Id Trinity | TRINITY_DN46864_c0_g1_i10 |
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Name Transcript | Ll_transcript_513345 |
Sequence | TGCTGTTGATTTTCAGAAATATATATCTACAAAGCCAACTCAATAAGTTGCAGGTGTGTTTACATTTACAATTACACTTTTGAATGAATTATAAGTTCAG AGCTTATTTCTTTATGAATTAAAAAAACAAGTAGTTTTGTTTTGTTAGAGAAGCTTTTTTTTAGAATGTTATATGTATGCATATGGCGTAAAGATTTATA CACAGTCAATATCATCTACGGATTATTTGTTCGAAGAGTTAATGATGATTAAATATGAATGATGTATGATGCATTGATAGTACACCGGCCGTGTATACAT TTGTAATACTTATATTCAATGATGACTAAGAATGAACGGGTGATAGTGTAACTCTTACGCTGTCGGTGTGTACATTTTTTTTAAATAACGACTTATAAGT CAAGTAAGTTAGAGTGACCTTGTGCATCATTTCACACTTGTTGGTTAGCTTATCTGTTATAAGCTTTCAACTCTTGACTTTTTAGCTTTTAACTAGCTTT TCAACATTATACCGATATGATGCATATCTAATACGACTATACACCTATTGTTGAAGAAGAGGAATGATAAATTTGCATAAAAGTTCATAAGACATAATAA ATATATAACTGCTTCTCCAAAATTCTAAATTAAGAAGATACTTAGAGATGGCTAAGAGCATCTACAATGAAGGTTGTATAGAGTTGCATGTTTGGAATGG CAAAGTATGTTGAGGTGTATTCAGCAATTGCATAGCCAATCAATTTTTGAAAAACATTTATATGGTCTGAAAATTATGATGGGCAAAGTTTGACGCGAGA GAGGAAAATTGTACAGTTGCCAGGGTTTGAACCCAAATGCTCACACTTGATATCTCATAGCTCTACCAAGTTAGCTAACTCTTTAGGGCAATGATTTGAT TTCACAACAAAACCCCCACCCTAATACATGTGGGGCCTATTTGATGAAAATTTTAAGTTGGAGTGTGGAGTTTCTTGTGTTGCATAAAAGTAAGATATAT GAGTCGGTTTCTCTCTCTACACTTTCTGTGTGGGTGGTTGTGTGCTTTACAAAGAAGTACGAACACTTCAAAATAGTCCTTATTTTCGTGTTGGACATGC ATTTGTATTAGGTATTTTTGGACACTCCTAACCATATTTTGTAACATTTTATTTTCTTTTTCCGTAGCCCTGTGCTTGAGTCATATTGTATCTGTATCTT GTGTCGCATGTGTGCCTCCTTGGTTTCTTTTGTCTTCAAAGGTAGTTTGAGTTTTGTGCTTGGATCCTATTTATTAATAGAATACTATACCAAATCGAAG AATTGTATGGTGTGAAACACAAAAAATAAAATTGAAGAGCCAAGTCTGTTCGGATGGTCTTTATAAAACATATGAGAAAGGTAATTTTTTAAGAGTACTA GAGTGTATTAGAAAATATTGAATTAAAAGAAAGGAGACTCAGATGCTTACTCCATGGATACACATGACACATCCATTAAGTATTAAACATTATCAATATT GGATATGTATCCGATATGGCAACGTGAAGCAATTGGAAGTATTAGTGCATTGTAGCTTTAAATCATTTTAGTTCTGTTATGCTTTTCCATCTTATTTGGT CTTAATTCAATCTTAAATTTCAAATGTTTGCATCATGTCCTCAAGGACGAACCAAACTATATTTTTCTTTTTTTCTTTGTAGGGTGAGATTGTCAGCCTT AATCTCAGATTATATGCTTACCATAAGTTGGATCCCCTAAACATTACCAGTGCTACAATTCAGGACCCTAATACTTTTGTGAGTGGAAACTTCAAAAGAA ATCTAGCACTTTTTTCCTCCTTCACACTTCTATTTATCCCTCTTACTATTTTCAAGTACATAGACTATGTATCAAAGTCAAGATTGTCTGACAATATATC AGAACAAATTTCTCTAAAGAAACAAATAGCATATTGGGTTGATGTCTTTTTATCAGTTCACCCATATGCTAAGCCACTTGTTTTGTTAGTTGCAACACTG TTGCTAATTTTTCTTGGAGGATTGGCCCTTTTTGGTGTGACTCCCGAGGATTTAGCACATTGCCTCTGGTTATCTTGGACCTATGTTGCTGATTCTGGCA ACCACGCCAGCTCCGAAGGTATTGGTCCCAGGTTAGTTGCGGTTTCCATTAGCTTTGGTGGGATGCTTATATTTGCAATGATGCTTGGGCTTGTATCTGA TGCAATTTCTGAGAAGTTTGATTCGCTGAGGAAAGGAAAAAGCGAGGTGGTTGAACAAAACCATACTTTGATTCTTGGCTGGAGCGATAAATTGGGTTCA TTACTGAATCAGCTTGCCATAGCCAATGAGAACCTATGTGGGGGAACTGTTGTAGTGATGGCTGAGCGAGACAAGGAAGAAATGGAGCTTGACATTGCAA AAATGGAGTTTGACTTCAAAGGAACATCTGTCATATGCAGAAGTGGCAGTCCCGTAATTTTAGCTGATCTGAAAAAGGTTTCTGTTTCAAAGGCTCGTGC AATAATTGTCCTTGCTGAAGATGGGAATGCTGATCAGAGTGATGCCCGCGCTTTGAGAACAGTCTTAAGTCTAACTGGAGTCAAAGATGGATTACGAGGG CACATAGTGGTTGAGTTGAGTGATTTAGACAATGAGGTCCTTGTTAAACTTGTTGGTGGTGATCTTGTTGAAACTGTCGTAGCTCATGATGTCATTGGTC GGTTGATGATTCAATGTGCTCGGCAGCCTGGACTTGCACAGATTTGGGAAGATATACTTGGATTCGAGAATTGTGAATTCTACATTAAAAGATGGCCGCA GTTGGATGGTATGCAATTTGAGGATGTATTGATCAGCTTTCCTGATGCAATTCCTTGTGGAGTCAAAGTTGCAGCACATGGTGGTAAAATTATTTTGAAT CCAGATGACACCTATGTTCTACAAGCAGGTGATGAAGTTCTGGTCATTGCGGAGGATGATGATACCTATGCCCCAGTGTCCTTGCCTAAGGTTTGGAGGG GAAGCTTACCCAAGGACTTTGTTTGTCCAAAGTCTCCAGAAAGAATACTTTTTTGTGGTTGGAGGCGTGATATGGAGGACATGATCATGGTTTTAGATGC ATCTCTTGCAGAGGATTCTGAACTCTGGATGTTCAATGATGTTCCAGAAAAAGAGAGGGAAAAGAAGCTAACAGATGGTGGCCTTGACATAAATCGATTG GAAAATATTTCACTGGTTAATCGTGAGGGGAATGCTGTCATACGTCGTCACTTGGAAAGCCTTCCATTGGAATCATTTGATTCGATATTGATTTTGGCCG ATGAATCAGTAGAGGATTCAGCAATTCAAGCCGACTCTAGATCTCTTGCCACATTGCTTTTAATTCGTGACATACAAGCTAAGCGTCTTCCTTATAGTCA AGCTGATGGAGGAAGCTTCTCAAAAGGTTCATGGATGGGGGAAATGAAGCAGGCTTCAGATAAAACAGTTATAATCAGTGAAATTTTGGATCCAAGGACA AAAAATCTTTTATCTATGTCAAAAATTAGTGATTATGTTTTATCAAATGAACTTGTCAGCATGGCTTTGGCCATGGTTGCAGAAGATCGACAGATAAATG ACGTATTGGAAGAGCTATTTGCGGAGGAGGGAAATGAGATGCATATAAGGCAAGCAGATCTGTACCTGTTTGAAGGTGAGGAATTGAGTTTTTATGAAAT AATGTTAAGAGCTCGGCAGAGAAGAGATATCGTGATAGGGTACCGTGTAGCGAATGCAGAGAGAGCAGTCATTAACCCACCAGCCAAAACTGATAGAAGG AAGTGGTCACTGAAGGATGTTTTTGTGGTCATTGCTGAAAAAGAATAAATGAGGCATTTGTGGACAACAACTTCTGTACAATTTTGAGTCCAAACTTTGT ACTTTTATGCTATGAAATGAAAAGTTGTTAAGTTCTGATGTACAAATAAGTGAAACTGTGGCAGTAACAGAAGGTTTTTATATACTAGATAGATCATTGT ACTGAGAATTAATGTCACAAAAATCAAAAGGGTTACAGAAGAAATTCACATTCTTGACTTGGTTCAGGAATGTCTGTATCTTTGTTCCTCATGTGACTAA ATGAAAAACCACATAGGATGATTCATTCTTGGTTATTATCAGAGTTGTCGACTTGGCTTAGGTATCATGTG BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_147804; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_513345
Blastp | Ion channel CASTOR from Lotus with 92.39% of identity |
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Blastx | Ion channel CASTOR from Lotus with 89.29% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019440494.1) |
Pfam | Castor and Pollux, part of voltage-gated ion channel (PF06241.11) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |