Ll_transcript_315087

• Id Trinity: TRINITY_DN46777_c0_g1_i13
• Name Transcript: Ll_transcript_315087
• Sequence: GATCAACATACAAGTAATGAAACACGCAAACACATCATTTCCCCCTAATATGCATTGGATTTAGCAGAAAAAACTACAGAACAAAATATATAATAATATC ACTACTAAATAAACAAAAAGCTGGATCGACATGTCACTATTACAATGTATCAATTCTACACGGAAACCATGACGAGTAAGCTTATATGGGTAATCAATGT AGCTTCTCACATTCCGATTATAAATTCATCAATTCACAATCAACATTCCACAATTGCACCATCCATAAAATAACAAGAAACATAGTCCAAATCTCATTAA AAAGTTTGAGGCAAAAATGAAGTCTAAGGGATCCATTTTGATGAAGCTTGTGATTCTTCAGTACTTGGCAGTTCTCTGTTTTTCACAGGATTTTGATTTC TTCTACTTTGTTCAGCAGGTTAGATTAGTTTTAAACTTGATTGAAACTTCACTCTTTCATTTCCATTAGTGAGGTTCTGATTATTATATATCTAAAATTG TGTGTTTGAAATTGGTATTTTATGCAGTGGCCAGGATCTTACTGTGACACACAGCGAAGTTGTTGTTACCCAACAACTGGAAAGCCTTCTGCCGATTTTG GCATTCATGGGCTTTGGCCTAATTACAAAGATGGCTCTTACCCTTCTAATTGTGATCCTAATAACCCTTTTCAGCCATCTCAGGTATTACTTTCTTATAG ATACACTTTCTGCTTGCAAGTTAAGGCTGTGTCTACTCTCCTTCGGCTTCGTGCACTGGGCCGCCCATTTTGTATATATACTCAATGATAATTTTTATTT TATGAAGCCATATCTATTTATTTGATGCTTTATTTTCCACTTATGTATGACAGATATCAGACCTCATCAGTAGCTTACGGAGGAATTGGCCCACACTAGC ATGCCCAAGTGGGAATGGGATACAATTCTGGACCCATGAATGGGAGAAACATGGAACATGTTCAGAATCAATCCTACGTAGCCAACATGATTATTTTGAA TCAGCTCTTAACCTCAAGCAAAGAGCAAACCTCCTACAAGCTCTTACAAGTGCAGGTACATTACATGTTACACTTTGCATTTTAATCTTGTATTTATGTA AATGTCACCATACTGTTACATGAAGAACATAGATTCTCTGTCCCAAAAAGTAGTCTATGTTATTCAATAATATTTTATAAAATAATATTAAATATTGATT TATTTTTTATAACTTTTTTTCCAATTAAGTGATGTATTTTGATTGGTTTGAGACACTATTGGAGACATCAAAAAGGACATGTGATCTCCGTAAGTCACAT GAGTGCCAAATTTAATTATGATTGTTAACATTTTATTTAATAATTAAAAAAATTGTGATTTTATGGCACCTAATTACCTTGTATTTGTTAATAGGAATAC AACCTGATGGGGGGTCTTATAGCTTGAGCAGCATTAATTCAGCAATAAAAGGTGCTATTGGGTACACTCCATTTATTCAGTGCAATGTGGACTCAACTAG TAACAGCCAACTTTACCAAGTTTACTTGTGTGTGAACACCAATGGGTCAGACTTCATCGAGTGTCCTGTGTTCCCTAGTGGCAGATGTGCTTCAGAAATT GAGTTCCCATCTTTCTAATTCCATTGGATTAATCTACCCCTCCATGTTCATTTGATTAGTTTTGCTTACATTAATGTTATTGTATACATGTTACATTGTT CCATTGCTTTTTAGTTACTTTCATATTCTAGTCCACTAGTACTTGTTATACCAATGTTACTCATCAATTGTACTTGTACTTCTTTCAATTGGTTTGTGCT TTATGGGACCTAATGTTTTCCTTGACCATTAGTTATATTACCAAAAGTGAAATTTTTTGACGCATTTGGATCACAAACTTTGTTACTCAATGTATAGAAG ACAAATCCCATTAACTCAATTAATAAC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_147103;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_315087

FPKM

• PAB: 4
• PNAB: 0.2
• PS1: 0.3
• PS2: 0
• PS3: 0.1
• PW1: 1.3
• PW2: 2.2
• PW3: 1.9

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_315087

• Blastp: -
• Blastx: Ribonuclease 1 from Arabidopsis with 60.24% of identity
• Eggnog: ribonuclease T2 activity(ENOG4111M7G)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT2G02990)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019434081.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;