Ll_transcript_433467

• Id Trinity: TRINITY_DN46612_c6_g3_i2
• Name Transcript: Ll_transcript_433467
• Sequence: CCGCCGCCGCCACCGTGGATATGCTTAAGCAAAGGCTTGTTTCCGATTGGCCTAAAGGTTAGTTCATATCAATTTCATTTTTGTTAATTCCATTGAAATG CTTAGTTTTCATGTTTAGGAATAGGTAGTGCCCTAATTTTGAAGAGCTGGTATGTTTCGATTATAGACTTCCAATTTCTATTATATTTGTATCCAGCTAT GTTTAAGGTGGTTGAATTTCATTTGGGAATGATTCTGGGATTGCCGGGTTGTTAAGTTGACAGTGTTTCCGTCAAAATGTCACGAATAAGCTATAGCTGA TGACTGGTTAAATAGGCGTCATATATTTGAGTTGCCTTCAAATGAGGAATGGGCTAACAAGTGCGGAAATTAGCTAATTTGAGACAATTAATATAGATTG GGGCCAAATAGAGAGGATTAGAGCCAAAACAGTCCCAACAGGGGGACCAGATCCAAATAAGGGTTGGAGCACTGTAACCCATGTACAAATAGGATAAAGA AAAAAAGACAAATTTGGCATCCTTGGTGTCGACACTTATAAAATCAGTAGTGGAGTGGCTTAAAAAGTCGAGGCAAGGAAATCTAGTGTGATTGCTTGTG AAGGAGAATTGGGAATGCAGACTGGCATGTGGAAGTGAGGCCACTGAAAAAAATGGCATTTAGGGGCATGTGGCTGGGAGGTTTTATGCAAGTCCCTAAA GATTATCACCACTAGATTTGAATGGTGGGATTAGTTTGTTGATTGGTTGCCAGGAAGGTTAAGACTAAAGATCTAGATCTGGGGTCGAGGAAATGAGTAA AAGCACGCCAGGAAAACGAACAGAAACTGGAAAACTCTGTGGAAGCCCTAGTTGGAAGAAACACTAAGATTCTAGTGGCCAGAGTTGGTGCAGTACCAGG TAAGGGGAAAGATAGTTGCTGGACAAAGATGATATGAAGAGGAAGACCAAACTGAAGGAGCAATGGAAATTGTAATGGAATCAGGTCATGGTCAGAGTGG ATGATATCACAGTGATACCTTGTTGAACTTGAAATCATAAGGAAAATGTGGAAAAAGAGGAAAGGAGATAAAAATACATTGATGGATAAATGGATAATGA AATTTACACTAGCACTCCTATTTATACAAATAGTCTAAGTCAAGTACTGGATTAGTACAATTTCAAGCCCAGCTCAATAAGATTACTAAGTATTAATATA AAAACACTCCTATAATAAAAATAATTCTATCATTCTAACAAGTTACATCTGTCTTTGAGCCCTTCCAAGAAAAAATGAAATATGATTAGTGTTTCCCCCT TCATTTCTTCGTCAACCTTTAAAATGAATTGCCATGCTTAGATGGTTAAAAAGAATGAGAGCAAACATAAAAAATTTCCAGAGCATTCTCAAGTACTATT TGCCAGTCGGCTTGATATGATTGGATGGAACTGTCTAAATGATTTTTTATAATATACTCATTATGACATTAGATAAAGAGGTATAACATCTGAAAGTTGT GGCCAAACTCTTTGCAAGGATTTTTTTCATTAATGGTTTTCTTTTATCAATTATAATTGCATTTAAGTGGCATTTCCTAGCTAAAGAGGAGGTTAAACAT GAGTATCATTCTAATTAAGTTGGTATGTAGTATTATATATTATGGCCTCGTGTACTTTGTCACAAAATTTAAGCATTATACTATTGATGCATTCAATTTG ATATGGTGATTATTTGTGTACTTTCTTTGGATTCTTTACAACTTCTTAAGGACGTTGCATGGCTCAGCTTCTCTTGTGTTCTTTCATTGTACTTGTTTTA TCCCCTATGTGTAGGTAAAACTGTCATACCAAAGGCAGCAAATGAAGTGAAATTGATTAATTCTGGTAAAATCTTGGAAAACAACAAGACTGTTGGCCAG TGTAAAGTACCATTTGGTGAGATTGGAGGGGGAGTTATAATAATGCATGTTGTTGTACAGCCATCTCTTTCAAAAACTAAAGCTGGTAAGTTCCCACAGA CTTCTTTCTATTAGGAAAACATGACATTTTTTAATGGCATTGAAACATATCTCTCAAATTTTTTAAAGGTAATTGCTGCTTTATTTTTGTATGGTGTTAT AATTAACTGGAGTGCACTCAGCTCCAACTTCCATGTGTTAGCAGACATATCCGCATGTTGATTAAATGGTTTGCAAATATGCAGTAGTGACTTAAGAACC CCCTTTTGAGCATCTCAGTCACTTATTGTGTTAGATAAGTTACAAATGGAAGAAAACCAATCAGGGAACTTGTAGATGAACTGAGTTAAACAGCCAGCCT TTTCCTGTACAAACAAGTCGTCTATTTTCCAATTTTTTTACATCAAATTTACAACCCTGTTACTTTGACTAATTAAATAAAAATTCCATGAGAGACATTG AAAACCAAAAGTAATATACGGATTGTCAGTTACTGACAAGCTTTTGACAATATTTTCTCATAAAATCTAACAGGTTTTTATAGTACACTCTGAGTTTAGG TTTTGCTCAGCTCCCATTTAATGGAAAATGTCCCTGGGATTTGGCCTACACAAGTTTTGGAGACTAAGACAATAAGTAATTGATAGGTTTCACATCGTTT ATTTATATTATAGAAATTCAATAAAGTTTTACGTTGGTTGTCGACTACCTAACACCACCTTCACCTTTTTATATATTGTTGACAGTTATAACTAATGGAA ACTTATTATTTGGATGTATATGCTATTTATTGGCTTATTCTATACAAGTTATGTTGACCATGTCTATACAAGAATTTCTCCATTTAATAACCTGTCTAAT TGTAAAATCAACATGAACAATACTTCACCAGCTGGGCTAGTGTATTTTTGTCTCAGAATTCAATTTACCCTGGTTTGGTTCAGATGGTAAAGGAATTGGG GATGCTTTATTTTTAGGTTCAAATTTCATAACTTAATATCAGTAATATATGGCACTCAACATGTGAAAGAAGGAGATCTGATGCTTTGACTGTTCACTTC TTAGTTTCCTTTTCTATGTATGGGCATCGACTTCCATTTCTTAATGATCGTTGTAGTTTGTAGGTTGGATTTCCTTGCTAAACAGTAATGTATCATACTC CTATTATTGCATTCTATTAAAAAAAAATTAATATGAAGCATATTATGGGCTTTGAAGTCCCTTCATTTTATTTTATTTGCACGAGTCCTGCTATACCTAA GATTTGTAGGTTGAAGCAATAAAATGATACAGTTTGATATATTATTTGTGTTTCTCTTTTCCGGAACAGAAAAGAAGATTGACGATACCCCTAAGAAGGT TGCCTGCTCTTGTTCCATAATGTGAAGAC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_145915;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_433467

FPKM

• PAB: 0.4
• PNAB: 0.2
• PS1: 0.4
• PS2: 0.3
• PS3: 0.4
• PW1: 0.3
• PW2: 0.3
• PW3: 0.3

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_433467

• Blastp: Membrane-anchored ubiquitin-fold protein 3 from Arabidopsis with 79.66% of identity
• Blastx: Membrane-anchored ubiquitin-fold protein 3 from Arabidopsis with 79.66% of identity
• Eggnog: membrane-anchored ubiquitin-fold protein(ENOG4111561)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT4G24990)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019457753.1)
• Pfam: Ubiquitin-2 like Rad60 SUMO-like (PF13881.5)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;