGTA ACTCTGGAGCATCTAGAGGAGAGAGCCCCTTCAGAACTCCACCATCTTTGTCTTATTGCTCTGATAAGCTTGGCAAGGATATTGAGCACAGTGGACCACC 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| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_145520; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_522284
| Blastp | DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2 from Xenopus with 32.78% of identity |
|---|---|
| Blastx | DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2 from Xenopus with 31.66% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | Link to kegg annotations (378492) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019452537.1) |
| Pfam | PD-(D/E)XK nuclease superfamily (PF12705.6) |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |