Ll_transcript_315983

• Id Trinity: TRINITY_DN46704_c1_g1_i4
• Name Transcript: Ll_transcript_315983
• Sequence: ATTGTTCATAAATTTTTTTAGGGAATAACTTGAGTTTTTCCTAAGAAATTAAGGGGAATGAAGTTAAAGGAAGAAAAGAGATGAAAAATGAAAGAAGTTG ATGGTAATGACAAGGAACTGGGTTGAGTTGGGTTGCCTTTACTTTTCTTCTCATCCTTCTTTCCCTTTTCACAAAATCTAATCCTAATATTTAATTATCA CAAAACCAAACAAAACCATCTACAAAACAATCTTACATTGCTTCATTCATCTACCCCTTTTGATTCTTTGCCAACTTTTTCTTACTTCATATAACCCTCA ATCTCTTTCTGTATTTTTTCTTCGTGAAAAAAAAGGTTTTTTTGTTGACTTGATTGTCTAAATTGGTTGTTGTTGGGTCCAAGAGCCAGAGCTATGCAAG GCCAACTTGTGTGTAGTGGCTGTAGGAGCAATTTGCTTTACCCTAGAGGGGCACCAAATGTTTGTTGTGCACTGTGCAACACAATTACATCTGTTCCTCC ACCCGGAATGGAAATGTCTCAACTTTACTGTGGAGGCTGTAGGACATTGCTAATGTACCCATGTGGAGCTACAAGTGTGAGATGTTCCTGCTGTCACACC GTAAACCTTGCACCGGGTACTACATATTTGTTTGCTGCCAGACATGTGAAGTTAGTGGTTTAATATTCATTGCTAGATAATATTTGTTTTCTATTTTATA ATGGTTGCGGTGTTTTGTTGATTTGCATGATCATTGAGATTGAGTATGGTTATCATAAATGGGGTTATCAATTCCTAGTGTGGAAGTTAGCAGGGGTGCA GTAAAGTGATACTTTGTTGTTCCCTTTCTACCCTTGTGTATGTTTCAAGTTTTATGTTGATAAGGTGTTTGAGAGGGGATTCTTGAAAGGTATCATGTCA TGCACAATTTAGCTATGTTGCTCACGGAATAAAAATCAATGTTAGGTTGTTGTTCACTCACCATGTCTTGCAATGACCCCTTACTATTTAGGTATTCCAT TTTGGGAAACTGTAATAGTTCGTTGATTTGGGATCTTTGTGATTTAGATGATTGCTAAGTGGCTTGGTAATTAGTAAGAAGCCTATTTCTCCCTCAAAAA AAGAAACTAGCCGATTTCTCTGGGGGAGGGAGGATCATCTGACCTTGATTTAGTCTTCCTTGCTAAATTGGCTGTCATTGGGAGATTCGTTCTTGACAAT TTTGAATTACTCGTTGATTATTTGCATTTACTCCAAAGCTGGTGTTATTAATTTTATTGTCTGTTTTATCTTGGTGGCAATTATGTTGGTGAATGCTATT CATTGTTCTCTTTAGAGCTCTACCACGAAGAACTCATACGTAAAATCTCATCGCTTACGTTACAAAAATGCTGGGTGCTTATGCATTAGTTCTATCTTCT TCACTTCATGTCACTCCAATGAAGGATTCCTTGTTATATTGTAATAACCTATAGTTATTATTCAATTATTTGAAGTTTACTAGCTTACTGTTGACGGGTT TTTTGTTTATTATAAAAAGCGTCTAACCATGTCGCCCATGTGCATTGTGGGAACTGCCGGACAACGCTCATGTATCCTTATGGAGCTCCCTCTGTCAAAT GTGCAATCTGTCACTATATTACTAATGTCAGTGTAAGTATTCATTGATACAATTATGTTAGTCTATGCATTGACTTTCTATTCCTAAGAAACTTATAAAG TTTTAAAATAAAATGCTAGTGATTTTTGCATCCCAATGTTCGGCTTTCATTTCGAAAGTAGGCAACTTCCTGCAGTCATATTAACTTCATTGTTGCATAA TTGCATCTTGAATAATTGGATCTTTGACATGTTTCCTTGGCCGATGCTTTTTCCTCAAGCAAAGTCCCTTGATTTGGAGTGTCTTCCTCAGGAAACACTT TTAATTAATTAAGTTTATGACTATGTAGGTATTTAATTATTTATATGTTTTAACTTATTACCTGTATTCTTTAATAGGATAAATGTAGATAATTCTTTAA TAGTCTTGTCTCCTGTTTATTTTTCGTAAGTTTGGTCATGTAAGTAATTTTATGCCAGTCATCAGAGATTGCGATCCAACCTAAAATATTGGACTTGGTA TGTGTTAAAACCCACTTATTTGCCCTACTATAACTTACCCAATTCTGATTCAATGTTGGAGATATCTGTGAAGGGTTATGTCATCATACACACTACATAG ATTATGTGATTATTGTTCTCCTTCGGGGCTTGCTAGTGTTTCTTGTAAATATGATGTGTGCACTTATTTTTGTACGTTTAACATCGCTGAGTTGATTTTT TATACATTTTCCTGGCATTTGCAGATGATCAATGGAGGGTTTCCAATTCCTGTTCATAGCCCTAATGGGATGACCAACTCTGCAACAGTACCTTCTACTT CAACATCAATGCCTCAATCTCAGAGTCACACTGTCGTCGTAGAAAATCCGATGTCTGTTGATTCAAATGGGAAATTGGTGAGCAATGTCGTTGTTGGCGT TACAACAGATAAAAAATAATGCCATCATGCTTAAAGGATTCAGAATATGATGCATTATGATAATTGCTGTGCCATGAAGATATTTTTGTTGTTGAAATGG ATCTTTTTCAAATACAAAGGGTTAGACAGATATTATGTAAGAATGTATATGAGAAGGACAAGTGAAAAGGGCTTAAAACGTTTTTTTTTTTTTGCTTTCC AAATCCTACTTTGTTGTTGGCTCTTGAATCCATAGCCACAAATCAATTTGGTTCATTGAGCTTGTATCTTGAATTGCAAGTCCTGGATGAGCATATGGTG TTATTTCTTTCAAGCTTGTGCTTTTCTTGATTATATATGAGAAGGATGTGTTGATATTTGATAATGATTGTTGCATATGCAATGCATGATAAAG
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_146565;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_315983

FPKM

• PAB: 0
• PNAB: 0
• PS1: 0.3
• PS2: 0.2
• PS3: 0
• PW1: 0
• PW2: 0
• PW3: 0.4

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_315983

• Blastp: Protein LSD1 from Arabidopsis with 65.71% of identity
• Blastx: Protein LOL1 from Arabidopsis with 75% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: Link to kegg annotations (AT4G20380)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019435044.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;