Id Trinity | TRINITY_DN46874_c0_g2_i8 |
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Name Transcript | Ll_transcript_512172 |
Sequence | ATCGCTTTTTCTAAAAGAGAGAGGATGATGGTTGCCACAATGTTGTTGTGACAATTGTGAATGAAGAAAGTGCAACGAGTGTGGAAAATGACAATGGTGA GTAAAAGATGATCAAAATATGAAAATATCTGATAAATAGCGACAAAAATATAAATAATAGATATTGAAATGTCAAGTAAGAAAAGCGAGAGAGTTATCGA TTCTCCCCAATTCCCTCGCACTACTCAAATGTCTTCCCCTACCTCTCCCGTCGCCGATCCTCTTCGCTCCGTCTTCCTCGGCGTCGACGTCGGCACCGGC AGCGCTCGTGCTGGTTTGTTCGATGAGGGTGGAAAACTTCTTGGTTCATCAAGTAGTCCAATACAGATATGGAAAAACGGTGACTGTGTTGAGCAATCCT CTACAGATATATGGCTCGCAGTTTGTGCAGCTGTAAAAGCAGCCTGCTCTCAGGCAAAAGTTGCACCTATAGAAGTTAAGGGTCTGGGATTTGCAGCGAC TTGCTCTCTTGTCGCGGTGGATGCTGACAGCTCACCTGTTTCGGTTTCTTGGAGTGGTGATTCAAGAAGAAATGTGATAGTATGGATGGATCATAGAGCT GTTGAACAAGCTGAAAGGATCAATTCCTTTAACTCACCTGTACTACAGTACTGTGGTGGAGCTCTTTCACCCGAAATGCAACCACCAAAGGTACCATCTG AACTAGTGCCATTATTTCACCAATGGTCATTGTACATAGTATGTTGTCTACTAAATTTCACTTTAGGCATTCTCCTCCTTATATCCAGTTGTTGTAAAAA ATTCAAGTGCAGTGTAATTTTAGATTATTGTGGCTGCCTGTACAACTGTTGATTCAGTGATCAGTGATAATGTCAAATACCACATCTGCAATTTGGATAA GCCCTTTCCATCTGTCTTGGATTAAGCTTATAAATCATGGTTAATCTGAGTAGATGACCAACTAGATACACTTGATAGGATTTGTAGGAATAATGTATGA ACAGATCATTCTTTCATGAAAAAAGGTATTTCACCCTTTCACTTTTTGTTACCTTTATCTTCTTGTTTTGTATTACTAGTGCTCTTATTTGGTTTAGTGT GGTTGAGTATACTTGACTTCCAGAAAATTATATTACCGAGGATTAACATCTTGAAGATACTAAAACTGTAAAATTGCTGACTTTTACTGATGGAATCTAA CTTCTCAGCTTCTCTGGGTTAAAGAAAATTTGCAAGAATCCTGGGCTATGGTTTTCAGATGGATGGACTTGAGTGATTGGTTGTCATACAGGGCAACTGG AGATGATACTCGCAGTCTGTGCACCACAGTTTGTAAATGGACATATCTTGGTCATGCACACATGCAGCATATCAATGATCAAAACTCCCGAGATATGGAA GCTTGTGGGTGGGATGATGAATTTTGGGAGGAAATTGGTTTGGGTGATCTCATTGAAGGACATCATGCTAAGATAGGTATTTCATTTGACTGACATCGGC CTACCCACTTTCACTAGTGATAAGCTCTGAGACTGTCTAATGTGGACTTAATGCAAATTCCATATTTTATGATAGTTTGAGTCTTGAGTTTTGACTGTTG CATAAATGCAAAATTCCTGTTTTAGTAGACGACTTGTTTTCCAACTGAAGTGGAAATGGGGTAAATGCTATATGCTATCGGTTTTCCCTATTTGTTAATA TATTTTCTCTGCTTACAAGATTTAAGTATGAGATGGGAATTATGTGTGCAATTATCGATCTATTTGACCAGGACTATTTCAAGTTTTTATTACTTGTCTA GCAAATTTTAAAGTAAGGAAATAATCTCATGGAACATTTTGGTGCAAGTGGAAACTGTTTTAGTCCACCTTAGCTTTTATATTGAACTTAATTATTTTTC TCCCTTTGGAAGTTCAATATGAAAAGCAGTATTATTGTGCAGTATGCTTAGTTATGATTTAAGTTTGAAAGTTGTAATTGTTGTTTTATTAAACAATTCT TGTTTTTTCGTGTGTGATCCAAAGAATAATGGGGGTAAGCTTTGAGTAAGCTTAGGTTTAATTATCTATTTTTTGTGCTATTCAATCTATTTCTACCTTT TGATTTCTCAACAAGATAATGGTGCTTAATAACAGGACGAAGTGTTGCTTTCCCTGGCCATCCTCTGGGCTCTGGCCTTACTCCCACTGCTGCAAAGGCA AGAAATTCTGTATGGAAGATTTTGCATTCCTTTGTTGTTTGAACCAGTGCTTCCTTAAGCTTCATTATCAAAGCAAACATATATTGCTTAGTGGGAAGAA TATCAGTACTATCTTCCTCCTTCTGTGGGGATTGGTTCGATTTGATGTGACAAACTCCTGTGATGAGCTGCTTTTTAAAACTTCTTATGGGTTGAAATTT TCAGGAACTGGGTCTTGTACCGGGAATTCCTGTTGGGACATCACTAATTGATGCTCATGCTGGTGGGGTGGGGGTCATTGAAAGCGTGCCACCATCAGAA GCTGAAGAACATGACAAGGAAGCGATTTCCAACCGCATGGTGTTAGTTTGTGGAACTTCCACGTGCCATATGGGTGTATCACGGAGCAAATTATTTATCC CTGGGGTTTGGGGTCCATACTGGTCAGCAATGGTACCAGAATATTGGCTGACTGAAGGTGGGCAGAGTGCTACTGGTGCATTATTGGATCATATAATTGA AAGCCATGCTGCTTCTCCACTACTTGCTAATCGAGCTGCTTCTCAAAAGATTTCAGTGTTTGAGTTTCTGAACAAGCTCCTGGAAACAATGATGATTGAG CAAAAGCAATCCTTTGTTGCTGCCTTGACTGAAGATTTACATGTTCTTCCTGACCACCATGGGAACAGGTCTCCCATTGCAGATCCAAAATCAAAAGGAG TTATCTATGGTTTGACACTTGACACAAGTGAGAAACAGTTGGCTCTTCTATACCTAGCAGCTGTGCAGGGCATTGCGTATGGCACCCGTCACATTGTAGA GCATTGCAATGCCCATGGCCACAAAATCAACACTCTTCTTGCATGTGGTGGCCTATCAAAGAACCCTATCTACATTCAGGAACATGCTGATATTATTGGT ATTATTGAGTGTTTTTTATTGGATCTTTTTCATTGTGTTACACACTCTGATACGATATCATTTTCGTAAATATTCTGTGTGGACTTTTTTCAGTGTGACA AATGACACTTGTGTTCCAATTTTAAAGGGTAGCAAAAATATGCTAGCATCTAGGGTTTCTTACCCTGTCCAATGATAACCATTAAAATAACAAAATAATA ATAACTCAGTAATTTAGCTGTAGAAAAACAGGATAATTAGTCAAGAACTTCAATCTTATATGAAATATATCTAAATTGCGTGTATATAATACAACCTTGC TAGACAGCTAGTATCTCAAACTTTGTCATCAGCAGAATTATTTGGCATCTTATGCTCCCTCGCGATATTAGGTTGTAGTTGTTCCATGATCTGGACTCTA TCTTATTTTATATTTTTAATTCATTAATAAAAAATGATTAAGTTTCCTGTGTCCAAATAATAAGAAATGACGAAGAAGGTATCAGAACATTAGTTTATAC TAATTTTAAAAAAATAGCGAATCACAATTATAATTGTCCCAGGTTGCCCTATTATTCTTCCAAGGGAGAGTGAATCTGTGCTCTTGGGTGCTGCTATCCT GGGTGCTGTTGCTTCAAGGAAATATCGGAGCCTTAGTGAGGCGATGAAATCCCTTAATGCTGCTGGTCAGGTCATTCATCCATCTGAAGATCCAAAGGTT AAAAAGTACCATGATGCCAAATACAAGATCTTCCGTGACCTTTATACACAACAGCTCGAGTTTCGTTCCATGATGGCACAAGCCTTGGCATAGCTTTGCA AATTGCCGGGACTCAAAACTGAACATTACTAGTTTGATCATTATCTGTTTCAAAAATGGTCATACTTTTTGGTAGCAGGTTAGGCATTGAAGAACTCAAA GATACAAGAAAAGACAAGTTACATGTACAGGCTCATTGGCTACTTACTCTTTTCCTTAAACAAAACCTGCGTGGAGCTTGATGTTGTACGTGATAATTTA GACTTTCAACAATGGAGAATATAATTATATGATATTCTTGTTCCAAGTGGTGCCACATGATGTGATAGGACTTCCTTAAATCTGGACCAGTTGAAAGGCA TATTTAAATGTAGTGGACCTCTGTAAAGTTTCAACCACTGGTTATTCCCAACCCTTTTATTCTTGTGAGTTTTTAAGGATACACTTTCAAATCATCGACC TCCACCTCCTATTTGTCTTAGATGCGTTTCTGCTTGAGAAGAAGCAGCATATGCTTGTTTCAACCACCCTCAGTTTTCAGAAAAGGTGAGGGGGAAAATA CTAAGCTTGGTTACAAAAGTTGTTGATAGCTTAACTGCCCATACCCCATAGCTGGCATAGGAAGACATTCTTCTATTATTTTAGGTTTTGGGGTTTGTAA CATGTATCAGCTATACCAAAGAATGTCCCAATTTCTTGTGTCTGCTAATTAAAAATTGACACATAACTTAATAGATTTTTTTTAAAAACAAAATACTGTA TTTTTGTATTACTTGTTTAATGTTAATTGGATCGGGACAAAGTTTGAT BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_147879; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_512172
Blastp | FGGY carbohydrate kinase domain-containing protein from Mus with 53.44% of identity |
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Blastx | FGGY carbohydrate kinase domain-containing protein from Homo with 52.14% of identity |
Eggnog | ribulokinase(COG1069) |
Kegg | Link to kegg annotations (75578) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019463457.1) |
Pfam | FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain (PF02782.15) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |