Ll_transcript_434258

• Id Trinity: TRINITY_DN46610_c2_g2_i2
• Name Transcript: Ll_transcript_434258
• Sequence: CCACACGCCACTACCTTCAATTATTATCGACCATTTCACGTATATCTATTTCTTTTTTTGTCGAAATTCTCGACAATAATAAAAAGACAAGTTATTGATT TTGCTATTATATTTAAGTATATATTATATGTAAAGACTACAAGTACCACATCATATAATTTTGTTTTGGTCCCAACCTTTTAAATTGGAGTTGTGATTAC GATAACAGTTGTGGTTACTACAATTGTAGTTATAGCGGTGGTTGCGATGCAGATTGCGGCTGTTATAGTGAATTATTTTGTAATTAAAAAACTATTTTTG AATTGAATGCGGTCCAAACACAAAATGCTATTACCTTATGGCCGATACTGTCACGTCGCAATTGATGCAGTTGTAACGGTCACCGCAACCGCAATATTGG GTTGCAGCGGCAATTTAAATAACTGCTCCCTACTCAAGCACAGGAATCATTACCTTAAAACCTCACTTACTTTGTTAACTCTTTCTTGTGTGAAAATTCA TGACAGACATTTCTATGGCAAAAAGGTACTGCTACAATGATTTGCTTCCTTTTGGTGCAATGGTGATAATGGAAACCATCAATGTTGCTTTGAATACTTT GTTCAAAGCAGCTACTTTGAGAGGGATGAGTTACCATGTTTTCATTGTTTATGCTTATTCTGTTGCTGCTATTCTACTAATTCCTGCACCCTTTATCTCC CAAAGATCAAGAGTGCTTCCTCCTCTCAGTTACCCAATTCTGTGTAAAATTGGTCTTCTTGGGCTTATTGGGTACATGATTCATATATATATATATATAT ATACCCCGGAATTGTTATAAATATAGGTTTTTTTGTACTACCCTCGGTTATGCAAAAGAGTTGAATCATTGACCTTTTGGTCGATCTTGTGGGGTCTTAT ACTATTAGATTAAAGCCATGTTGGTTATGAATATAGATTTTGATACATAGGAACAAAAAACATGTCTTTATGGTGCAATTTCTGTGTATGATAATATTTT TTGTTGATTGGTGTGGTGAGAATTTCAGATGTTCATCTCAGATTGTGGGATATACAGGCATCAGTTTCAGTTCTCCAACACTTTCCTCAGCTATCAGTAA CTTGGTGCCAGCTTTTACCTTCTTGCTTGCCATCATGTTCAGGTTTTACACCACTCTATCATATACAATGCTATTGTCCCGATTGGTGTTTTAAATTGTG GTTACGGTTACGTTGAGTTCACCATAATTATGGGATTTTGCGGGAAATGCAGTCGATCCAGCCATAATTGCCGTTACGATGTTGTTGCGAAGACTCCCGA TACCATAATTGTAGTTATGGAATGTAATTTAAAACATCGGTCCAATGTAAAAATTCTATAATCCTTTCTTTCCATATCCAATAAGCAGCAGAGATATATG TAGGCTAGATCAAATTCTGAATCTTCTTCCTTTTCCTAAAAGGTCTAAAAAAAAGCAAATCTTTCCATATATTCTTATTTGTATGCCAATCGATGATAAT AGGGCAGTTCAGATCACGAGGCTCGTACTTAGTAGGGTATATATATATAGCTGCTAGCTTCTCCTCTTAGCCAATTGTATCCTTCTTTAATGGAATATTA CGACGAGGTTGATAAGACCGGAATGCCGAGTGTATAAGGTAGTATGCATGAATCCACTTAATCCAGAGATTTTCAGCTTTAGTAGCTAGCTGCCAGATTT GTTTTCCAATTGCAGCATAGTTCCACTGCACCAAGTTTTTATCTCATCAAGCATTGCAGCAACATAAAGATTAGACTTTGATGAACTTCATATAGTTCAC TATTGCTTGTAAAATCATTGGTTGCTGACATTAATATTTCTATAGTTTTATTTGAGCTTTAAAGAAGACGAGAAGATCATCCGAAAACGCTAAATTAATC ATTTGTAAATGCTTGCAGCCTGGCTGATAATTCTTATCTCTGATAACTAGCTTGATTCTTCTAGTAAGCATGTCAACGAGCATAACAAAGATCAAAGGAG AAAGAGGATCTCCTTGCCCGAGTCCTCTTTTATGTTGAAAAGAGCCCTTTAGTTCACCATTTATGCAAATCGAAAAAAAGCAGGATTTTCAATGCAAGAC ATTGTCCATGCAAAAAATTTATCAGGAAATTTCAGTCCTCTCAACATAGGCCGACCCCTTTCGTGATAGGATTTAAATGTGATGTTTCAAGATATCACCT AATCATGCATTGCCACGATAACATTTTATCGAAATTAGTCTCTCCTAATATGCCGAGGCGGATGTGCTGCAGCCTGCACAAATAGCGAAAATAAAAGAAA CAAAAAAGTTAACTTACTCAGAATATTGCTCATTGATTATGTTGTTACCTCTGCTTATAGAACTAGCCAATTTAATTTACCAGTTATAACTGGTACATAT CTTGTGACCCAAATTTGTCATATGTAGCCTTAACTAAACAGTTTCTGTTGCCTTGTGTTATTCTCCTTTTGTGTGTTCTTATGTTATTTCTCTCTCAATA TTTTAAGGATGGAAAAGGTGGTTGTAAAAAGTGCAAGTACTCAAGCCAAGATTTTGGGTACCATAGTATCAATATCAGGAGCATTTGCAGTGACCCTTTA CAAAGGACCACCAATTATCATCATTTCTCATACACCTTCCAATTCACTTCAGAAACCACTTAACACTTTCAATTCAGTTGATACAAATTGGGCCATTGGT GGTCTTCTACTAACAGCTGAGTATATACTTGTTCCATTATGGTACATTGTGCAGGTACAAATCATGAAGGTGTACCCTAATGAATTGACTGTGATATTCT TTTACAACTCATGTGTTAGCATAATGGCAGCAATTGTAGCTATATTTACAGAGAAAAACTCAAGTGCTTGGAAAATAGGACTAGATACATCATTGGCTTC AATTCTTTGTTCTGGAATTTTTGGGTCTTTCTTGAACAATGCAGTTCATACATGGGTACTACGCATTAAGGGTCCTGTCTATGTAGCAATGTTCAAGCCA CTCTCAATTGCCATTGCTGTTGTTTTGGGAGTTTTGTTC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_145885;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_434258

FPKM

• PAB: 0.2
• PNAB: 0
• PS1: 0.2
• PS2: 0
• PS3: 0.1
• PW1: 0.1
• PW2: 0.2
• PW3: 0.2

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_434258

• Blastp: WAT1-related protein At3g28050 from Arabidopsis with 56.18% of identity
• Blastx: WAT1-related protein At3g28050 from Arabidopsis with 55.8% of identity
• Eggnog: Nodulin MtN21 family protein(ENOG4111ADX)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT3G28050)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019452139.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;