Id Trinity | TRINITY_DN46591_c4_g1_i12 |
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Name Transcript | Ll_transcript_522182 |
Sequence | CAAAATAATATTTATTATTAGTTATTGGTTTTTAAGATATATATGATTTTTAGTTTTTCCCTTTATTTTGTGCAATAGGTATATTATTACTCAAATATGT TTTTTTTCCTTAGTAAGCAAGAGGGGTTGGTTATATGAGAGCCGTTGATTTACATAAGAAACTTAGGTGCAGTACTAATGATATAAGAACTAAACTCAGG TGCAGTACTGTGAGTACTAATGATAGAGATTTACATAATGATAACTGACTTATATTGATAATAATGCTCTTAGGTATCACCTCCACTCTCCAAAACGTCA CCCTTTCATCCGAACTGGATCTCCCACCGCCGCTAACAACCCTCTCTCCATCTCCAACGAATCCCTCCACTCCTGCGGCTTCATCTTCTGGCGCAGCCCC GATGGACTCAACCTGGACCACCTAAACACAATCTTCGTCGCGTAGCGTTTTATTCAGAGGCAAGAGTTGTTGGGTTCTATCATTTATTCAGAGGAATGGT GTATTCCACCAAAAACATAAGAGCAGGGGTGGAAAATTATTGACACGTGTCATTATATGGTTGGGTACCAGTACTACCAGTACTTAAGGTGTGGAACTAA TTACTGAACTATTAATAAGGATTTTCATCGTTTCGTCCGACCTGGGAAAAACAGAGGCAAGTGAAGTCAGAAACTTATCGAAACGACAGAGGTTAATGTT GTTGCGCCTTTTCAACTCTTCCTTTTTGACAAAGACCCTTCCCAACTTCAATCTCTCTAAATCAACATCCATGGCATCTTCAGCTATAGAGTGCAGTTCA AGTTGCATGCTGGTTTTGTGCGGAAAATCCAACACAGAAAATGAAGCTGCTAAAGCTATTAAGATCAATAACACTATCAAGCTTTCTCAAAGTGGAGATT TTTCTGTTGTTTTGCATTCTGAATTGGATAAAACAGATATGAAACACTCTTTTCAAGTGGATTCCTTCATGAATTCTCTTTCCACAAACACATTTGGAAG GTTTCTTATCTGGTCTCCACAGTTAGACACAACCCATGATGTTGTTTCAAACAACTTTTCTGAGCTTCCCGTTGGTACAGTTTGTGTTGCTGATGTTCAG ACCAAGGGACGAGGCCGGTCAAAGAACGTCTGGGAGTCTCCTTTAGGCTGCCTCATGTTTTCTTTTACCCTGCAAATGGAGGATGGGCGGGTTGTTCCTT TAGTCCAGTATGTGGTTTCTCTGGCTATCACAGAGGCAGTGAAGGATATCTGTGACAAAAATGGATTACCCTTCCTTGATGTTAAAATCAAGTGGCCAAA TGATATTTACTTGAATGGCTTTAAAGTTGGAGGCATTCTATGCACCTCAAAATATTCATCAAAGAAGTTCAATGTCAGTGCAGGTATAGGCTTGAATGTC AATAATGAGAAGCCGACAACATCTTTAAATTCAGTTCTAAGAGAATTGTCAGTTGAAGGTTACCAATTTCGAAGAGAAGATGTTCTGGCAGCCTTTTTCA ACAAATTTGAGAAATTTTATGAGCTATTTATCAACCAAGGTACTCTGATAATTGTCCCGTTAAATTGTTTTTGTTATCATCTCCAACATCAGGTTCCAAT TCTGATTATCATCATCTTACTGCGCCTATGTTTATCTCTCTCACTGTAAACCCAGATAGATAAAATCTTCTAATAATCTGAAATCAGCATGTGGAGTTAT CCTTCTCATACTTGTGTATTAATCACATTTGAAGATTACAATGGCCTTGGTAGGAAACTGTCGTTTGGGTATGGACCGTTAGTGTAAAGCCAACTTTTTT TTATATTTGAAACGGTCTAAACCCATTGAAATATATAGAGATGGTAATTTGGGAATTTATGTTTGCTAACACATTTTGCATAGCATTTGTCTATCAACAA ATCCTTGGGAGGGAAAAAGGGGTGTAAAGTATAGGACAAAGGATGCACCTTTGCCGTATATAATGACTGTTTCTTGTTTGTTACCCTTACAGGTAGAAAA TTAGCCCCAATTTTCCCTCAGTTTGGATAATTATTTTCCTATTTTAAATGCTTTAGGATTTTCTTTTAAAACCCTGTACTCTTGGCACAATGGTAATGGT GCTGTGTTGAGGTCTTATGGTCACATACTCACATTCTTAGTCATGGAAATATCCTCTCCACTTACAGGTAAGGTTGTATACATTGGACCCTCCCCAAAGG CCCAAACACTCGAAGTGTAGGAGCCTCTTACAATAGGTCACTTGTACCTTAGTTTCTGTCCAAAATGAAGAAGGAAAAAAGAATCATACTCTTAGCTTGT GAGACCTGGATCACATGATGTTTTCATGTTGTCTCCTATTCTTTTCTCGGTCTCTTTTTTCAATCCATAGTCTATGCTTTGTCAGAGGAACTGAAAAGAG CAAGTGTAGATGTCTATTTTGGTCCTCCAAAGATGGACATGCCACTAGGTTTCTACTCCATTTATAAAAACATCAAATTTGTCTTTCAATATCAATTTAT GCTATCAAGTCGGTCTTTGAAGTGACATCAACTTGTCCCCTAAAGAACAAGACTCTTAACTATCATTGGAGAACATGGAAGTCCATTGTGATGTCACAGG CATCTTTAGTGGTCTAAAATAGACACTCCAAAATAAATAATAAATAAATATACAACCAAAATGGTATTTTTCCGGTTAATGTGTTACAATTATGTTGTTT CCAGACTTCAGCAGAGTTTTCTAAAACTTACTGTATTTTGTGTTGATTACTAACCGATGGGCATGTCTCCCGACACTTTTACATAATGAAGGTAATTTTG AACTTTGCTTGTTCTGTTGAATGCAGGGTTTCAAACCTTGGAGGAACTATATTACAAGACATGGTTGCACAGGTATATTGAATCCTAAGTACTCTTGTTT GTTGTTTATGCTGGAAATATTTTTCCCTTCTGTGGCAATTGTCTTATAACTGCTACAGCTCCAAGTAACTAACACCAACTTTTTTGTTATTAACAGATTA GGGCTAATCCTCCACTCTCATATCTATACTATTTGTATAATTTAGTGGCGTAAATTAGCTTATTACTAATAACTTATATTTCCAACTTACATCTTATTCC TATTTTGTATCAAAAATTAAATCTATGATTACCCGTAATAATAAATTTTATACAATTTAGTCTATATCTATATAAATATTATTTATAGTAGTATTAATTT ATTGAATAAAAAAATACTAGTTGACAGTCATGGTAGTGCCACCCTTTCAGCTTAAATACCCCACACTATTTTATTCTCCCTAGAGGGAGCCTCTCATGAA CGAAACACATGATTTCAGAGACTTTAGTAGCTTAGTGGTAGCTACTCAATGGAATCAATGACTATAAGTCGGTGAGACCATGGGTTCAAATCACGGGAGG CTCATTCTTGATACAATAAAATATTACATGGTTTATTTAAGCTTGAAAGGTTACACACTCAATAACTTTAGGAGCTCATTGGGGTTGAATGTCAAAGGCT GTATGGACATTAAATATGGTTATCCTCTCTACAATCATTTTAAAATTACTAAAACCAGCATATAATCACTATTTTAAGTTCTAAACTTTACTCCGTTTTA CTCTTCGCATATGGCAATTTTAATCTTGAAGGAGTCGGAATGAAAATTTCCTAATATATTATCATTATACTGATACCTGAACTTGTTTGGTAAGTTTTAG TTAGCAGTTGAACCATAAACTTAAACAATATGTTGTATTCATTGTCCTGTTTATACTTCTATGTCTACCAAACAAACCTGTTTATGCATATATGTGGAAT GGCTAAATTTTACATTCATCTATATATGAAAAATGTATTGCAGTGGTCAGAGAGTTATCGTACAGGAAAAAAACGAGGATACAGTATCCGAGCATGTCGT AACTATACAGGGTTTGACATCCTCAGGATATCTGTTGGCAATTGATGATGACAATCAAATGTGTGAGCTCCACCCTGATGGCAATAGCTTTGACTTTCTC AAAGGACTGGTCAGAAGTAAACTCAACTGAAGAAGATTCCTTGTCACATTTCATTCAAGGCAACAACCCTTACACCCACTTTGTATATATTGCCAAGGTC TTGGCTTTATTGCTAAAATTTTCCAATAAATTAAATTTTTAGTGCTTTTGTATTCCATTTGTGAAACTTGTTGTTTGGTCAAACAAGTTCTTCTACCCAA TGGCATGTAATAAAACATAAAAACATCATGGTTGCAACCAAAAGAATGAATTTTTCTTCTTCTCTTAGTAGGACTTAGTGCATGATTACTTTATTCAATT ATTGGTTAAGTAATGTGGTGGTGATTGCTTTATTCAATCATTGGTTAAGTATTGTGGTCGTC BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_145725; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_522182
Blastp | Biotin--protein ligase 1, chloroplastic from Arabidopsis with 64.5% of identity |
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Blastx | Biotin--protein ligase 1, chloroplastic from Arabidopsis with 65.85% of identity |
Eggnog | Biotin- acetyl-CoA-carboxylase ligase(COG0340) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT2G25710) |
CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0002087) |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019433158.1) |
Pfam | Biotin/lipoate A/B protein ligase family (PF03099.18) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |