Ll_transcript_521216

Id TrinityTRINITY_DN46578_c5_g2_i3
Name TranscriptLl_transcript_521216
SequenceCAAAATCCAATAATGTCAATTTATGTTGAGCTGTAGGATATGAAGTATGAACAGTGTAATGTGAATTCCAGAAACCATACCATACTATTCTCTCACTCCA ATTTCCCTCAAATCTATCAATTTCTCTTTCCTTCATCTCTCTTCAATTTTCTATTACCTTCAACCCAACCTTCTTCTTTTTCATCATCATCAATTTCTTC TTCTCAATAATACTAAAAAACAACTCTTTTTGTATTTCTTTCAATTGGGTTTCACTCTTTCAAATCAATAACAGACACTTCACTTAGTCACTATTTTTTC CATTCAACCTCATCTCAGATAACTGCTAAATTGTTGGTATCTTTGTGTTTCATAAATTGTTGATATTTGAATTAACTTGAATTTATCTATATTGTTAGTT ATTATTTGAGTCTAACAATTTTTGTATATATAATAAATGGTTTATTTGACTACGTAGTAAACATATAATGATGCTATTTTCTTCTCTAAAGTGATCATGT CCTTGTTTCGTTTACACCTTAAACGTTTAATTACTCCTTATTTCTTTGTTGTTTTCTTTGAACCTTGTGAGAAAAACAAAAAAATCACATTCCTCTATTA TTGCACGTGTTTTCATAACTTAATCTCAATTATGTTGTTTTACAAGGTTGGTGGTTTTTTCTTCTTCTTTTGTTCCTTAATTGAAATTACTGCTACTTTT TTGTCATGGTTATTATTAGAAGGAATATCCATTTGGTCTATTTTTGTTTTATTTCTTAAAAGGAATGAGATTTGCTTGTTCCATTCTTGCATTATTTTTC ATTGAATATGCAGTATTTTAAATTGTATAAGTTTTCTTTTATTTCATAGTGAGTAATTAAACTTAATGTGTACTTGTTTTAATCAGATAGGAATGGGAAT ATATCTCAGCACCCCCAAAACTGAAAAGTTTTCTGAAGATGGTGAAAATGACCATCTTAGATATGGCTTATCATCCATGCAAGGGTGGCGTTCAACAATG GAAGACGCTGTGAGTAATCATTGAAAACTTCGTTAGTTTTATAACTTGATAGTATCATTTGCATATTAATGGAGAATTCTGTGAACTGATTAACTCTGAA CCATCAACATGGTAATAGTGTGTGCTTCCGAATTCTGTTTTAAATTTAGATTGTTGCAGTGTCATTGCTTCCTTTTTTTCAACTTCCTTCCAATTTGTTA AAACTTAAATCACTAGCATGATACATAGATGGGCATATAGTTTCAATAACACCGTGTTTATGGATCAACAAGTTACTCTTAAGTTTATGGTTAATGGTTT GTTGGATTAACAGACACGGGGGACTTTCTTTCCCAAGGATATCATAGTAATATTTGTTTCTTTTGTTAGTTAAAGGGTTTTTCTTATTCTTCGATACTAT GATGTATGCAGTTCACATTGGGTGTTGTAAGTCATTCTTTTAGCGTTTGTACTCTCAGCAATTATTGTAGAAATAGATAATATTCATTTTTTACTGTAAA ATATTATTAGCAAGTTATGAGAAATGTAAAGGGCCCAAGATTTTTTTGAGACTCGTTCTTCCATGCCAATGATTTTTTCAAATGGTACTCTATGATTATC TTTACTTCATAATTGACTCTGCTTTTAGGTTTGTAGTATTCAAATCAGTTTGATTTTGTTGATTTTACCTGATTTAGATTTTAGTTAATCCATTAATGTG GTGTTGATTTTTTTATTCTCTTTTCATTCGTTAGCATGCTGCACATACTGATCTGGATGAGTCCACTTCGTTTTTTGGTGTGTATGATGGTCATGGAGGT AAGATTTGAAAAAGCTTGGCTACTTGACTGATGGCCGAATTGCATTTACCACTTCATCTTTTAGCATATTTCATCTTTTGATTTCATTGTAACTCACGTG CCTTGACTCTGTGTTGGTTGCACCTTTTAGGACATTTTCAGTTGAAAAAGTCGAGCTCAATTTTATGCTCGTAGTCTTTTGCTCCTGAAGCCTTTTCTTT ATTATTATTTATAATGTAAACCATAGGATTTAAGTTGGGTGGATGAAATTACAGAGTGATTGTGGTTGTCTGTCAAATGAAAATTTGACTGCACAACTAT AAGGCCTTTGATGTATGGTATTGAAAGTTGAGCGGTAAAAATCCAACAAGTGCATAAGCTTAGTGTTGCACGTATGAGGATATTACGTTAGATCAGTAGA TATACAAGAGAAGACATAATTAGGAACAAATGCATTACAGAGAAAGTAACGGTAAAACCTATTGTGAGAAGATGGTAAATGGTTAGGCCATGAGAGGAGA AGACTATTAGAAGCCCAATGAGAATGACATTCTGATTCATGTATATGATGACCCCGCCTAATGGGAAAAGGCTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTATTATTA TGCATATATCTGAGCTACAAATGTCTAGAATAACTAACAATGCAATTAGAGAATATTATAGAAATCGTGTCTAATTTGCTTCAAAACTGTGTTATAGATG CTTACGTAATCCCATAATTTCAGGTAAGGTGGTTGCAAAGTTTTGTGCTAAGTTTCTTCACCAACAGGTGCTCAAAAGTGAAGCATATGCAGCTGGAGAT ATAGGAACCTCTCTTCAGAAAGCTTTCTTAAGAATGGATGACATGATGCGCGGACAAAGGGGGTGGAGGGAATTAGCAACCTTGGGGGATAAGATAAACA AGTTTAGTGGGATGATTGAAGGGTTGATTTGGTCTCCACGAAGCAGTGATGGTAATGAACAAGCTGACGATTGGGTTTTTGAGGAGGGGCCTCATTCTGA TTTTGCCGGACCAACTTCTGGAAGCACTGCCTGTGTTGCAGTTATTAGAAACAACCAACTTATTGTTGCAAATGCTGGTGACTCTCGTTGCGTGATATCT CGGAAGGGTCAGGCGTACAATTTGTCTAGAGACCACAAACCTGATCTTGAAATTGAGAAGGAAAGAATCTTAAAAGCTGGTGGTTTTATTCATGCAGGGC GGATTAATGGCAGTTTAAATCTTGCGAGAGCTATTGGTAACTTACCTACTGGCATGGATATTTTTTTAAAGATTAATTTAAGCTTCATTTTTTTATTTAT TTCTCCTCTTTTTTGAAATGCAACTCGAGGTAGCAGCTTTAACCTCTGCATCTTTAGCTCACGAAGGTCCATAACTTTGTGAACTTGATGAATAAGAGTA CAACGTGAAAAATCTCCACCTTTTCATTTTGGTTCCTTACTAGATAAGAGGAGATTGGTTTCAAATTGCATAATTAGAGATTTAAATTTTGGTACATACA TCTGTTCGGTACAGTAATTTTATGAGGATGCGATGGGAATGGTTTCTAAAGTTTCCATTTACTGCAGGTGACATGGAATTTAAACAGAATAAATATCTTC CTGCTGAAAAACAAATTGTAACTGCCAATCCAGATATAAACACTGTAAGTTTTTTCCTGTATACAATTCAGCTAACTGCCTAAGTGATATGCATATCTTA CTGCAATTTCCGGTTTTCTATATGGTAGAACCAATAACAAATACTCCAATAGGACTTCTACTTTTATTCGTTTGTTCTTACTGATGCGTTGTTTTTGTTA TGGCATTTTATTATAGGTTGAGCTTTGTGATGAAGATGAATTTATGGTGCTAGCTTGTGATGGCATATGGTATTTTTCTTATGCTTTCATATCCCCATTT TATTCCGAATGTTAACATGGATTATGAAGATGTCAGTCATCTATATCATTGAAGTATAATAGCCGATGGGATTCTCGTTGTAGGCACACTAGGCAGACAA TAATGCGTCTTTTGAAACGTTGAAATATTTTCTTCTTTCATGCCCACTATGAGTAATATACACTTGATATACTTTTTATGTCTAAAAAACTGATATAATT TAGATTCAGAAATCATACAGATCTGTCCTTTCGAGTTTTCGTCAAAGAAATGCCTTTTATTCTAATTTTTTCAGCACATATTCCCTCAAGAAGAAGCATC TTTCTATAATATATAACTTGAGGTTTTAGCATATGCCAGTGTCATTTGCTAAAGTATTGTGATTCTGAAAATAATAATTTGCTTCTTTCGCACGGCCTTA CTGAAAATAGCAACCTATGGTTCTTAATTATTTTCAGGGATTGCATGTCAAGCCAACAATTGGTTGATTTCATTCATGAGCAACTGCACTCAGTGAGTTC TAAGTTTACCTTTTTTCTAATAAGATAATAAATCATTCAATTAGTAAATATCTGTCATTATTATCCATAGATTATACATATTGATCATATTTAATGTGAT CATCACTTGCATTATGACTTAGAGGTTGCTTGTCCTGAGATCTGGAGGTCATGGATTCAAATCCTATAAACAGTCTTTTCGCTTACGAGTGTAAGACTGC GTATATCCACCCGACCCAGACCCCACCAAGTGGGACATTGGGTTGCCCTTTTAACATCGGTATGGGCAGTGGTGGCCTTTTTAATTGTCTACAGGTTATT ATTTTGCCTGAATTTACATAGCACCAGGTTATTCTTTTATGGTTGGTATGTGTAATGGCATCCTAATTGGGTGATCTGTAATTATTTTACTCAGGAAACC AAAGCTTCTGCAGTGTGTGAAAGAGTAATTGATCGGTGCTTAGCGCCATCAACTGCCCGTGGCGACGGATGTGATAACATGACCATGATCTTGGTGCAGT TCAAGAAACATGCTCAATCAAGTGCACCATCAGAAGAGCAAACCTCTTCAAATGGACAAGTTGAATCTGAACCAAAACAAGAGAGAAGTGAAACTTAGTG TGTTCCAACCAAAACAGTTCAAACATGTATTATATATAAATATATAGTATGTACCACTGCTTAGAATGCATCTGAATTGCCTATTTTTCTTTCATCTAAC ACTATATAACAGCAATTGTTCTGGTTATACATAAAAATATCACTCTTTCTTCCAAAAAAAAAAAAAAAA BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_145611; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_521216

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_521216
BlastpProbable protein phosphatase 2C 60 from Arabidopsis with 80.69% of identity
BlastxProbable protein phosphatase 2C 60 from Arabidopsis with 83.91% of identity
EggnogPhosphatase(COG0631)
KeggLink to kegg annotations (AT4G31860)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019437805.1)
PfamProtein phosphatase 2C (PF00481.20)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;