Ll_transcript_434469

• Id Trinity: TRINITY_DN46680_c2_g4_i1
• Name Transcript: Ll_transcript_434469
• Sequence: AAATGATTCCGATTTAATTTCAAAAGGATCTACACCGTCAAAACCCACTATATATATAACATGTTCCTAACATATGCCACCAACGAGGTTCCATTATCAG TTCATCGATTCACTGTTTCTTCTTTTTTGTCTGCTCTCTCTCTCTCTTGAAATCTGTGTCCTTTCGTCAGTGATTGGAACGCAATTAACGTTGCCGTTTT GCTCTCCCACTCTAAAAATTGCATGCTTTATGCTTCTTTCGTTCCTGATTCTGACACTGGATAAACGCTAAACGACGAATCAAAAACGCGTTCCCAACAT GATCTCTTCTTCTTACACTCTTTTCAGTTCACCAACATCATCACTTTTTGTGTCTGACTCTCACTCCTTTCTTCAAAACCATAACCATTCAATTCGATTT GGATCTTAAGTTTCAAATTTCTCATCAATTAATCTCCATTCATCAAAGTTCAATTAATCCTCAACAATCAAGTAAAAGAAGACAACAAAAAATCTCAGAA ATCTGAAGTTGTTGGATCTGATTCTTCCAATTTAGAGAAAATCTCACTTAATCTTCTGAATCAGTGCACTGAATCATTTTCTTCACAACAGAAACTGAAT TAAGAGAAAAAATCTGAACTTTTTCTCAGAACAAAATGGGGAAATCAACAAGCACGAGGAATAGTAGAGAGTGGAATCAGATCTACGCGATTTATGGAAT GGATCAATGGCAAACCCTAATTTTCCTTTTAACACAAGCGATTCTCTTTTCAGTGCTTTCAATTATTTACCTTCTTTACTTCACTTCAATCTGCGTCTTC TTCGAGTTAATGCTCCCTTCCGGCACCGCCAGATTCGCCGCAGGTTTCACCGGTGCCGTTATAGCTCTCTCCGCCGTGTGTTTATACTTCGCCGCCGCGA ACTTCTTCTACTCCGCCGTCCCCCTCCAATATGACATGGCCAACCGCATCGTCTCCGCCGTCTCCGACTGGTCCTCCGTCAAGCTCGCCCTCGACCTCGG CTGCTGCGGCCGCGGCATCCTCCTCAACGCCGTCGCCACGCAGCTGAAAAAGGAAGGCTCCTCCGGCCGCGTCGTAGGGCTGGACCGGTCGAAGCAAACC ACGCTCTCCACGCTCAGAACCGCCGTGACGGAAGGCGTCGGAGAATACGTCACGTGCCGGGAGGGCGACGCGAGGAGGCTGCCGTTCCCGGATAACTACT TCGACGTGGTGGTTTCGGGCGTTTTTGTGCACACCGTCGGCGTTGGACGGCGGAGTGCGGCGGAGGCGGCGGCGGAGAGGATGAGAGCGGTGGGGGAAGT AGTTAGGGTAATGAAACCGGGTGGAGTAGGTGTTGTGTGGGACCTACTGCACGTGCCAGAATATGTGATGAGGTTGAAGGAATTGAATATGGAAGATGTT AGAGTTTCAGAATGTGTTACTGCTTTCATGGTTAGTAGCCACATCGTTTCTTTCAGGAAACCTAGTCACCAATTTCTTCTGGGCCCACCTGAGGTTAGAT TGGATTGGAGATTATGCTGACGTGTAAATTTTGAATGACCTTTAATAGTATAATAAATTTACGGTGAATCAAGTGAGAGCAGTTCTTCGATCGAAAATTG AGGATAGTGAGTTTAGATCATATGATTATATATTCTTTATGGATGATTATGATTATGAGTTAGTTAATAATCATATATGATTATCACTTAAAAGAGTTAT GAATGTTTGCTTTTAATCTTAATTGTTCATATAATATTTAATCTATGTTAATTGTTATGATTTCTTTATAGAAGGATTAATGGACTGATGATTGTTTCAA TATATACTTACAAATATATTAGGGGTAAGAGTTTTTTACTTATTGACTTTTTAAAAAATAATAGAAATAAAATGTGAATGATGTATTGATTATGTATAAA TTTTTGCACTTTTATTGTATAGATTATATTGTATCTCTATAAAGGCTAAGTGCAACTTTTAAAGTAAGAGTGTCTAATGTAGTTAGCATACTAAATTTGG ATCCTTCTGTTCCAAAAAAAATATGCTCCTATCCCTAACTAAAAATATTACACGCAATAATATAAAATTGTTAGTTTTATTTTTATAATTTTTTATGTTA TCCACGTACTACTTTTCAATTGGTTGAGACAAGAAATTAGGATAGAATTGGAGACAAGTGATCTATGTCCTCTATTACCAACAAAAAGGTGAGATGAAAC TACTTTTAAAATTTTAAGTTGATTGAGGATGTCACTATCTTATTTATTTTGAAGTTTTTCTAATGTCTTCTCTCCATGTGAGGTTGGATTCTCTATTTAA GAAAAGTTGAAAGCTGGTGGTGATTATTTGATGAGAAAAGTAGTTAGTGATTATTTTCATTCCATCACAATTCAACTTTGTGGAGGTTGTGAATTGATAT GATAGCATGGAAAGATACCCGTTAGAGTGTCATAATCATATATCTATAGAACATGGTGGTGTATTTTAACAATGTCCTACATGAGTTTGTTACAAGTTCA TATCTCATGGTTATGAAACAATGGTTGGTAGTGTTGGTTTGTGGTTAAGAAATAAAATGGTTGAATAAAAATTATATAATCCTCTTCAAAATTACTTGTA TTGGGTTCATATGTCTAATTATAAAAATTTAACTTGCTCATAATCCGTGTAGAGAAGAAGCTTCAGTAACACCTTGGTGACAAGCTAGTTGAAAACTTAC AAGTTTATCAAAAGTTAATAGGTTGAGTTAAAATCTGAATGCAAAAAGCTACCATTGTTCCATAACATTTTATTCCTTCGGTCTCTTGCTTATATATAAG GTACATTTTATAAGGTATCTCTATCTATCCTTACATATAATCACTTTTAATATATAGATATTATTAAATAATTAATATCATACATCCTCATTCTATATGC ATCCTATTATTACTTATCCATATTTCAATAATCATTTCACTTTCTCCATAGTAAAGAATGAAGGAATAATGTTAAATTTTTATGTAATTTTTAACACAAT TGAACGTAAAAACAAATTTTACCAACTTCTTTAATATGTGTGAATTTGGTAAATGTGACTTATAATTAGGGGTACGTGGATTAATTTTTTGATTTTTTTT CTTCAAATTTTTAGATGTTTTATAAATTCTATACATATTTATATTTTACTTTTAAACTATACCATTATTTATTACTCATCTC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_146379;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_434469

FPKM

• PAB: 4.7
• PNAB: 5.7
• PS1: 10.8
• PS2: 4.3
• PS3: 5.8
• PW1: 13.6
• PW2: 14
• PW3: 8.7

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_434469

• Blastp: Demethylmenaquinone methyltransferase from Lactobacillus with 30.82% of identity
• Blastx: -
• Eggnog: Methyltransferase required for the conversion of demethylmenaquinone (DMKH2) to menaquinone (MKH2)(COG2226)
• Kegg: Link to kegg annotations (lp_3431)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019443979.1)
• Pfam: ubiE/COQ5 methyltransferase family (PF01209.17)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;