Ll_transcript_315992

Id TrinityTRINITY_DN46704_c1_g1_i8
Name TranscriptLl_transcript_315992
SequenceATTGTTCATAAATTTTTTTAGGGAATAACTTGAGTTTTTCCTAAGAAATTAAGGGGAATGAAGTTAAAGGAAGAAAAGAGATGAAAAATGAAAGAAGTTG ATGCTATGCAAGGCCAACTTGTGTGTAGTGGCTGTAGGAGCAATTTGCTTTACCCTAGAGGGGCACCAAATGTTTGTTGTGCACTGTGCAACACAATTAC ATCTGTTCCTCCACCCGGAATGGAAATGTCTCAACTTTACTGTGGAGGCTGTAGGACATTGCTAATGTACCCATGTGGAGCTACAAGTGTGAGATGTTCC TGCTGTCACACCGTAAACCTTGCACCGGGTACTACATATTTGTTTGCTGCCAGACATGTGAAGTTAGTGGTTTAATATTCATTGCTAGATAATATTTGTT TTCTATTTTATAATGGTTGCGGTGTTTTGTTGATTTGCATGATCATTGAGATTGAGTATGGTTATCATAAATGGGGTTATCAATTCCTAGTGTGGAAGTT AGCAGGGGTGCAGTAAAGTGATACTTTGTTGTTCCCTTTCTACCCTTGTGTATGTTTCAAGTTTTATGTTGATAAGGTGTTTGAGAGGGGATTCTTGAAA GGTATCATGTCATGCACAATTTAGCTATGTTGCTCACGGAATAAAAATCAATGTTAGGTTGTTGTTCACTCACCATGTCTTGCAATGACCCCTTACTATT TAGGTATTCCATTTTGGGAAACTGTAATAGTTCGTTGATTTGGGATCTTTGTGATTTAGATGATTGCTAAGTGGCTTGGTAATTAGTAAGAAGCCTATTT CTCCCTCAAAAAAAGAAACTAGCCGATTTCTCTGGGGGAGGGAGGATCATCTGACCTTGATTTAGTCTTCCTTGCTAAATTGGCTGTCATTGGGAGATTC GTTCTTGACAATTTTGAATTACTCGTTGATTATTTGCATTTACTCCAAAGCTGGTGTTATTAATTTTATTGTCTGTTTTATCTTGGTGGCAATTATGTTG GTGAATGCTATTCATTGTTCTCTTTAGAGCTCTACCACGAAGAACTCATACGTAAAATCTCATCGCTTACGTTACAAAAATGCTGGGTGCTTATGCATTA GTTCTATCTTCTTCACTTCATGTCACTCCAATGAAGGATTCCTTGTTATATTGTAATAACCTATAGTTATTATTCAATTATTTGAAGTTTACTAGCTTAC TGTTGACGGGTTTTTTGTTTATTATAAAAAGCGTCTAACCATGTCGCCCATGTGCATTGTGGGAACTGCCGGACAACGCTCATGTATCCTTATGGAGCTC CCTCTGTCAAATGTGCAATCTGTCACTATATTACTAATGTCAGTGTAAGTATTCATTGATACAATTATGTTAGTCTATGCATTGACTTTCTATTCCTAAG AAACTTATAAAGTTTTAAAATAAAATGCTAGTGATTTTTGCATCCCAATGTTCGGCTTTCATTTCGAAAGTAGGCAACTTCCTGCAGTCATATTAACTTC ATTGTTGCATAATTGCATCTTGAATAATTGGATCTTTGACATGTTTCCTTGGCCGATGCTTTTTCCTCAAGCAAAGTCCCTTGATTTGGAGTGTCTTCCT CAGGAAACACTTTTAATTAATTAAGTTTATGACTATGTAGGTATTTAATTATTTATATGTTTTAACTTATTACCTGTATTCTTTAATAGGATAAATGTAG ATAATTCTTTAATAGTCTTGTCTCCTGTTTATTTTTCGTAAGTTTGGTCATGTAAGTAATTTTATGCCAGTCATCAGAGATTGCGATCCAACCTAAAATA TTGGACTTGGTATGTGTTAAAACCCACTTATTTGCCCTACTATAACTTACCCAATTCTGATTCAATGTTGGAGATATCTGTGAAGGGTTATGTCATCATA CACACTACATAGATTATGTGATTATTGTTCTCCTTCGGGGCTTGCTAGTGTTTCTTGTAAATATGATGTGTGCACTTATTTTTGTACGTTTAACATCGCT GAGTTGATTTTTTATACATTTTCCTGGCATTTGCAGATGATCAATGGAGGGTTTCCAATTCCTGTTCATAGCCCTAATGGGATGACCAACTCTGCAACAG TACCTTCTACTTCAACATCAATGCCTCAATCTCAGAGTCACACTGTCGTCGTAGAAAATCCGATGTCTGTTGATTCAAATGGGAAATTGGTGAGCAATGT CGTTGTTGGCGTTACAACAGATAAAAAATAATGCCATCATGCTTAAAGGATTCAGAATATGATGCATTATGATAATTGCTGTGCCATGAAGATATTTTTG TTGTTGAAATGGATCTTTTTCAAATACAAAGGGTTAGACAGATATTATGTAAGAATGTATATGAGAAGGACAAGTGAAAAGGGCTTAAAACGTTTTTTTT TTTTTGCTTTCCAAATCCTACTTTGTTGTTGGCTCTTGAATCCATAGCCACAAATCAATTTGGTTCATTGAGCTTGTATCTTGAATTGCAAGTCCTGGAT GAGCATATGGTGTTATTTCTTTCAAGCTTGTGCTTTTCTTGATTATATATGAGAAGGATGTGTTGATATTTGATAATGATTGTTGCATATGCAATGCATG ATAAAG BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_146565; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_315992

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_315992
BlastpProtein LSD1 from Arabidopsis with 65.71% of identity
BlastxProtein LOL1 from Arabidopsis with 75% of identity
Eggnog-
KeggLink to kegg annotations (AT4G20380)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019435044.1)
Pfam-
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;