Id Trinity | TRINITY_DN46864_c0_g1_i7 |
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Name Transcript | Ll_transcript_513342 |
Sequence | TGCTGTTGATTTTCAGAAATATATATCTACAAAGCCAACTCAATAAGTTGCAGGTGTGTTTACATTTACAATTACACTTTTGAATGAATTATAAGTTCAG AGCTTATTTCTTTATGAATTAAAAAAACAAGTAGTTTTGTTTTGTTAGAGAAGCTTTTTTTTAGAATGTTATATGTATGCATATGGCGTAAAGATTTATA CACAGTCAATATCATCTACGGATTATTTGTTCGAAGAGTTAATGATGATTAAATATGAATGATGTATGATGCATTGATAGTACACCGGCCGTGTATACAT TTGTAATACTTATATTCAATGATGACTAAGAATGAACGGGTGATAGTGTAACTCTTACGCTGTCGGTGTGTACATTTTTTTTAAATAACGACTTATAAGT CAAGTAAGTTAGAGTGACCTTGTGCATCATTTCACACTTGTTGGTTAGCTTATCTGTTATAAGCTTTCAACTCTTGACTTTTTAGCTTTTAACTAGCTTT TCAACATTATACCGATATGATGCATATCTAATACGACTATACACCTATTGTTGAAGAAGAGGAATGATAAATTTGCATAAAAGTTCATAAGACATAATAA ATATATAACTGCTTCTCCAAAATTCTAAATTAAGAAGATACTTAGAGATGGCTAAGAGCATCTACAATGAAGGTTGTATAGAGTTGCATGTTTGGAATGG CAAAGTATGTTGAGGTGTATTCAGCAATTGCATAGCCAATCAATTTTTGAAAAACATTTATATGGTCTGAAAATTATGATGGGCAAAGTTTGACGCGAGA GAGGAAAATTGTACAGTTGCCAGGGTTTGAACCCAAATGCTCACACTTGATATCTCATAGCTCTACCAAGTTAGCTAACTCTTTAGGGCAATGATTTGAT TTCACAACAAAACCCCCACCCTAATACATGTGGGGCCTATTTGATGAAAATTTTAAGTTGGAGTGTGGAGTTTCTTGTGTTGCATAAAAGTAAGATATAT GAGTCGGTTTCTCTCTCTACACTTTCTGTGTGGGTGGTTGTGTGCTTTACAAAGAAGTACGAACACTTCAAAATAGTCCTTATTTTCGTGTTGGACATGC ATTTGTATTAGGTATTTTTGGACACTCCTAACCATATTTTGTAACATTTTATTTTCTTTTTCCGTAGCCCTGTGCTTGAGTCATATTGTATCTGTATCTT GTGTCGCATGTGTGCCTCCTTGGTTTCTTTTGTCTTCAAAGGTAGTTTGAGTTTTGTGCTTGGATCCTATTTATTAATAGAATACTATACCAAATCGAAG AATTGTATGGTGTGAAACACAAAAAATAAAATTGAAGAGCCAAGTCTGTTCGGATGGTCTTTATAAAACATATGAGAAAGGTAATTTTTTAAGAGTACTA GAGTGTATTAGAAAATATTGAATTAAAAGAAAGGAGACTCAGATGCTTACTCCATGGATACACATGACACATCCATTAAGTATTAAACATTATCAATATT GGATATGTATCCGATATGGCAACGTGAAGCAATTGGAAGTATTAGTGCATTGTAGCTTTAAATCATTTTAGTTCTGTTATGCTTTTCCATCTTATTTGGT CTTAATTCAATCTTAAATTTCAAATGTTTGCATCATGTCCTCAAGGACGAACCAAACTATATTTTTCTTTTTTTCTTTGTAGGGTGAGATTGTCAGCCTT AATCTCAGATTATATGCTTACCATAAGTTGGATCCCCTAAACATTACCAGTGCTACAATTCAGGACCCTAATACTTTTGTGAGTGGAAACTTCAAAAGAA ATCTAGCACTTTTTTCCTCCTTCACACTTCTATTTATCCCTCTTACTATTTTCAAGTACATAGACTATGTATCAAAGTCAAGATTGTCTGACAATATATC AGAACAAATTTCTCTAAAGAAACAAATAGCATATTGGGTTGATGTCTTTTTATCAGTTCACCCATATGCTAAGCCACTTGTTTTGTTAGTTGCAACACTG TTGCTAATTTTTCTTGGAGGATTGGCCCTTTTTGGTGTGACTCCCGAGGATTTAGCACATTGCCTCTGGTTATCTTGGACCTATGTTGCTGATTCTGGCA ACCACGCCAGCTCCGAAGGTATTGGTCCCAGGTTAGTTGCGGTTTCCATTAGCTTTGGTGGGATGCTTATATTTGCAATGATGCTTGGGCTTGTATCTGA TGCAATTTCTGAGAAGTTTGATTCGCTGAGGAAAGGAAAAAGCGAGGTGGTTGAACAAAACCATACTTTGATTCTTGGCTGGAGCGATAAATTGGGTTCA TTACTGAATCAGCTTGCCATAGCCAATGAGAACCTATGTGGGGGAACTGTTGTAGTGATGGCTGAGCGAGACAAGGAAGAAATGGAGCTTGACATTGCAA AAATGGAGTTTGACTTCAAAGGAACATCTGTCATATGCAGAAGTGGCAGTCCCGTAATTTTAGCTGATCTGAAAAAGGTGTAATGTCCTGTTTTATCCTT TTGTTTGGAAATGTGATTGTCTCTATCTATATTTTAATGTATGAATTCTATGTTGACATATATATTAAAGGATCGAGTAGAGCATCCCACAATTGTGATT TTCTCTATCTATATTTTTGGAAGACTAAGTAGTTTAGATATTTTGCTAGCCTTTCATTTTAAAATAGCTAACACTTGTTTTAGGAGGTCGGAAGAACTTC TTATCATAAACACATGTTGGTTTAATGTTATATTATTTTTCTAATTTCTTGCAGTAGCATTATGACATAAATGTCCACTTTCTGGTGGAATATATCACCT GCTGACTGGCACCATCTAAAGCTTTTGTTTGCTGAATTAGTTACTAATACCTTGTGATATACAGGTTTCTGTTTCAAAGGCTCGTGCAATAATTGTCCTT GCTGAAGATGGGAATGCTGATCAGAGTGATGCCCGCGCTTTGAGAACAGTCTTAAGTCTAACTGGAGTCAAAGATGGATTACGAGGGCACATAGTGGTTG AGTTGAGTGATTTAGACAATGAGGTCCTTGTTAAACTTGTTGGTGGTGATCTTGTTGAAACTGTCGTAGCTCATGATGTCATTGGTCGGTTGATGATTCA ATGTGCTCGGCAGCCTGGACTTGCACAGATTTGGGAAGATATACTTGGATTCGAGAATTGTGAATTCTACATTAAAAGATGGCCGCAGTTGGATGGTATG CAATTTGAGGATGTATTGATCAGCTTTCCTGATGCAATTCCTTGTGGAGTCAAAGTTGCAGCACATGGTGGTAAAATTATTTTGAATCCAGATGACACCT ATGTTCTACAAGCAGGTGATGAAGTTCTGGTCATTGCGGAGGATGATGATACCTATGCCCCAGTGTCCTTGCCTAAGGTTTGGAGGGGAAGCTTACCCAA GGACTTTGTTTGTCCAAAGTCTCCAGAAAGAATACTTTTTTGTGGTTGGAGGCGTGATATGGAGGACATGATCATGGTTTTAGATGCATCTCTTGCAGAG GATTCTGAACTCTGGATGTTCAATGATGTTCCAGAAAAAGAGAGGGAAAAGAAGCTAACAGATGGTGGCCTTGACATAAATCGATTGGAAAATATTTCAC TGGTTAATCGTGAGGGGAATGCTGTCATACGTCGTCACTTGGAAAGCCTTCCATTGGAATCATTTGATTCGATATTGATTTTGGCCGATGAATCAGTAGA GGATTCAGCAATTCAAGCCGACTCTAGATCTCTTGCCACATTGCTTTTAATTCGTGACATACAAGCTAAGCGTCTTCCTTATAGTCAAGCTGATGGAGGA AGCTTCTCAAAAGGTTCATGGATGGGGGAAATGAAGCAGGCTTCAGATAAAACAGTTATAATCAGTGAAATTTTGGATCCAAGGACAAAAAATCTTTTAT CTATGTCAAAAATTAGTGATTATGTTTTATCAAATGAACTTGTCAGCATGGCTTTGGCCATGGTTGCAGAAGATCGACAGATAAATGACGTATTGGAAGA GCTATTTGCGGAGGAGGGAAATGAGATGCATATAAGGCAAGCAGATCTGTACCTGTTTGAAGGTGAGGAATTGAGTTTTTATGAAATAATGTTAAGAGCT CGGCAGAGAAGAGATATCGTGATAGGGTACCGTGTAGCGAATGCAGAGAGAGCAGTCATTAACCCACCAGCCAAAACTGATAGAAGGAAGTGGTCACTGA AGGATGTTTTTGTGGTCATTGCTGAAAAAGAATAAATGAGGCATTTGTGGACAACAACTTCTGTACAATTTTGAGTCCAAACTTTGTACTTTTATGCTAT GAAATGAAAAGTTGTTAAGTTCTGATGTACAAATAAGTGAAACTGTGGCAGTAACAGAAGGTTTTTATATACTAGATAGATCATTGTACTGAGAATTAAT GTCACAAAAATCAAAAGGGTTACAGAAGAAATTCACATTCTTGACTTGGTTCAGGAATGTCTGTATCTTTGTTCCTCATGTGACTAAATGAAAAACCACA TAGGATGATTCATTCTTGGTTATTATCAGAGTTGTCGACTTGGCTTAGGTATCATGTG BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_147804; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_513342
Blastp | Ion channel CASTOR from Lotus with 91.41% of identity |
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Blastx | Ion channel CASTOR from Lotus with 91.24% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019440494.1) |
Pfam | Castor and Pollux, part of voltage-gated ion channel (PF06241.11) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |