Id Trinity | TRINITY_DN46708_c3_g1_i10 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_315397 |
Sequence | CGCCACCGATTCTCAAAATCAGGCACGTTTTTCCTTTCCCTTCAATTTCTATCTATTTCTATTATATATAGTATTACAGTTTCTGTAATTTCATCATATT TGTTTCCGATCATCGTTTCGCTTTCTTGCTGTTCATTTCTTTTTTGGTATCATCTCTCTTTCATTGTTTTTTATGAATCATCTGCATCTTTAATTGTATG TACTTGCTACTTGATTGCTTTTTCTTTTCTGTTTGATTATGCGACTCTCCTTGTTTATGATCTTTTGATTCTCAGATTGTTTTTTGCTTTACACTTTTGG ATTTACCTTTGGGAAATTTTGTGGCTTATTATCTTTTGTTGTTATTATTTTGAGCTTTGTTTGTGTTTGATTGGTTTACATGTATCAAATTTCTGGTAAG AATCGTAGAAAATAGAAATCATCATATCTTTCATTTCATCTTTAGTTACCTAGTTATTTCATTAGTATCCTTGTGTTGGCGTGATTTTTCTTAGAATTCC TTTGAATCAATTGGGTTTAGATGTTTTTTTGTTATGCAGGTTTCTTGGTGCTGTTGGTGTATTGTACATAATAACATTTATATAAGCTGGTGAGTTTTGC TTTCTTGGGAAATTCTCCTTGAATATTTTCTCTTCCACCTTTTTAATAATAACTTACTCCAAATAGGTCTTTTAAAAAGTTTGAGTTATATGTGCCGTAT AGCTTTGGGTTTATACATTAAAAAGTTAATGATGTTATTATTAGTGGCAAAACTGGTTCCGCCGTTGCATCTGCGTTGCACAGGTTATGGAAGTGGGTGA TTTCTTCTTCATTTGGTATATCCCATCACATTCTCTGAATTGCAGATGGGGTGTTGCAGGATCTTCTGAATCTTGGATTAATGGAGTGACTATAAAACTG ATGACTTTGGCATGTTCTATTTTGTCATGATTTATTAACATGATAAGCTGCTGTTATGGAGTGTTATAAGCAAACTTTCATATAGAAGAAGAAAGTGTAT TGTATCAAATGGAATGTGTCCTTTAAATGAAGGTTATACATCTTCTGTGATTGGATGCTTGTTTGGCATCAAATGACCTAGCAACTATGCCAATGATATT GTGGCTATAGATTTGCCACATCCAATGATTAGTGATTCAAGATGTTGGTCTGGACTGTTAAAGGAAATTTAGGGAGGTGCATGCGACTTTACATATATCA TTGTTAATAGTTCTAAGTGGTGGTGCTCTTAGGTGCTAAGATTTGGATGTTTGCAAACCTCAGTCCTATATCCCTGTGACTTGTACATGCTCAAGTCAAA TTCTTCCTGTTCTCCTCGTTTGGAATCTGACATTTATGGTAACTGCTATGAAGATGGTTCTATTTAGCGGGGACTAGTATAATGAGTTAAACACCACAGT TTTCACAGTATTCACTAGATACGAGTATGCACTATGCAGGCTGCAGTTTTCATAGAGTATTCACCAAGGTATGAGTTTGCACTACGCAGGCTGAGCTTTA AACCATCACACTATGCAGGCTGCAACTTTGAGGTTTGAAACACTAGGGCATGCCATTTATGGAGATTGGAAACTACTCAGTGCTGTGTATCCTCTCTCAA ACGACATAGATGGCCCGTTGTATTTATGCAGTTTGAGTCTGCTGAAATTTGATTTCTCATATAATACAACAATTCATGGCTGGGATTAGTGTAGATATGG ATGATGCTTTTATTTGGTTGTCGGCTTGTGAGCTTGTTGACATGGAAGCTGTTTGATTATGGCGAGTTGATTATAATCTTCACTCGTGGTCCAAAATGTT GAGGAATGAAGTAACACTAGTGCCAAGGTGTTGATCCTCTAACCAAATTGCAAGGCACCATGCCTTTTGCATTACCTATATATGTGGGATGGAGATATTT TAATTCCATGTTCAGGCTTATACACCCTAAATTTTTTGTTGTCATGCCTTATCGAGGCTCAGGATGCTCACTCTTAACCGGACAAACAATTGTGTTTGAT TGTGAAGATAATTCTTTAGAATAGGGTATGGGAACATGTTTTGGTTTTCAATATTCTGGTAAAAGACAAATTTGTATGTGAAGCCCGTAATGTGGGAGAA ATAGTCATATTATTATTTTAGAAGGTTTTATATTTATTTCGAATTTTCCATGTTTTTTATGTAAAGCCTCTATGCCACATGATTATGGCTTGTAAGATGA AAATAGTTTTGAATAAATTTGATAATAAAATAAATGATTTCTTTGAGACGGTAAGGTTGCTTGCATTTTGACCTGGAAACGGTCCCTTTGCTTGCGATGG TAAGGTTGTGTATATCTACCCTCCCTAGATCCCACTTGGTGGTCCTTGTGCACTAGGCTTTCCTTTTATTTACATTCTGAAGGTTTGTCTTGTTGTTCAG GAATTGTTTATTTTAAAGTGAAATTTGAAATTAAAATTAAAATTTAATGTTAGGTGAAAGGGCAGTAACATCCGTAGTTTTCTGGTGTTCACTGTTTTCA AGAAAGTACTTGTTCAATAATGCTTCACATTTAAGTTAGTTTCTACCATATTTGTAATGTGCTTGTAACGTATGAGCTTATTTTGTCCTCATAAAAGCAT AAAATGAGAACACTTGAGAGCTATTAGCTGAAAAGCTTCTAGTAGTTTACCTTCCGTATATTTTTATCACATCACCCCTATCTTTTATGCCAAGGTATAC ATCTTTCTACTTTTTTTGAAGGAAATTTTTTTGTTTTTGTTCTTAAGTCGAACTTAACTACATTGTGTTCTATGTTCTTTTCTCTTCAAAACAAGTTTGT GTAATTTCTGTTTTGTTTTCTTTTTGCTGGTACATAGGAGTTGCATAACTTATTTGCATTTCTTTGTTCGTATCTTGATAACTGATATAATAAAAAGCAA AGGTATGACTATTTCCTCCTAGGTGCTTGATGCCTGTGCATAGTTGATCACCTTTTTTTAAGTGCAGGAAATGATTAGAAAATATTAACTCCTAACACTT CCTAAACCTTACCCAGGTAATATGTTTGATTTAGTCATTGTTTATTCCAATCCTTCCTCTTTTTATTAAGTCAAAGCTGAACTCTTGCTGCCATTCATGA TAAGCTAGAGTGAGGACTGAGGATCCATCATCTCGTTTAAATCTCAACAATGTCATTTTTTCCCTTCCTTTTATTCACTTTTTTTCCTCATCTTTGTTTT CATAGCTCAGACTAGAAGGTGCTCTTTCTGTATCAGTGGAGGGGTGCGAGTAAAATAGCTTCAAGTTAGTCGAGTTATTCGGGGTTGTTGGTCATATATT ATGGTTAAGGAGACCATGAGTGCAAGTGTTTATTGTTTACAAGCCAGTTCTGTAGATTGGCTGTGAATCCCTTCTCTCCTTCAGAAATAATTGCTAGTGT TTATCCTCCCGTTTGGTTGAATTGCTGTTGTAAGGCTGCTATTTATGCTTCAATTTTCATGTGTGCCCTTTGTTGACCATTAAGTTGTAACCTACTAACC TTTTATCTTTCATGCAAGTTTTGATGGTGTGTTGGAACAATATCATAGATAATATTTAATACATGGTAGTATTGTCTTCTTTGATGATTGAACACATCAT CTTGACATCCAATGGAATCGTATATCAACTGGTTATTTTTAATTTGCTCCAATGTATGCCTAGATCCTTTTGCACTATGGGCAATGATGAAAACTGATGA ATATAATGTATGACAAAGGGGATTTTATAATGTTATGGAAGGGTGATGGTGGTTGTATTATTGTATATCCTGCAAATGGATGAATGAATTCAGGCTAGAT GTAATTGAGGCAGTATTCCTTTTCTAATACTAATAAGGTCAAGGAAATATTTTTTCCAATCACACACATAGCATCACCTCTAGATATGGCCAACCTTCTG TTCTTGTTAGTAGTTACTATTTGTAGTCATGTTACTCTTGATATGCTACTCAATTCATGATAATGAAACTATTAATTCTTACTTTTAAAATGTCTACTCT ATCTTGTGGGAAATATGACTTCTGACCCCAATGATTAATAAATTAGGTTCACTTTTAACTGAGCTTGACTGTATCTGCTACGTGCTCACAGTACTACATG CAATATTTTAGGTTGTCATTGGAATGTTTGAATTGAATTTAGCATCCAAGTTTTTAGAGTATGCATGGTGATTTTCTTTTCTGTATTTGACTAGAAGTAC GTGTTATACATATTTAGACAGGTTCAATTGAGTGTGTTTGAACAAGAATACTTAAGGTGCAATTGAATATTGATAAAAGTGTTTTAATGTGTTGTTATTT CATAATAGACACAATAATTGTAGAGCTTTGGTCTCTTAAAGACGGGCTTAGAAGCAGCAGTGCTTTTGTTTTGAACTAACTTGTCTTTTTCTTTTCAATT CTTCATTGCTCTTTTGCCTTTACAGATTGTGAGTTATTTGCAGATTTGACTTGGCTACACTGTCCGTTGACTCCTGAGATTACAAGCAACAGAATGGGGC ATAGACACTTTTATAACACAACTCCAACGTTTGAGGGCGAGCCTGACCAGAATTGGAATCATATGCATGCAGATCAACATCATGTGAACCTTGGTATGCC TAACACTTCAGAAAATGTTTCGTTTATTTATCCTGTGGAAAGTATGTCTTCAGATAGTGTTTCTTTCCCCGCTCATTGGAACTCTACCACAAGCTCAAAT GGATACGCATTATCAACTCTCAACATTGAAGTACCTCCTCATCAATTGGATGCATTGGGCACTTCTAATAATCATTTTATGCATTCATCTAGCGCTGGAG CTTTCAGTGCAGTGTCTGAAAATCATGAACATCAGCCTTCTTCCGGTTATGATGGGCAAGCATTTCATTGTAATGGTGGTTTTATTGATCTTACAATGGG AAGTGGAAGAGGGACTCACAAGCGTAAGAGCCCTGGAATTTCTCCAGTTTTTGAGAGAGGCAGTACAAGCAGATACTTTAATGCTGGGAGTTCAACTGAT CATCATATATCTTCAGAACTACGGCCAGAGAAGCCAACTATAGATTCCCAATATATGCCTTGGGATCATGTTACTACGACACCCACATTCAGAGGTGGTG GCCTTTCAATTAGGGGTGAGAGTTCTTTAAGGAATGTGAGGAGTCGTTCTGCACTGGATTTGGAATCCAACCTTGCTAGGACCCATTTATCCAGTAATCA TTTGCACAACTCCTATTCTGCTGACCTCCCAGTTGAGCATTCTAGCATGGTAGATCTTTCAGGCCAGACTTCTAGTGCTTTGCGGAGGGATTGGAGCCAA ATGAGTATATCTCCTGCTCATGGAAGGCTTTTATTACCAGATACAAGTGCTTTCAGTCTTGAGGCAAGTCATTTCCTTATTGGAAGTGGTACTACTGCTA GTAATGCTTCTATCGATGTTGGGACTTTCCACCCAGAACAAGCTAGTACAAGCAGAAACCCTCCTGCTCCTCAAAATTTTCATAATCATCTGACTCAGAC TGCTAGGGGAGTTAGAAGTAATTATTCTCAGAGATCCACTCCAACTTTTAGGGCTTCTCCAGGCTTATGCTTGGGATATGTGACTTCTTCAGATGATGGA TTGCCTATGGTAGCTGAAAATTACCCTTCCAGACATCCAAGGCCGCCCGCCACCAGTCGCTGGCGGAACAATGATAGAAATGGGAGGTCAAGAGTATCTA GTGATAGACATCGATCATTGATTAATGAGGGTTTCATTGCTGTTGAGCGTGCTTCACTTTATGGTTCTAGGAACATGCTTGACCAGCACAGAGATATGAG GATGGACATAGACAACATGAGTTATGAGGAACTACTTGCACTTGGGGAGAGGATTGGCCATGTGAGCACAGGATTATCTGAGGATATGCTTTCCAAGTGT TTGACTGAATCAATATATTGTTCATCTGACCAAACCCAAGATGAAGCAACCTGTGTAGTCTGCCTAGTAAGTTTTTTTTCTTCTTCTTCTTCTTATTCCA TTTATACTAAATAATAAAAATAATAATTTAAATGTGCATTTGGATAACATTAATTAGGTGTTTACTAGTTGCTATTGAAATTTACAGGAAGAATACAAGA ACATGGATGATGTTGGGACACTTAAAACTTGTAAACATGACTACCATGTTAGCTGCATTAAAAAGTGG BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_146600; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_315397
Blastp | E3 ubiquitin-protein ligase MBR2 from Arabidopsis with 44.44% of identity |
---|---|
Blastx | E3 ubiquitin-protein ligase MBR2 from Arabidopsis with 44.44% of identity |
Eggnog | zinc ion binding(ENOG41121N2) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT4G34040) |
CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0000692) |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019425433.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |