| Id Trinity | TRINITY_DN46708_c3_g1_i2 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_315386 |
| Sequence | CGCCACCGATTCTCAAAATCAGGCACGTTTTTCCTTTCCCTTCAATTTCTATCTATTTCTATTATATATAGTATTACAGTTTCTGTAATTTCATCATATT TGTTTCCGATCATCGTTTCGCTTTCTTGCTGTTCATTTCTTTTTTGGTATCATCTCTCTTTCATTGTTTTTTATGAATCATCTGCATCTTTAATTGTATG TACTTGCTACTTGATTGCTTTTTCTTTTCTGTTTGATTATGCGACTCTCCTTGTTTATGATCTTTTGATTCTCAGATTGTTTTTTGCTTTACACTTTTGG ATTTACCTTTGGGAAATTTTGTGGCTTATTATCTTTTGTTGTTATTATTTTGAGCTTTGTTTGTGTTTGATTGGTTTACATGTATCAAATTTCTGGTAAG AATCGTAGAAAATAGAAATCATCATATCTTTCATTTCATCTTTAGTTACCTAGTTATTTCATTAGTATCCTTGTGTTGGCGTGATTTTTCTTAGAATTCC TTTGAATCAATTGGGTTTAGATGTTTTTTTGTTATGCAGGTTTCTTGGTGCTGTTGGTGTATTGTACATAATAACATTTATATAAGCTGGTGAGTTTTGC TTTCTTGGGAAATTCTCCTTGAATATTTTCTCTTCCACCTTTTTAATAATAACTTACTCCAAATAGGTCTTTTAAAAAGTTTGAGTTATATGTGCCGTAT AGCTTTGGGTTTATACATTAAAAAGTTAATGATGTTATTATTAGTGGCAAAACTGGTTCCGCCGTTGCATCTGCGTTGCACAGGTTATGGAAGTGGGTGA TTTCTTCTTCATTTGGTATATCCCATCACATTCTCTGAATTGCAGATGGGGTGTTGCAGGATCTTCTGAATCTTGGATTAATGGAGTGACTATAAAACTG 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TAATGCTTCTATCGATGTTGGGACTTTCCACCCAGAACAAGCTAGTACAAGCAGAAACCCTCCTGCTCCTCAAAATTTTCATAATCATCTGACTCAGACT GCTAGGGGAGTTAGAAGTAATTATTCTCAGAGATCCACTCCAACTTTTAGGGCTTCTCCAGGCTTATGCTTGGGATATGTGACTTCTTCAGATGATGGAT TGCCTATGGTAGCTGAAAATTACCCTTCCAGACATCCAAGGCCGCCCGCCACCAGTCGCTGGCGGAACAATGATAGAAATGGGAGGTCAAGAGTATCTAG TGATAGACATCGATCATTGATTAATGAGGTTGGTCTTCTAAATTGATTTTCTTCTCATCTATTGGTATCTTGAGGGACTTTATTTTTTTTACCATGGGGA TGATAGATCTGTGTAATGATTAGAATTTGAGTGTGCACCATCTTAGTTAACCTTAAATGGGGGTGTTTAGTTTATTTCCAAATTTTAAGAAAATTAGTTC CTCTATATAACCTTTTTGTGGATAGGACTGTTACAGTATTTGTTAGGGTATGTTTGGGAGGATGGTGTTTTCCTCTATATAATCTGTGTTTTTTTTTGTT TTTTTTAGGGTTTCATTGCTGTTGAGCGTGCTTCACTTTATGGTTCTAGGAACATGCTTGACCAGCACAGAGATATGAGGATGGACATAGACAACATGAG TTATGAGGAACTACTTGCACTTGGGGAGAGGATTGGCCATGTGAGCACAGGATTATCTGAGGATATGCTTTCCAAGTGTTTGACTGAATCAATATATTGT TCATCTGACCAAACCCAAGATGAAGCAACCTGTGTAGTCTGCCTAGTAAGTTTTTTTTCTTCTTCTTCTTCTTATTCCATTTATACTAAATAATAAAAAT AATAATTTAAATGTGCATTTGGATAACATTAATTAGGTGTTTACTAGTTGCTATTGAAATTTACAGGAAGAATACAAGAACATGGATGATGTTGGGACAC TTAAAACTTGTAAACATGACTACCATGTTAGCTGCATTAAAAAGTGG BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_146600; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_315386
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | E3 ubiquitin-protein ligase MBR2 from Arabidopsis with 60% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0000692) |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019425433.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |