Ll_transcript_522162

Id TrinityTRINITY_DN46591_c4_g1_i1
Name TranscriptLl_transcript_522162
SequenceCAAAATAATATTTATTATTAGTTATTGGTTTTTAAGATATATATGATTTTTAGTTTTTCCCTTTATTTTGTGCAATAGGTATATTATTACTCAAATATGT TTTTTTTCCTTAGTAAGCAAGAGGGGTTGGTTATATGAGAGCCGTTGATTTACATAAGAAACTTAGGTGCAGTACTAATGATATAAGAACTAAACTCAGG TGCAGTACTGTGAGTACTAATGATAGAGATTTACATAATGATAACTGACTTATATTGATAATAATGCTCTTAGGTATCACCTCCACTCTCCAAAACGTCA CCCTTTCATCCGAACTGGATCTCCCACCGCCGCTAACAACCCTCTCTCCATCTCCAACGAATCCCTCCACTCCTGCGGCTTCATCTTCTGGCGCAGCCCC GATGGACTCAACCTGGACCACCTAAACACAATCTTCGTCGCGTAGCGTTTTATTCAGAGGTGGAAAATTATTGACACGTGTCATTATATGGTTGGGTACC AGTACTACCAGTACTTAAGGTGTGGAACTAATTACTGAACTATTAATAAGGATTTTCATCGTTTCGTCCGACCTGGGAAAAACAGAGGCAAGTGAAGTCA GAAACTTATCGAAACGACAGAGGTTAATGTTGTTGCGCCTTTTCAACTCTTCCTTTTTGACAAAGACCCTTCCCAACTTCAATCTCTCTAAATCAACATC CATGGCATCTTCAGCTATAGAGTGCAGTTCAAGTTGCATGCTGGTTTTGTGCGGAAAATCCAACACAGAAAATGAAGCTGCTAAAGCTATTAAGATCAAT AACACTATCAAGCTTTCTCAAAGTGGAGATTTTTCTGTTGTTTTGCATTCTGAATTGGATAAAACAGATATGAAACACTCTTTTCAAGTGGATTCCTTCA TGAATTCTCTTTCCACAAACACATTTGGAAGGTTTCTTATCTGGTCTCCACAGTTAGACACAACCCATGATGTTGTTTCAAACAACTTTTCTGAGCTTCC CGTTGGTACAGTTTGTGTTGCTGATGTTCAGACCAAGGGACGAGGCCGGTCAAAGAACGTCTGGGAGTCTCCTTTAGGCTGCCTCATGTTTTCTTTTACC CTGCAAATGGAGGATGGGCGGGTTGTTCCTTTAGTCCAGTATGTGGTTTCTCTGGCTATCACAGAGGCAGTGAAGGATATCTGTGACAAAAATGGATTAC CCTTCCTTGATGTTAAAATCAAGTGGCCAAATGATATTTACTTGAATGGCTTTAAAGTTGGAGGCATTCTATGCACCTCAAAATATTCATCAAAGAAGTT CAATGTCAGTGCAGGTATAGGCTTGAATGTCAATAATGAGAAGCCGACAACATCTTTAAATTCAGTTCTAAGAGAATTGTCAGTTGAAGGTTACCAATTT CGAAGAGAAGATGTTCTGGCAGCCTTTTTCAACAAATTTGAGAAATTTTATGAGCTATTTATCAACCAAGGTACTCTGATAATTGTCCCGTTAAATTGTT TTTGTTATCATCTCCAACATCAGGTTCCAATTCTGATTATCATCATCTTACTGCGCCTATGTTTATCTCTCTCACTGTAAACCCAGATAGATAAAATCTT CTAATAATCTGAAATCAGCATGTGGAGTTATCCTTCTCATACTTGTGTATTAATCACATTTGAAGATTACAATGGCCTTGGTAGGAAACTGTCGTTTGGG TATGGACCGTTAGTGTAAAGCCAACTTTTTTTTATATTTGAAACGGTCTAAACCCATTGAAATATATAGAGATGGTAATTTGGGAATTTATGTTTGCTAA CACATTTTGCATAGCATTTGTCTATCAACAAATCCTTGGGAGGGAAAAAGGGGTGTAAAGTATAGGACAAAGGATGCACCTTTGCCGTATATAATGACTG TTTCTTGTTTGTTACCCTTACAGGTAGAAAATTAGCCCCAATTTTCCCTCAGTTTGGATAATTATTTTCCTATTTTAAATGCTTTAGGATTTTCTTTTAA AACCCTGTACTCTTGGCACAATGGTAATGGTGCTGTGTTGAGGTCTTATGGTCACATACTCACATTCTTAGTCATGGAAATATCCTCTCCACTTACAGGT AAGGTTGTATACATTGGACCCTCCCCAAAGGCCCAAACACTCGAAGTGTAGGAGCCTCTTACAATAGGTCACTTGTACCTTAGTTTCTGTCCAAAATGAA GAAGGAAAAAAGAATCATACTCTTAGCTTGTGAGACCTGGATCACATGATGTTTTCATGTTGTCTCCTATTCTTTTCTCGGTCTCTTTTTTCAATCCATA GTCTATGCTTTGTCAGAGGAACTGAAAAGAGCAAGTGTAGATGTCTATTTTGGTCCTCCAAAGATGGACATGCCACTAGGTTTCTACTCCATTTATAAAA ACATCAAATTTGTCTTTCAATATCAATTTATGCTATCAAGTCGGTCTTTGAAGTGACATCAACTTGTCCCCTAAAGAACAAGACTCTTAACTATCATTGG AGAACATGGAAGTCCATTGTGATGTCACAGGCATCTTTAGTGGTCTAAAATAGACACTCCAAAATAAATAATAAATAAATATACAACCAAAATGGTATTT TTCCGGTTAATGTGTTACAATTATGTTGTTTCCAGACTTCAGCAGAGTTTTCTAAAACTTACTGTATTTTGTGTTGATTACTAACCGATGGGCATGTCTC CCGACACTTTTACATAATGAAGGTAATTTTGAACTTTGCTTGTTCTGTTGAATGCAGGGTTTCAAACCTTGGAGGAACTATATTACAAGACATGGTTGCA CAGGTATATTGAATCCTAAGTACTCTTGTTTGTTGTTTATGCTGGAAATATTTTTCCCTTCTGTGGCAATTGTCTTATAACTGCTACAGCTCCAAGTAAC TAACACCAACTTTTTTGTTATTAACAGATTAGGGCTAATCCTCCACTCTCATATCTATACTATTTGTATAATTTAGTGGCGTAAATTAGCTTATTACTAA TAACTTATATTTCCAACTTACATCTTATTCCTATTTTGTATCAAAAATTAAATCTATGATTACCCGTAATAATAAATTTTATACAATTTAGTCTATATCT ATATAAATATTATTTATAGTAGTATTAATTTATTGAATAAAAAAATACTAGTTGACAGTCATGGTAGTGCCACCCTTTCAGCTTAAATACCCCACACTAT TTTATTCTCCCTAGAGGGAGCCTCTCATGAACGAAACACATGATTTCAGAGACTTTAGTAGCTTAGTGGTAGCTACTCAATGGAATCAATGACTATAAGT CGGTGAGACCATGGGTTCAAATCACGGGAGGCTCATTCTTGATACAATAAAATATTACATGGTTTATTTAAGCTTGAAAGGTTACACACTCAATAACTTT AGGAGCTCATTGGGGTTGAATGTCAAAGGCTGTATGGACATTAAATATGGTTATCCTCTCTACAATCATTTTAAAATTACTAAAACCAGCATATAATCAC TATTTTAAGTTCTAAACTTTACTCCGTTTTACTCTTCGCATATGGCAATTTTAATCTTGAAGGAGTCGGAATGAAAATTTCCTAATATATTATCATTATA CTGATACCTGAACTTGTTTGGTAAGTTTTAGTTAGCAGTTGAACCATAAACTTAAACAATATGTTGTATTCATTGTCCTGTTTATACTTCTATGTCTACC AAACAAACCTGTTTATGCATATATGTGGAATGGCTAAATTTTACATTCATCTATATATGAAAAATGTATTGCAGTGGTCAGAGAGTTATCGTACAGGAAA AAAACGAGGATACAGTATCCGAGCATGTCGTAACTATACAGGGTTTGACATCCTCAGGATATCTGTTGGCAATTGATGATGACAATCAAATGTGTGAGCT CCACCCTGATGGCAATAGCTTTGACTTTCTCAAAGGACTGGTCAGAAGTAAACTCAACTGAAGAAGATTCCTTGTCACATTTCATTCAAGGCAACAACCC TTACACCCACTTTGTATATATTGCCAAGGTCTTGGCTTTATTGCTAAAATTTTCCAATAAATTAAATTTTTAGTGCTTTTGTATTCCATTTGTGAAACTT GTTGTTTGGTCAAACAAGTTCTTCTACCCAATGGCATGTAATAAAACATAAAAACATCATGGTTGCAACCAAAAGAATGAATTTTTCTTCTTCTCTTAGT AGGACTTAGTGCATGATTACTTTATTCAATTATTGGTTAAGTAATGTGGTGGTGATTGCTTTATTCAATCATTGGTTAAGTATTGTGGTCGTC BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_145725; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_522162

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_522162
BlastpBiotin--protein ligase 1, chloroplastic from Arabidopsis with 64.5% of identity
BlastxBiotin--protein ligase 1, chloroplastic from Arabidopsis with 65.85% of identity
EggnogBiotin- acetyl-CoA-carboxylase ligase(COG0340)
KeggLink to kegg annotations (AT2G25710)
CantataDBLink to cantataDB annotations (CNT0002087)
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019433158.1)
PfamBiotin/lipoate A/B protein ligase family (PF03099.18)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;