| Id Trinity | TRINITY_DN46563_c2_g1_i6 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_522289 |
| Sequence | AGAACATCGATGCACTGAACCCTAACGAAAAATGCCTCCAAGGAAAAAATCCAACGCTTCTTCTTCCTCTTCCTCTTCCAAGAAACCTTCCAAATTCGGC ATTCAACACTTCTTCGATCGCCACACCGCTTCTCAGCAGAAGATTCAGCATTCCAATGATGCAAACCCCAACACTGCTTCCGATTCCAAATCAGCCACTC ATTTTACGGTTTTACCCTCGCCGAATCTTCCAGAACCTTCTGGATCGTCGAAACCAGGATGTGTTGCTCTCAGAACGGATGCGCTGGATGTTTCGCATAG CAGTGGTGGTAGTAGCAGTAACAATGATGTTAATCGGACGGCTGAGGTTACTCCGCCGGAGAATTTGGTGTTGCCGGGGATTGGTAATGTGGCGACTGAG AGTTTCGCGGCCGAGGAGTCTCCGGAGATGTCTAAGTCTGTGTCACTTAAACGCTTCAAATTCTCACCTGGGATGTTTATAAAGCAAAGTCAGGATGACG GGGCTGATGAGGTTACATGGAAGATATCTCCAGTGAATGAAAGACTCCAAGCAGTTTCGAAACAGATGCCTGCGATAATTAAAGCACTGTCTGACACTTC GAGAATCAACTTGCTGCCACTCCGTAGCTGCTCAGAAAATAAGGATTCTCTTGATAAAGATGGAAAGGTTGAAAAGTTGTTTACTTCACCTCCTCCCAAG GCTTCTTCAAAAGCTCTGGTGTCAATGAGTAAATTAGGGTTGAAAAGGATAAACCCAGATCGTGACGTGGATTCTAATATCAGTGCAGGTGCTGTGAGTA ACTCTGGAGCATCTAGAGGAGAGAGCCCCTTCAGAACTCCACCATCTTTGTCTTATTGCTCTGATAAGCTTGGCAAGGATATTGAGCACAGTGGACCACC TCATCACTCTTATTTGAGACACAAAAAGGAATTTCTTGAGCTGTTAGATCAAGTTGAAGATGCTATTGCTGTTGACGATGCTAATGTCTGTAATCAAAGC ATTTCCTGTTTTAAATCTCAAGGTGGAGTTTCTGATGAGCTTCCTGTCATAGGCAACCGTAAAGTAGAAAAGGCAAAATCACAAATACCTAAAGAGGCCG TTGGTGTGTTCTCCAATTATATTTTTTTGGTTTTAGAGGTGACTGAAAAATGTAGGATTTCTGATTCATCTGCTGCTGGATGCCAATACAAGGTGCTCCG TTTACTAAATGAACTAACTGGGGAAGAGCGGGCTGTAAACTTGTGGGATGAGTGGTCTTGCAGCGTAGTTGCGCCGGGAGACACTGTGAATGTAATCGGT CAATTTGAAGGGGGAAATTGCAATATTGATCATGATAATAATTTTTTGATTGTACACCCAGATATTCTGATGTCTGGAACACGGGTAATTATCTTTTGAA CTTTCTCATTGATATTACTGATTTCCATGGGTGACTAAAATCTTCATCCTAAATTTAGTAAACCAAATACAGTTTAGGTGGTTTGTCTAAATTTTTTTGT GAACTGAAATTTATTTCACTACCTAATTATGCAAATAATACAGTGAAGCAAAATAATATTGTAATGCTGTACATAAGTAATAAGTAATAGTGAAGATACT ACATTTTTAAAAAGGAAAAAATCGGAAGCCATGAATGCAAGTGTTTGAAGCTCTATGAAACCATGTTGAAGTTTGATAAAATTAGAGAAATAGAGAGAGA GAAGAGAAAGGAAACTGAATTTTAAATTGTGTTTATTGATTGTAAAGTTATGTTTACACTTTAATGCAGGATTTATATACCTGCTTCATTTCCTAACTAG ATTGGTAACTGCCTAACTGAAAATATAGCTAATCTAACCATCTCTTGTGGCATAGCAAGAGGCCAACAAGAGTTACGTGAAGTTATTGTACTTCCCTCTA AACTATACAGGTATTGACCTCAGTGCATACATAAAAGTCAAAATTGCTATTTTGGTCCCTCTGACTTAGTTTATTTCCTCAATTTAGTCTCTCAAATGAT TTTCCATCAGTTAGTGTTATAACGTCGTCAGCTTTGGCCTCAAAATGATGTTATTTTGGGTCTTCTTCTTCTCCACCGGATCTGCCATGGTTGATCCACC ATTATTCTCCATCGGCATTAGCGAACTGGAGGAGAAACAGCAACCACTACCACCAGTAGTAACGGCAGCAGCAATGACAGCGTCAAAACCGACGGACATA GAAATGGAGAACAGGACCAAAATGGTGCCGTTTTGATGGGTTTATGGGAAAGTGATGGGAATTGACTTATAGAAGGACTAATGTGAGGGCTTAACCAAAG TTGAGGTTGCTTCCAGTTTCAGTTGTGCAAGGAGAACTGTCTTAGATGAGAGGCTAAAATCAAACGAGTACTCAATTGCAGCTCTAACTGGAACCTTGCT TCACCAAATTTTCCAGGCTGGGCTTATAAAAGTGTCTCCCACGGTCAACTTCTTGGAAGAATATGCAGAAGTGGTATTACAAAGAAACGTTGAAAGTTTG TATGCATGCCAAGAAAATGAAGATAATGTTCGCAAAACCTTGATTAATTCTATCCCGAAATTATTAAGTTGGATCGGACAGTTCAAGAATACAGAGGAAC GAAAAAACCCCAATGTTAATTTCAGATTTGATAATTGCCCAAAGAATGTTATCATATCTGAGGTAATTGATATTGAAGAGATGGCATGGGCTCCTAAATA TGGTTTGAAGGGGATGATTGATTCTTCTCTTAGAGTGAAAGTTCAATCAGCAAAAGATGAAGGAGAGAAGATCATGCCATTAGAGTTCAAAACTGGAAAG TCATCAAATAGCCAGTCATTAGTAGAACACCGTGCTCAAGTAATATTGTACACTCTCCTGATGTCTGAAAGGTACCAGAAGACTATTGATTCTGGTCTTC TGTACTATCTGCAATCAGATCAGACACAGGGTATTGTTGCTGAAAGATCTGACTTAGTGGGATTAATAATGCGACGTAATGAGCTAGCCAGTGATATTCT TAAGGCATTGACCTTGCAACAACTGCCACCAATGTTACAGAGTCCTAGCCTTTGCAGAAGTTGTCGCCATCTTGATGTTTGTAGCATTTATCATAAGGCA CATGGTGGAAGCACAGAGGGCAGTGGGCTGGGAAATGTGTTTGATTCTCATACTAATCACCTGACATCTGCTCATTCTAAGTTCCTCTGCCATTGGGATC GACTGATTGACTTAGAAGCTAAAGGGACTGAGCTTTTAAAGAAACAAGTATGGCGATCACATGGCTTGAAGAATCCAATCAATGGTGGCCTTTCCTCTAT TGTTCTTGATTCTTCACATGGAATTCCTCTAGATAAATCTCCAAAAGACAATTATTTCATCTATTGTTTTGTACGACAAGATACTTCACGTCTCTCTGAA GTATCAGATGGTGATCCTTCTAGTGCTTCTCCAAATGATTTAGATCTCACACTTCGAAGTGGAGACCACGTGATACTGAGCAATGGATCTAGCTCTCAAA CTATTGCAAGGGGGGTGATCTCAGATATTAGTCCGTCGCATGTATCTGTTTCCTTTTCTAAATGCTTAAGAATTCCTGGGAGGTCTTCCACTACACATGA TCTCCTTGAACAGGTTTGGAGACTTGATAAGGATGAATATGTCACATCATTTGCAATTATGAGGTTTAATCTTGTACAAATGTTTTTGCAAAATGATCAA AGTGGTCATCTGCGGAGAATGATTGTTGACCTAGAGGCTCCTAGGTTTGACAGTGGATCTATAGTAAGCCAGGATCCAGCGATATCCTATGTTTGGTCAG AGAAGAGTTTGAATGATGATCAACGTAGAGCAGTTCTTAAGGGATGCCTGGAACGGGGAAGACATCCACAATGGTTCATGCTGTGAAATCCTTGTTGATT AGGGGCACATCCATTTTGCTGACGGCCTATACAAACTCTGCTGTTGATAATTTACTCATCAAATTAAAAGCACAGGGAATTGATTTTGTACGTATTGGAA GAGATGAAGCAGTGCATGAGGACGTCAGAGAACACTGCCTTTCAGCAACTCATGTAAAAAGTGTTGAAGATATCAAAATAAGGTTAGAACAGGTCAAAGT TGTTGCAGTTACTTGTCTGGGCATTTCCAGTCCTTTACTTGCTAACACAAGGTTTGATGTATGTATTATGGATGAAGCTGGGCAGACCACTCTACCGGTA TCCTTGGGCCCTCTAACTTTTGCTTCGGTGTTTGTACTTGTTGGGGATCATTATCAACTACCTCCACTTGTCCAGAGTACAGAGGCACGAGAGAATGGCA TGGGGGTAAGTTTGTTTCGTAGACTCTCAGAGGCACATCCACAAGCAATTTCAGCATTACAGAGTCAGTACCGGATGTGTCAGAGCATTATGGACCTGTC AAATGCCTTGATATATGGTGACAGGTTGAGGTGTGGTTCGTCCGAGATAGCTAACAGAAAACTTGAATTTTCTGACTTAAAATGTGGTTTTCCTTGGCTA GAAGATGTTTTAAGCCCAAGCAGGCCAGTGGTATTTATTGATACTGACATGTTGCCTGCTTTAGAGACAAGAGATCAGAAGATTATAAAAAACCCTCTTG AAGCTCACATAATTGCCGAGGTTTCAAAGGAATTGGTCAACAATGGGATTGCAGTAGAACAAATTGGTGTTATTACCCCCTATAATGCTCAGGCAAACCT CATTCGGCATGCTGCTTGCATGACTTCCTTGGAGATACATACCATTGACAAATACCAGGGTAGAGATAAGGATTGCATTTTAGTATCTTTTGTAAGGTCT AGTGAAGGCCCAACAAGCAGTGCTGCTTCTTTGCTTGGAGACTGGCACAGGATAAATGTGGCTCTCACTCGTGCAAAGAGAAAGTTGATCATGGTGGGG BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_145520; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_522289
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2 from Xenopus with 45.25% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019452537.1) |
| Pfam | DNA replication factor Dna2 (PF08696.10) |
| Rfam | - |
| GO | - |