Id Trinity | TRINITY_DN46718_c3_g1_i10 |
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Name Transcript | Ll_transcript_315759 |
Sequence | TAGAAAACGATCCCTGTTTCTCTCTTCGTTCATTCGTACGTACACTCTGTAACACTTATCGGCTCCAATTCAGACCCGCACTCTCTTCTCTTCTCTTCTC ACACCCAATTCCCAATCCAACCATGACACACGACAAACCCATCATAACATGCCTTCATATCCCACACCTCAAACTCTCTTCTTACAACGCCGTTTACCAC CCCCGCCAACCTCTCATTCACGACGCTACTCTCTCTTTCGCCGCCAGTGGCATCGTTTGTAAATTCGCATGCGTCTCAGTGGCAGAAACGAAATTTCACA AGGACTCCATGCCAACAACGTCTCAGCTTATGAAACATCCGTTGGCCGTTGTCGCACTCGTTCCTAAAGATGCTGCCCTGTTCCTCGCCGGAGCTATTGC CGGCGCCGCCGCGAAGACCGTCACTGCCCCGCTCGACCGTATCAAGCTCCTCATGCAGACTTATGGTGTGAGAATTGGACAAGAGAGTGCCAAGAAGACG ATTAGTTTAGTTGAGGTATTACAATCATTAGTCATCTAACGCAGTTATTCAAATTGCGAACACATCAGGTGATGCCACCGCAATCGTCACCGCAACCGTA GTTTAAAACAAAGCAATGCATTTAATATTAAATTTAATAATATGCACTTGCTTATAATAGTAATTACCGAAAATTGTCCCTGAGAAAAAAATAAGCTCTC AAATTTAGTATGGACTATTGAGAAATGAAAAAAATCTCAACTTGGTTTCTAAGAATCTCAAAATTCTGTCAAATTAGTTATTGTTCGAAAAACTGAGGGA CATATTAGTTCATATCAAGAACCGTTTGATATTCTTAGTGAGGAAGTTGAGATTTTTCATTTTCCATGGACAAAATTGGGGATGCATTTTTTCTGAGGGA CTAATATGGGCATTTACATTATTTACAATTTTCAATGATGTTTTAAAATGGCGCATATATTGCAGGGTTCAACCCGAGTCTATATAAAATTATAAACTTT CGACACTACTAATGTGTTTCATTGTGGAGAATCTATGATGTGATGTTTTTCTTCCAAGTTGTCAATTGATTAAGCTAAATTGTATGCATTGCTGACATAC TAATGACAACTGAAATTGTTGCATGTGCTATTACTAGCTTGTAAATGCTTAACACCGGTCTGTCTGCTTGTTGCTGGTTAGTGATTGATAACTACTCGAG TTGGTTGAGGTTATACGCTCTTAACGGTGCATCCTTATAATTATTGTTGGAGTATTATGTTTCTTATTGTTTATATGAATCTTATTATGTTAATAGTCTC ATTGAAGTGATAAATGCTAGAAACACATTCTATTTAACACTTTTTTTTGGTACACTCCTTATTATTGACTGAGTTCCATGTTGGACCCACTAAATCACAT GAGTTCACTCTCTATTTTGTGGGACATGCATGACCTCCATAAATAATAGTGTGTTGAAGTGAGTGTGTCGCTAGCCTTGACTTGTGCTAGTTAATAGTTT TGCTAATCTTGTTCTTGACATTGACTATTAGCATAATAGTTAGCCTTGTGCAGAGTTTTCTAACCAATCATATAATCAGATTTGATATTATTCAGAGTCT CTTCTCTCTTTTATTTTCTTCAAAACCATATTGTTGAGAGAAATGAAATGGGAGAATTCTGTGAAGATCGCTAAACTGACTTGTAGAAGATCTGAGTGTC ACTAGTGAGTTCCTTTGATTAAGGATGTCTAGTTACATGGCATGTACAAAATGTTTTTTGTTGGTCTTGACAAAATCCTTGCTTGATGATCTTGCTTTTG CCCATATTAGATGCATTGGGCTCTCTAATGACTGATCTGAACATTAAGTTATAAAATATTTCTTGGAGCTTACATGGACAAGTATTTCAGGCCATTACAG TTATAGGGAAGGAAGAAGGCATTAAAGGTTACTGGAAGGGCAACCTCCCTCAGGTGATTCGAGTTATACCCTACAGTGCCGTTCAGCTTTTTGCTTATGA AATTTATAAGAAAATATTCAGAGGAAAGAATGATGAACTCTCTGTTGTGGGAAGACTTGCTGCAGGTGCGTTTGCTGGCATGACATCCACTTTTATAACG TACCCATTAGATGTACTGAGATTACGATTAGCTGTTGAACCTGGTTGCCGAAGCATGTCAGAGGTTGCCTTGAGCATGCTAAAAGAGGAAGGATTTGCAT CTTTCTACTATGGTCTTGGGCCTTCTCTCATTGGAATAGCTCCTTATATTGCAGTGAACTTTTGTGTTTTTGACTTATTAAAGAAGTCGTTACCAGAGAA GTATCAAAAAAGAACTGAAACGTCACTACTCACTGCTGTGCTTTCGGCATCACTTGCTACGCTTACATGCTATCCTCTGGATACTGTGAGAAGACAGATG CAATTGAAGGGTACACCTTATAAGACAGTATTAGATGCCATTTCAGGTGAGGATTGGTTCCACTTACTTTTTTAGTATCACCATTTTACAATTGCCAATA CACTTATATTTGTGCACATAATATAAGCTCCATTGATAATTCAACTTAAGAAGTTTATAAGGGCAAAAAACTAAGAATTATAGTTTTCTTTTTGTTACAT TGTTTATAAACTCTCATGGATCTTAAGAGGTTTGTAGCTGATGTAATTAATTAACTTAATTGGTGCCTCTGTGCTAAGTGTTATTTATTTTATCATTCCC ATATGCACTAGCCATTTTAGTTGGGTGTATTCATCCTAGCTTATATTGACTACATGAGGAATGTTTCTAATGAAGTAGTTTATGAAATAACAAGCGCTAG ATCCCCAGGATGACCAAAAGGTCAAGAGTTTGATTCCTGGGAGTGCCACTTGTTGGGAGGGGCAGCTACGCACCCCGAAAGAGATTAGTTCCCTTGGTAG TACCAACAAAAAAATAAGTGCATGCATACTTAATTGTCATGGATGAACGTAAACACACTAGTTTCTATCAACATGTTAACCTTCTTGTGGTGAATCCATC CTTATCAACAAGTCAGTCACTGACTCACAGTGATTCACAATTTTCCTACTCTTGACTGGATACTAGGATTTTTCTTACCGAGGATTGCTTTAACAGAATG AGGTCAACCAGTTCATTTGTCTTCTTCCAGTTCTGTTTTTTTATACTGAAAGGTTTACTGGTGCAAGTAGATTTGCCCATATGTTTATAGTGAAGGTTGC AATATACGGCAATGCTATTGCTAAATTTGAAAATGCTGGGTGGTGCACTTGTTTGGAAGTTATTTGAATTTGCTGTATCATAATAATGATGAGAACTTTC TGGAGGCGCGATGAGGCATGTAGACATGCAGTTATGTGGTTTCTGGCTGTGAAGACAAGCATGGATTAGTTAGTCATGGCAAAGAAAGCCCATCATTGTC TACATTTGGTTTCTTATTATGATTAAAATTTTAAATGTCATAAGTGAAACTTTTAAAGTATAGATATAGGATTTTGTGTCTTCGCCTACTTGTGGAAACT TAAAATTCTACTTTTTGTCTTCAATTCTCAGATTGTGATTGTGTGTATGCCTCCTCCAAAGTAATGTTCTAAATGCACTTGGACATGAACTATAACATTT GTTTTATGTGGAACTTTATACAGCTAAAAGACAATAGAATATGCTGTGCCCAGTGTTCAATTTTCAGGCATCATCACTTCCCAACCTTTTTAGTATTTTG CCTGAGTTTCAGCTTTCAACAGTATAAATAATATAAAAATAATTGATTTTGGGGAGGGATCAATTTACTCCAAGAGTAAGTCTAAAAATACTTACTCTTG GAATAAGTTGATCCCCTCCCTTGATTTTGAGTACATAATCCAAGGTAGTTCATTTTTTTGGATTTATTTAAATGATAGGGGTTTTCAAAGCTTAAAATGC TTGTGTGGTTTGTGTTATTACCAAATTATTTACTTCATTGATGCAGGTATTGTAGCCCGGGATGGAGTTATTGGCTTGTATAGGGGATTTGTGCCCAATG CTTTAAAAAATCTACCGAGCAGCAGCATCAGGCTTACCACATAT BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_146698; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_315759
Blastp | Probable envelope ADP,ATP carrier protein, chloroplastic from Arabidopsis with 78.05% of identity |
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Blastx | Thylakoid ADP,ATP carrier protein, chloroplastic from Arabidopsis with 80.75% of identity |
Eggnog | Solute carrier family 25(ENOG410ZRF1) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT3G51870) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019464776.1) |
Pfam | Mitochondrial carrier protein (PF00153.26) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |