| Id Trinity | TRINITY_DN46854_c1_g2_i2 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_513637 |
| Sequence | GATGAATTGATGACATCGTGAGAATGCAACTTGCAGAAAGCAGAAAATATTTATTGTTCCCCCACTACAGTTTTTTTTATTAATACTATCTTATCTATAG TCAATACGTCTTTCTTTAATATTGAACAAACCATATACCAAATTCCACGTTTTTATTTATTTTTTAGCTCCCTATTTCAGATCCATACTCCAATATAATT TCATTCACAACTGCAACCATATTTGACTCTCACTCACAAGATGCCACTGCAAGATAGTTTTACTGGTAAAACCATCGGCTTAGGACATGTTTTGGCTGCT TCCTTCGCAGGATTAATTGCTGCCGCGGCTGCATCACGTTACCGGTGGCGGAATTCAGTGGCAGCCGGAGACCAAATGATCACCCCCCACCTATATAGAA CGGAATCTGGCCGTGTTGGAAAGATTGAAAAGTTCTCCCACTATGTTGTTAGGCAAATGGGAATTGAAGATGCCAGTGAGGTTCCAGAGCTATGCAGATT GGCCCAAGAATATTTGAGAAAAAACAAAGGGTGCGAGGAAAGCATTTATGAATATTTTGGCAATGAAAATGACTCAGACTCTCTATACCAGAAGTTGATT GAAGAGTTTGACAGATGCATCCTTAGTTATTTTGCATTTCATTGGAACCAAGCTTCTGCTATTATTAGTCAGGTATTGAGTACTGAGTCTACTGGGCAGA AAATAAGGCTCAAGAACATTGTATTAGCAGCTACAAGAAAACAGAGGTTTGAGATAGTAACCAAGAATCTGAAGGTAGCAAGAGTGTTCTCTACATTGGT GGAAGAAATGAAAGCAATAAAGTATGTTTCACAATGTACTGATGTCATGGTTCCCATAGCCCACAGTGAGAGGAGTCCAGTGCTGTTACTTATGGGTGGT GGCATGGGAGCTGGAAAGAGCACTGTTCTTAAAGACATTCTTAAAGAGTAATAATATTCATCTTAATCTATTCTTGTGCAATTATCATTCTTCAACTCAA TTAGTGTTCACAAAAGTATGTATGGATATAATATGTGATTCTTATTTTTGCACAACTTAATCTTAAATTCCTAATTGTTATTACATTCACATTTCTACAG AGTTATACAAATAAATTATTTCATCTAAGCTGATGAGTTTGTTGCCAATGTTTAAGAATTACTGGGACTATATACTAGCTTAGTTTGCAAATTAAAGTTG TTTATATATAGAAAAATGGCTTTGGCAGATCATTTTGGTCAGGAGCAGCTTCAAGTGCAGTGGTTGTTGAGGCAGATGCTTTTAAAGAGAGTGATGTTAT ATATAGAGCCCTTAATTCTAGGGGTCACCATGATGATATGCTTCAAACTGCTGAATTGGTATGTTTGTATGTAAATATCTCCATGTTATTGTGTTATTCT GCAAGATCCAACTAAGGGATCCCTTTGACCTATGATTAAATTCAAAGAGGAAAAGTGTATAAAATGTCCATAAACTTTATACCTTTTGTAAGTAGGTACC ATAAACTTTTTTTCCTTCCTAATTACTCCTTAAACTTTATCATTTAGTAAACTTGGTCCCTATATAAATATATTATTAAATTAATCATGAATTAGAAGAA AATTATTGCAATACATTATATAATCATATATCACGATTACCTAATTAGAGGTTTATGATTAATCTGCTTATGTTTTAATTTCATCCGTTGGGTGCTGTTG CACCTTCCTTTGCTTTAAAAAAAACAAATGACAACAGAATAGATGCAACTAGTATTAGAGCCGTGGTTAATGTTTTGGTCTCCATCAATTTGTACAATAT CCAAGTGAGCACCCTAATGATAATGTTTTGGTCTCCATCAATTTGTACAATATCCAAGTGAGCACCCTAATGATAATGTTTTGGTCTCCACCAATTTGTA CAATATCCAAGTGTGCACCTATAATGATAATGTTTTGGTCTCGTTGTCAATGTATTGCAAGAATTTCCTTCTAATTCATGTTTAATTTAATAATATATTT ATACAAGGACTAATTTCACTAAATGATAAAGTTTAAGGAGTAATTAGGAAAAAAAAAAAGTTCATGGTGCCTACTTGCAAAAGGCATAAAGTTTAGAGAG GTTTTATATACTTTTCTCAATTCAAAGGGTATCTTTTGATCCATGATAACTAAAAAGAAATTGAGTTTGAACTCTGATATCATGTAAAAGTTTAATCTCA AAACAAATTAGTAATGAGATGAATAGCTCATCATGTATTTAAAATCATTCTCGCGACTTGATGTGGACTTACTTCCCAAATCCCAATGCGTCAACTTTCC TTTAAGGTTTGTTTGGGAGTTGGTTTTTGGAGGGGAAGGCTTGGGAGCCATGAAATACACTTGTGAAATGAGCTCAAGTCTTCCCTTTCCTTTCCTCTCA CTCCAAGATCCATCTCCCAAACACACCTTTAGTATCTTAAGCATGTCCCAAATGATTTAAAACTAAAATTTATTCATATACGTTCCTTTTGGTTTGGCCA AGACAAAATGAGAAACATATTAGAATTAAACCCTTTGTGAACCATTTTCAACTAATGATGACACTAATTTAATCAAAATTTGAACAGGTGCATCAATCTT CTACTGATGCTGCATCATCTCTGCTTGTGACAGCTCTAAATGCGGGGCGAGACGTGATCGTGGATGGTACCTTATCATGGGAACCGTTTTTGCAGCAGAC TATTGCACTGGCAAGAAATGTTCACAAATTTAAATACAAAATGGGGGTGGGGTACAAAGTAGCTGAAGATGGAACTATTACTGAAAACTACTGGGAGCAA GTGAATGAGGCTGAAGAAGAACCTCAACCAAAGAAAAATGGTCGAAAGCCTTATCGAATCGAGCTAGTTGGTGTAGTTTGTGATGGCTATCTTGCAGTTG TTAGAGGCATTAGGTATATATGCTTATGGATGTAACTAAATTACTACTTTGGTAATGGCAGGGATTTAAATCATGGTTGCCGCTATTGAAGCCTAATGCA GCTAATTGTGACCAATGCAGTCCGCACTCATGTCATGTTGTGGTTGCTTGCGCAACCAAGATGTTGTAGCCGCATCACATGATGCGGTTCACAATTTGCA TTTAAAAGACTAATGAGTTCGTGTTTATGATATAGATGACAATTCTCATTGTTATATTGACAGGAGATCTATTATGACTGGTAGGGCAGTGAGGGTGAAC TCACAATTGACATCTCACAAAAGATTTGCTAATGCATTTCCAAGATACTGCAAGCTTGTTGACAATGCCAGGCTCTATTGCACAAATGTTGCTGGTGGTT CACCAAAGGTAAGTAAATACCAACATTGTCTGATTTATCTCTCACTCTTGTTATGCGATGATTGGTTGATTTTACTCTTACAAGTAACTAGCATTAATAG GCCAAGAGGGTAACTTTTTTTGTAATACAATGCAGCTCATAGGGTGGAAGGATGGTGATCACAATCTACTAGTTGACCCTGAAAATATCAAGTGCTTGGA AATGATAAGCAGTTTAAATGCTAAAGCTGATTCCATTTATGAGCTTTACAAGGAACCCAACTCTACAATGGGACCAGGTTCTCTTTGGAATGACATTGTT CTGTCACCTTTAAGGCCAAGTTATCAGAAAGAGCTAAGGGAAACCATTCAGAAAATAGAGAAATCCATTAGAAAACCCTAACCATTTATGTTGCATTATA TGTTGTTGCCAAAATCAAGTATTTGATTATCTTGAGAGAGTTTAGAGTTGTCAAGATTTTAAGTTTGCTTGTACAAAATATCTATAAAATTATATCATCT TCAACTATATAAAATTTGACATCCCGATGGAAAGGAAATCACTAAACTATTCACATTACAATAATATATACATATGATTTGTAAATCAATAATTCATAAA TAAAATATTATTTCGTAGCATATATTATTTTATTATGCTTGCGAAGATATATAAAAGAATTTAATATGATAATATATCATTTTTCAACTATTGTATATAA ATGCACCTTTTATTAAAACTAACACAATTGGAACAGAAACCATCCCCTAAATTCCTTTTTGAATTTCCTTAGTTTATCAACTATTCATGAAACATGAGAA AATATATAATCAGCATACAATGGAAGACTCTTGAAAATGATTTAACTCACGTTAATA BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_147710; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_513637
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | - |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019432734.1) |
| Pfam | Zeta toxin (PF06414.11) |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |