Id Trinity | TRINITY_DN46601_c0_g1_i2 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_433768 |
Sequence | ATGCACCTCATCATCCACCGTCTATTTGAATTACTTTTTTTGAAAAGTCAACAACAATTAAATATTAGATTTATAATTATTAAACTAATGAATTATTTTC ATCCCTCCCAAATTTTTGTATTAATTTGGTCCCGTGAAGAATTGAATAACTAGTTTTTGACACACTTTAGTCTTTGACTCATATTTGCAATTTTGATTTG TTTTTATTTTTATGTTTTATAGCAAGTTGGGATATGCAAAGGCTTATGGGTAGATTTCTGCAGGTTGGATTTGGAATGACGACGGTAGATTTCTTAGCTA CCGTTGATGGATTTCCGAACCCGGACGACAAGGTCCGAACAACGTCGTTCAAGGTTCAAGGAGGTGGAAATGCCGGTAATGCTATAACATGTGCTGCTCG GCTTGGCTTGAAACCCAAGCTCATCTCCAAGGTTGCAGATGATTCTCAAGGCACAGACATTTTGAACGAGCTGCAAGCTGATGGTGTTGATACTTCATTT ATTGTGGTATCCAAGGGTGGTAGTTCAACATTTTCATATGTACTAATCGACAACCAAACGTAAGGCATTTACCATTATGTTTTGACCATTATTTCCCACC CTGACAAATGAGTGCTTTTCTTTAACAACATGACTACTAATTCAAGGCTTAAAATAGCATGATCATATTAAGAAAAACTTTACAGAACACAGTTTGATGA TTGTATGCTTGAGCTCTAGGGTATTTCAGATTCATCAATGCCTCATATTTTTATTCGTTATATTCTAAATATGGAATTATGCATAAAGGTGCATTGTTTT TTGTTACTTTTTTGAAATACTCATGCGAGTTCACTTTGAAAATTTTTCAACACCTTTCCATATATAATGTATTTCAATTATTTAATCACATAACAACCTG GGATTATGTTTTATCGACAACACATCTGCATCAATACTTCCAGAAAAACTCGTACAAGTATTTACACCCCAGGAGAACCTCCCATGGTGCCAGATGACTT GTCCCAGTCAACCTTATTATCTGCATTTGATGAAGCAAGATTAGTTTATTTTGATGGAATGTCTACTGAAACTGCTCTATTTGTTGCACAGGAGGCAGCT CGCAACAATATTCCTATTTTAGTAGAGGCAGAATCACCAAGGGAAGGATTGGATGAACTCCTGAAGTTGGCTGATTATGCTGTATGCTCTGCAAGGTTTC CACAGGTAGTATTCCTACTTTGTAACTCTTTCATCAGCTTATGTTTTAGCCTGCATGCATGCTGAATTTATTTGGACTACATAAGTTTGGATTGTTTGTA TGTTGAGAGTGGGGTATCTGTTCAAAGTCCAGTTTGAAAATACAGTTAGTATTGTTTTTGAAATTTCCTTCTTCTCAACATACCAAATAAAAATGTTCCT TTTTTGTCATATTCACTGTACACTTACATTTTAACTTTGTTTTTTGTCATGCTCATGATGAATTTGAATTGCCGTGTTGTGCTCCTGTAGTTACATATAT GGTGTTTCCATATGGTGCTGCTTATGTTTAAGTCATTTGTGGTGTAGTTATTTGGGATTTGAATGTGTATTTTAGGCTTGGACACAGGAACCATCTATTC CAAGTGCATTGGTTTCTATGCTTTTAAGATTGCCAAATATCAAATTTGTGATTGTGACTTTGGGTGAAGATGGATGTCTAATGTTGGAAAGAAGTGCAGA CGCAGAGGATGCTGACAGAGAAGAAAGGGATGCAGAGAGTTTTTTAGAATTCTTATATAAAGGAAAAGATGATAGCTTGACCATCCCAACCTGCATATCA TCAGTAAAATATTGTTGAACCTATAACTTCTTCAATTTATATTTTATTTTGACATATATTGTTGAAAGTAGAATGCCAGGACTGAATATAGAATCATACT TCTTTAGATCTTGGAGGGTCATAGTTGATATAAAAGAACCTTGTCCTAAAAGATACACGCAATGCAAAAACATGAATGCAAGAAAAACCATGTTCGGATA TATGGATGGAATCGGAATATCGGATATATGGATCGACTCATTTTTTTGGAAGAAATCACTTCACTTTTTGCTTGAGATATGTTACAAATGCTTTATACAA CAGCAATCACTTTTTATCCCTTTGAATGGAATCGGAATATCGGATATATGGATCGACTAATTGGTGCCAAGAATTTTGTTAATAATATTAAACCAGGTAA AACACTTTTTCTCCTTTTATATTTGCTTAATGATTTTCACAGGTGGTGACAAAATTGAAAGGAAAGGGAATAGGGACACTGTGTGGGAGATTCTTTATTG GAACAGCAGAGAAAATACCTGATTCTGAACTAGTTGATACAACTGGTGCAGGGGATGCATTTATTGGAGCCATTATTTATGGTAGGAGTATTACTGGCCT AGGCTGATTTTTTTATCCTTTGTCTAAGCATCTTAATTGAGACATAAATCAGATTATTTGGGGTTTTTCATGGTTTGAAATTGATACTCTCCTAATAACT AATCAGTGTAAGCTCAGAGTACCAGGTGGACAGAAAAAAGAGCTCATATATGGTCCTCTGAGATTAAGATAGTAGTAAAGCTGCCAAGAGTGACACAACT TCCTCTTTGTGTTTACATTAGTTAAAAGGTTCAGGATACTGAATTATGCTCTCTGACTTTTTTTGTAGCTATCTGTGCAAACATGGCACCAGAGAAAATG TTACCATTCGCTGCTCAAGTGGCAGCTGCCAAGTGTAGAGCTTTGGGAGCTCGAACTGGTCTTCCATATCATACAGATCCACGCTTGGCATCCTTTTTAC ACTAGAGGTAACTAATTGTATGCTGCATTCCGCAAGCATGGATCGCTCCAAAAATGAATCTTTTGATTCAGTATTCCCATCTAGCAAGCTTAACTCTCCT CCATCTCTGTTTACAGAGTGACTGTGCTTACTTTGTGGTTACTTGTAGATGTTTTGTTGTAAGATGTATCCTATGGTTTGTAAAGAATCATGAGTTCAAC AAGTATAGAGTTTCTTCGCTAACTATGGCCTGGCCATCACCCTTTCCCTGACGTTGTCTTGATCATCCTCGGTAGGGTTGCGGGGTGCTGTTAAACCAGT GTGTTATTGGGGTGTCTTCCCCATTTCTAATTGCTTGGTGTCAATATAATTTTACATTTCCGGACATCTCACTTGGGAATGTGGTTTACTATGTTTAGTA GAATGTTATAAAAATATTTACCCAGATAAATAGGAATGAATCATTTGCAATGGGTGTAGGAAATTTGAACTTTGACCTTTTAGATGGGAATATTTTTACA CTCCAAGAACATGCTTTAAATCATGTTGGATGCCAAAAGCTACCTTAGAGGGTCCTGTTTCTCAGTGTAGGAAATGCTTCCATTGTGTAAGTTGTGATTA TTGGTTCAACTAAATTCAAAGGCCCTCAAGGGTACAATATTGGTAGCCGGATTTGAATGAAGTCCAAACTAAATTTAATAGTTTGGCTTAAAATTTGATG ATTCTATTTTCCACTTGAGTGTCATTCAAGTCATTCCAATAGAATATTGAGTTTCCTTCAGTATGAGGGAACCTTTTATGTAATTTAACTTACATAAAAG AGGTGTGAGTGCCTTGAAAGCAGAAATCATCAAATTTGATTAAATTCCATGGATACATAAATACCCAATGGAAGAAAGAGGTGACTCATTCTCGCACTCT TTTCTTTGGTGATGACTGTCTCATGGACCCAAAAGCCAAGCATGGCTCGGTTGAATACATCAACTTGGATGGAAAGAATGTTGGTGCAACCATGC BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_145803; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_433768
Blastp | Ribokinase from Bacillus with 37.89% of identity |
---|---|
Blastx | Ribokinase from Bacillus with 37.89% of identity |
Eggnog | pfkb domain protein(COG0524) |
Kegg | Link to kegg annotations (BSU35920) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019444453.1) |
Pfam | pfkB family carbohydrate kinase (PF00294.23) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |