Id Trinity | TRINITY_DN46782_c0_g1_i8 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_315112 |
Sequence | GAATTTATAAAATTATGGATACCCCAGATCCACTAACTAATCAAGGATTGGAGTGATGCAAACCCATTGCAGTGAAAAATTGAATTCCAATAGGTAATTT TGAAAATGAGTTGTGAAGTCAACCCAATTTAGAGTGAAGAATATGAGAATGAGGGTTTCGGTAACAGCATAACACAACTACATTTGTTGTTTGTTGGATT ACTTTCTTTGCCATTCTTCCTTTTTACATTTCAAACAAATCACCCAGATCAGTGTTTTTTGTTATCATGTGATTGCTGTGGTTGTTTTGTTTTGTTTTAG ATGTACTCTGCTATCTTGGGGTGTCAATTTCCTCTTATAAAGTCTTCACCTTTCCTTATATTTTCCACTGGGTCTTCTAGTTTTACATCATTACCCAATA ACCCTTACCCTTTGTCTAGATCCACCATGTTTGCGACCACTGAATCTATGACTCACACCCACAATACTCATTCAAATCCTTCTCTCCTAAATGGAATTGG TAGCTGCAGTTTAGAAAATAAAGTTGATGAGCTTCGTGCGCTTATGGGGAAAGTAGATGGTGACCCATTGAGAATAGTTGGCGTTGGAGCTGGTGCATGG GGAAGTGTATTCACAGCTATGTTACAAGAGGCTTATGGTGGATTAAGAGATAAGGTTGTGATTAGGATATGGAGAAGAGGTGGAAGAACGGTTGATAGGG CCACCGCTGAGCACTTGTTTGATGTCATCAATTCAAGGGAGGATGTACTGAGGAGGCTCATTAGGCGCTGTGCATATTTGAAATATGTTGAGGCCAGATT AGGTGATAGGATCCTTTATGCTGATGAGATTTTGAAAGATGGGTTTTGCTTCAATATGATTGATACCCCTTTGTGCCCTCTCAAGGTTGTCACAAACTTG CAGGAGGCTGTATGGGATGCTGATATTGTTATTAACGGCTTGCCATCAACTGAAACGCGCCAGGTGTTTGAAGAAATTAGCAACTATTGGAATGATAGAA TTACTCTTCCTGTTATTATTTCCTTGGCAAAGGGTGTGGAGGCTGAATTCAGTCCTCAACCACGCATCATAACTCCCACTCTAATGATCAATCGAGCAAC TGGTGTCCCCATTGAGAACATTCTATATCTTGGTGGACCTAACATTGCCTCTGAAATTTACAACAAGGAATATGCAAATGCTAGGATATGTGGAGCGGAA AAATGGAGGAAACCATTGGCAGTGTTTTTGAGGCAACCCCACTTTATAGTGTGGGATAATGGTGACCTTGTTACTCATGAAGTTATGGGCGGATTAAAGA ATGTATATGCTATTGGAGCAGGAATGGTAGGTGGTTTAACAAATGAAAGTGCGACAAGCAAATCAGTGTACTTTGCTCACTGTACATCAGAGATGATATT CATCACTCATCTATTGGCAGAAGAACCAGAGAAGCTTGCAGGACCTCTGTTGGCAGATACATATGTAACTCTATTAAAAGGGCGTAATGCATGGTATGGG CAAAAACTAGCCAAAGGGGAGTTGAGGCTTGAAATGGGTGACAGCATCAAGGGGAAGGGGATGATTCAGGTAACATACCTGTGGTTGTTGAAGAGTTTGT TTGTATAGTGGTGCTTATGAATGATGTTTATTTTGGTAGGGAGTGTCGGCTATCAAAGCCTTTTATGAGCTACTAAGTCATTCCAGCTTAAATGTCCTAA ATCCTGAACAAAACAACCTTGTCGCCCCAGTGGAGCTTTGCCCCATCTTGAAGATGTTGTATAAGATACTCATAACAAGGGAATCTCCGATAGAGGGTAT TCTGGGAGCATTGAGAGATGAGACGATGAATGATCCGCGTGACCGTATTCAGATAGCTCAAACCCATGTATTTTTCAGGCCATCTCTTCTTGGTCAGCAG AGTTAGAATCCCAGTATGGATGGGAATGGATTTGATTTGATTTAATTTAATTTAATTTAACATAATAGTTGAAGTGTGTTGTTATGGTAACAGCAATCGT GGAGAATATATATTAATTGTTGAGAATATTAGCAAATTATTTGTTGTTGTGTCAGCAAAAATAGTGAATTATTGAAATGATATAAGAAAAGTACAAAAAT GTTGGCACCAGATTCGGGATAGAGATTTGAAAGTTTCTTTGGGTTGTATTTTATGTATGCATGTATAGAAAGAAAGGATGAAAGGAGAGTGAAAAGCAGA ATGGAGAAGTACCTGAGAGATAACTTCAGCGTAGACCACAAACATCCCTCCGATACAGCCCTTCTCCGATGGAGATCCGCTGTATCCGTCGTCAAGAATC CCCGTCGCCGCTTTCGCATGGTGGCCAATCTCGCCCAACGCGCCGACGCCGAAAATAAACGCAAGAAGCTCCAGGAAAAGATAAGAGTGGCTCTCTATGT GCAAAAAGCAGCTTTGCATTTTATTAACGCTGGGAGCCGTAGTGGTGGTTACATGCTATCCAAAGAGCTTCAGGAAGCTGGTTTTGGAATTGAACCAGAT GAAATAGGAGCCATTGTTCGATCCCATGACAGAAAATGTTTAGAAAGTCATGGTGGAATTGATGGATTAGCCAGACATGTTTGCGTGTCATTGCAAGATG GTGTTAATTCATGCGATGTTTCTCATAGACAAAATATCTATGGCGTTAACCGCTATGCAGAGAAGCCCCCTCGAAGTTTTTGGATGTTTGTCTGGGATGC AATGCAAGACTTGACTCTAATGATCCTTATGTTATGTGCTGTCATCTCAGCAGGTGTTGGAATATCAACTGAGGGATTTCCAAAAGGGATGTACGATGGA GTGGGAATCATACTATGTATTCTTTTAGTGGTCTTTGTCACTTCAATCAGTGACTATAAACAGTCTTTGCAATTTAAGGATTTAGATAAGGAAAAGAAAA ATGTTAGCATTCAAGTTACAAGAGATGGTAGAAGACAAAAGGTCTCTATTTATGATCTAGTGATAGGAGATATAGTTCATCTGTCAATTGGAGACGTTGT TCCTGCAGATGGGTTATTCATATCAGGTTACAGCTTGTTAATTGATGAATCAAGCCTGTCTGGTGAGAGTGAGGCTGTGAATGTTGATAAACAGAACCCT TTTCTTCTGTGTGGGACAACAGTGCAAGATGGGTCTGCTAAGATGCTAGTCACTTCTGTTGGGATGAGGACTGAATGGGGAAGATTGATGGAAACTCTGA ATGAAGGGGGAGATGATGAGACACCTCTTCAGGTCAAGCTGAATGGGGTTGCAACCATTATTGGGAAGATAGGCTTGGGATTTGCTCTGCTCACATTCCT GGTTCTGACTGGCAGGTTTTTGGTGGAGAAAATAGCTCGCCATGACATCTCTAAATGGTCTCTAAATGATGCATCTCAGCTTCTTGATTTCTTTGCTACC GCTGTCATTATAATTGTAGTGGCAGTCCCGGAGGGGCTGCCTTTGGCAGTGACTCTCAGCCTTGCATTTGCAATGAAGAAATTAATGAATGATAAGGCAC TAGTCAGGCACCTTTCTGCTTGTGAGACCATGGGTTCTGCTGTTTGTATTTGCACAGACAAGACTGGCACTCTGACAACAAATCATATGGTTGTAGACAA AATATGGATTTGTGAACAAAGTAAGGCAATAAAAAGCAGGGACTGCAAGAATGCGTTAAAGCCCTCCCTTTCTGAAGAGATATTTGATCTCCTTTTGCAG TCCATATTTCAGAATACTGGATCAGAGATTGTCAAAGGGCAAGATGGAAGGAACAAAGTCATGGGTACTCCTACAGAGTCAGCACTACTGGAATTTGGCA TGCTTTTAGGAGGTGATTCTAAATCTTATAATGACAAGTATAAGATAGTTAAGGTTGAACCTTTCAATTCAATCAGAAAAATGATGTCTGTGCTTGTGAC TCTTCCTAATGGCACTAACAAGTATAGAGCCTTTTGCAAAGGTGCATCAGAAATTATTGTGGAAAAGTGTGACAAATTTGTTAATGCACAAGGCAAAGTC GAGGAATTGAAAGAAGAACAAAGAAAGATCATCATAGAAATCATCAATGGTTTTGCTTCTGAGGCTCTCAGAACACTCTGCATCGCCTTCAAGGACATTG AAGGGTCTTCTGAAGGTAATAGTATTCCTGAGGATAGTTACACTTTGATTGCTATTATTGGGATCAAGGATCCAGTGAGGCCCGGAGTTAAAGAAGCTGT GAAGACTTGTTTAGCAGCTGGGATTACTGTTAGGATGGTGACTGGTGATAACATAAATACTGCTAAAGCAATAGCTAGGGAATGTGGCATCTTGACTGAT GGAGTGGCTATAGAAGGACCAGAATTCCGGAAACTGAACCATCAACAAATGGAGGAGATAATACCAAAAATACAGGTAATGGCTCGATCCTTGCCTCTTG ATAAGCACACTTTAGTGACCCATTTGAGGAATGATTTTGGTGAAGTTGTGGCAGTAACTGGTGATGGGACCAATGATGCTCCAGCTTTGCATGAGGCCGA TATTGGACTTGCTATGGGTATTGCAGGGACAGAGGTTGCAAAAGAAAATGCGGATGTGATTGTAATGGATGATAACTTCTCAACCATTGTGAATGTTGCC AGATGGGGTCGTTCTGTTTATATTAATATACAAAAGTTCGTGCAGTTCCAGTTAACAGTTAATGTTGTTGCTCTCATGCTGAATTTTATTTCAGCATGCG TGTTAGGCTCTGCTCCTCTATCTGCTGTTCAAATGCTTTGGGTGAACATGATCATGGACACTCTTGGCGCATTGGCACTGGCTACAGAACCTCCTCATGA TGGGCTGATGAAGAGGCCACCTATCGGAAGGAACGCCAAATTCATCACTGGGATCATGTGGAGGAACATAATTGGCCAAAGCATCTACCAAACTATTGTC CTTTTGGTTCTCAAATTTCACGGGAAACAGATTCTCAAGCTCAATGGACCTGATGCTAATTCTGTTCTGAATACTGTCATATTCAACACTTTTGTGTTTT GCCAGGTATTCAACGAAGTAAACAGCCGTGACATGGAGAAGATTAATGTCTTCAAAGGCATATTCAGCAGCTGGGTTTTCATTATGGTCATGATCTCAAC GATAGGCTTTCAGGCCATAATAGTTGAATTTTTGGGTGCTTTTGCTCAAACAGTTCCATTGAGCAAGGAGTTGTGGTTAACAAGTGTGGTGATTGGTGCA GTGAGTTTAATAATAGCTGTTATCCTAAAATGCATTCCTGTCCCTGTTACAAGTTACGTTGCCACTCATCATGATGGTTATCAACAACTCCCAACTGGAC CAGACCTTGCATGAACATCATTCATAATGTGGTTAGTAATATCTTTGACATATTTTTTTTAAATTCCTATACATGCAGATATTATAACTCATTTTTTACT TTTTGCACCTTTGTTTGTGCCTTCAAATTTCTGTTTTCCCATTTCATTCTTTTGAACTAGGATATTAAAGGATGTACTCCTATAAATTTTGTAATTTTTT ATTTTTCGTGACACATTGTAAATTAAAATAAAATTTTAGAACAAAAAGAAGAAAATATAGTGTAG BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_147141; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_315112
Blastp | Putative calcium-transporting ATPase 11, plasma membrane-type from Arabidopsis with 68.31% of identity |
---|---|
Blastx | Putative calcium-transporting ATPase 11, plasma membrane-type from Arabidopsis with 68.31% of identity |
Eggnog | ATPase, Ca transporting, plasma membrane(ENOG410XNNC) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT3G57330) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019449585.1) |
Pfam | Ca2+-ATPase N terminal autoinhibitory domain (PF12515.7) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |