Id Trinity | TRINITY_DN46708_c3_g1_i4 |
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Name Transcript | Ll_transcript_315388 |
Sequence | CGCCACCGATTCTCAAAATCAGGCACGTTTTTCCTTTCCCTTCAATTTCTATCTATTTCTATTATATATAGTATTACAGTTTCTGTAATTTCATCATATT TGTTTCCGATCATCGTTTCGCTTTCTTGCTGTTCATTTCTTTTTTGGTTTCTTGGTGCTGTTGGTGTATTGTACATAATAACATTTATATAAGCTGGTGA GTTTTGCTTTCTTGGGAAATTCTCCTTGAATATTTTCTCTTCCACCTTTTTAATAATAACTTACTCCAAATAGGTCTTTTAAAAAGTTTGAGTTATATGT GCCGTATAGCTTTGGGTTTATACATTAAAAAGTTAATGATGTTATTATTAGTGGCAAAACTGGTTCCGCCGTTGCATCTGCGTTGCACAGGTTATGGAAG TGGGTGATTTCTTCTTCATTTGGTATATCCCATCACATTCTCTGAATTGCAGATGGGGTGTTGCAGGATCTTCTGAATCTTGGATTAATGGAGTGACTAT AAAACTGATGACTTTGGCATGTTCTATTTTGTCATGATTTATTAACATGATAAGCTGCTGTTATGGAGTGTTATAAGCAAACTTTCATATAGAAGAAGAA AGTGTATTGTATCAAATGGAATGTGTCCTTTAAATGAAGGTTATACATCTTCTGTGATTGGATGCTTGTTTGGCATCAAATGACCTAGCAACTATGCCAA TGATATTGTGGCTATAGATTTGCCACATCCAATGATTAGTGATTCAAGATGTTGGTCTGGACTGTTAAAGGAAATTTAGGGAGGTGCATGCGACTTTACA TATATCATTGTTAATAGTTCTAAGTGGTGGTGCTCTTAGGTGCTAAGATTTGGATGTTTGCAAACCTCAGTCCTATATCCCTGTGACTTGTACATGCTCA 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TATGAGGATGGACATAGACAACATGAGTTATGAGGAACTACTTGCACTTGGGGAGAGGATTGGCCATGTGAGCACAGGATTATCTGAGGATATGCTTTCC AAGTGTTTGACTGAATCAATATATTGTTCATCTGACCAAACCCAAGATGAAGCAACCTGTGTAGTCTGCCTAGAAGAATACAAGAACATGGATGATGTTG GGACACTTAAAACTTGTAAACATGACTACCATGTTAGCTGCATTAAAAAGTGGTTATCTATGAAGAAAATATGTCCTATCTGCAAAACTTCTGCTTTGCC TGAGGATACAAAGGATAAATAAAATTTATTCCTTCTCTTCTAGCTTAGCTTCTCTCATTTTGTATATATATTTAAACATTCATCAAATTGGAGCAAACAC ACTTCTTTTTACAAATGTTGTAACAAAAAATATGCTTCTGGATATCATCAATGCATTTGTTGTTGTTTTTTAAGCTTCCATCTAATTATGGGAAGCCTTG TAAATTAGTCTGTGCTTTTCTGTTTGCTTTCAGGACAGGGATTGTTTTATTCAATCTTGAAATAGTCATTGCTTACTAACATGATGAAAGATGCTAGTGG CACACTATTTTCAACTATTCGTCCATCACTTTCTTATTGTTTAAATTTTATATGGGATCCACTAGTATAAGTTTATTCTCTATTTAATAGGTAGCACACT AGCACATGAACTCTCATTCTGAAAAAATTGTGGCCATATTGCTCCACACAGTATTTTATAAACTCATACAAGTTAAGTC BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_146600; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_315388
Blastp | E3 ubiquitin-protein ligase MBR2 from Arabidopsis with 47.68% of identity |
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Blastx | E3 ubiquitin-protein ligase MBR2 from Arabidopsis with 47.68% of identity |
Eggnog | zinc ion binding(ENOG41121N2) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT4G34040) |
CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0000692) |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019425433.1) |
Pfam | RING-H2 zinc finger domain (PF12678.6) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |