Id Trinity | TRINITY_DN46592_c5_g1_i7 |
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Name Transcript | Ll_transcript_521672 |
Sequence | CCCAGAAGATGTGTTTCTTCCTGTAACCTGCAGTCGTTCATTACATTTACCCTTGCGCTACTCAGATCACACACACCTCCACTCTTCCATTTTCCTCCGC CGCCGTCTCTCCTCGCCGGTAACTTCTCTTATCTCGCTTACTAGTAACTATGGCCATATCTTTCACTATGCTTCGAATCTCCATCTGTTTTTCATTCTCT ATTAAATCTTCTTTCCCTTTCTCATTTTCCACTTTTCTAATTTTGATTCAATCTTATCATGCTATTTTGAAGATCCACTTCCAGATTTGACATTGAATGA ATTTCGTATTGATGTTTGATACTGGACCTATGTAATCGTATTTGAGTTTGAAATATTTGTTTTATTTTCAGTTTATTTTGTTCTGTTTTGTTTAATTAAT CAGTTACAAAACTGGAATATGGTTTCAAAGCATAATTTCCATCCACCAAGATCAGTGAGTACAAGTGTTTGGGATTGCTATAACCCTTTACATAGATTTA TTTTCTTTTTCCTCTTCATGAGATTACAATGGAAACCACAATGTTAAGGTTTTGGTATTCTCCGAAACTGCATTGTGACCACAATTGAGGCTGCATTGGT TGCACTTTCCCGCAATATTATGCAATTTTGGTTAACTAATTTGGAACTTTTTTGGGGAGCATATTGGAGCCCTGCGGTGGTTCTGATTTAGATTCCGAGG CCATAATTTGGATCCGTTTGGTAGAAATTTGAGTCCCTAGATGTCTAATCCTTTTCCATACATTTCATCAGTAGTCTCTCTCATGAGCTGCATAAGCTCA TTTTATATTTTAAAGACTGATCATCAATTTCTTTGTGAAGTCAACCCTTGAAAGGAATTGGCCTTCCAAAAATTCTATACCAAACAAGATATATGATTGT 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GGAATCGCTCGCTCAGGACACTGAATGCCCAGCAAGACCACAAGTTAATGTTTGGTCTACTTTTCTCACTTAAGTCGTTAACTGCCAAGATGGACCCCAC TAGTGCTGAGAAAGGAAACCTTGGCGTGCCTCAGTTACCTGGCCAAGGTTGTTCATTTCACAGTTTTCGCACTAATACATACAAGCTTAGTTTCATGGAA AGTCCTTCTGGGATAAAGATTATCTTGGTTACTCATCCTAGAACTGGTGATCTACGGGAATCCTTGAAATATATCTACAACTTGTATGTTGAATATGTTG TCAAGAATCCACTCTATACACCTGGATCTCCTATTAGGTCTGAGCTGTTCAATACAACGTTGGACCAGTATGTGAGAGGGATCGCATAGAAGCTGAGTTG TTCTCATTCACAGCTGTTGATGATGAATCCTCACTTGGTTCATGTTGCTTCCTAAAATGATTTTATTAGTTACAGCATAGTTGGTCTGATCATGTTAATA CTTGATCAGAATTCATTGCCCAAAATTTAAACATGGGTCAAATTCTGTTGCGACAGAGTAACTCATTTTGGTTTGTGAATTTTTTGATATTTTCTTTGAT GCTGTGTATTATTATCATACATCTATATATATTAAATTTCAGCCCTTGCCATTGAATTTAGACTCAATTTTTAATGTAC BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_145741; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_521672
Blastp | Trafficking protein particle complex subunit 1 from Rattus with 42.18% of identity |
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Blastx | Trafficking protein particle complex subunit 1 from Rattus with 42.18% of identity |
Eggnog | trafficking protein particle complex(ENOG4111X41) |
Kegg | Link to kegg annotations (287427) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019449715.1) |
Pfam | Sybindin-like family (PF04099.11) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |