Ll_transcript_315974

• Id Trinity: TRINITY_DN46704_c1_g1_i1
• Name Transcript: Ll_transcript_315974
• Sequence: ATTGTTCATAAATTTTTTTAGGGAATAACTTGAGTTTTTCCTAAGAAATTAAGGGGAATGAAGTTAAAGGAAGAAAAGAGATGAAAAATGAAAGAAGTTG ATGGTAATGACAAGGAACTGGGTTGAGTTGGGTTGCCTTTACTTTTCTTCTCATCCTTCTTTCCCTTTTCACAAAATCTAATCCTAATATTTAATTATCA CAAAACCAAACAAAACCATCTACAAAACAATCTTACATTGCTTCATTCATCTACCCCTTTTGATTCTTTGCCAACTTTTTCTTACTTCATATAACCCTCA ATCTCTTTCTGTATTTTTTCTTCGTGAAAAAAAAGGTTTTTTTGTTGACTTGATTGTCTAAATTGGTTGTTGTTGGGTCCAAGAGCCAGAGCTATGCAAG GCCAACTTGTGTGTAGTGGCTGTAGGAGCAATTTGCTTTACCCTAGAGGGGCACCAAATGTTTGTTGTGCACTGTGCAACACAATTACATCTGTTCCTCC ACCCGGAATGGAAATGTCTCAACTTTACTGTGGAGGCTGTAGGACATTGCTAATGTACCCATGTGGAGCTACAAGTGTGAGATGTTCCTGCTGTCACACC GTAAACCTTGCACCGGGTACTACATATTTGTTTGCTGCCAGACATGTGAAGTTAGTGGTTTAATATTCATTGCTAGATAATATTTGTTTTCTATTTTATA ATGGTTGCGGTGTTTTGTTGATTTGCATGATCATTGAGATTGAGTATGGTTATCATAAATGGGGTTATCAATTCCTAGTGTGGAAGTTAGCAGGGGTGCA GTAAAGTGATACTTTGTTGTTCCCTTTCTACCCTTGTGTATGTTTCAAGTTTTATGTTGATAAGGTGTTTGAGAGGGGATTCTTGAAAGGTATCATGTCA TGCACAATTTAGCTATGTTGCTCACGGAATAAAAATCAATGTTAGGTTGTTGTTCACTCACCATGTCTTGCAATGACCCCTTACTATTTAGGTATTCCAT TTTGGGAAACTGTAATAGTTCGTTGATTTGGGATCTTTGTGATTTAGATGATTGCTAAGTGGCTTGGTAATTAGTAAGAAGCCTATTTCTCCCTCAAAAA AAGAAACTAGCCGATTTCTCTGGGGGAGGGAGGATCATCTGACCTTGATTTAGTCTTCCTTGCTAAATTGGCTGTCATTGGGAGATTCGTTCTTGACAAT TTTGAATTACTCGTTGATTATTTGCATTTACTCCAAAGCTGGTGTTATTAATTTTATTGTCTGTTTTATCTTGGTGGCAATTATGTTGGTGAATGCTATT CATTGTTCTCTTTAGAGCTCTACCACGAAGAACTCATACGTAAAATCTCATCGCTTACGTTACAAAAATGCTGGGTGCTTATGCATTAGTTCTATCTTCT TCACTTCATGTCACTCCAATGAAGGATTCCTTGTTATATTGTAATAACCTATAGTTATTATTCAATTATTTGAAGTTTACTAGCTTACTGTTGACGGGTT TTTTGTTTATTATAAAAAGCGTCTAACCATGTCGCCCATGTGCATTGTGGGAACTGCCGGACAACGCTCATGTATCCTTATGGAGCTCCCTCTGTCAAAT GTGCAATCTGTCACTATATTACTAATGTCAGTATGATCAATGGAGGGTTTCCAATTCCTGTTCATAGCCCTAATGGGATGACCAACTCTGCAACAGTACC TTCTACTTCAACATCAATGCCTCAATCTCAGAGTCACACTGTCGTCGTAGAAAATCCGATGTCTGTTGATTCAAATGGGAAATTGGTGAGCAATGTCGTT GTTGGCGTTACAACAGATAAAAAATAATGCCATCATGCTTAAAGGATTCAGAATATGATGCATTATGATAATTGCTGTGCCATGAAGATATTTTTGTTGT TGAAATGGATCTTTTTCAAATACAAAGGGTTAGACAGATATTATGTAAGAATGTATATGAGAAGGACAAGTGAAAAGGGCTTAAAACGTTTTTTTTTTTT TGCTTTCCAAATCCTACTTTGTTGTTGGCTCTTGAATCCATAGCCACAAATCAATTTGGTTCATTGAGCTTGTATCTTGAATTGCAAGTCCTGGATGAGC ATATGGTGTTATTTCTTTCAAGCTTGTGCTTTTCTTGATTATATATGAGAAGGATGTGTTGATATTTGATAATGATTGTTGCATATGCAATGCATGATAA AG
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_146565;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_315974

FPKM

• PAB: 1.8
• PNAB: 1.8
• PS1: 0.7
• PS2: 0.9
• PS3: 1.8
• PW1: 0.6
• PW2: 0.6
• PW3: 0.1

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_315974

• Blastp: -
• Blastx: Protein LSD1 from Arabidopsis with 69.31% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: Link to kegg annotations (AT4G20380)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019435215.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;