Id Trinity | TRINITY_DN46915_c1_g2_i4 |
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Name Transcript | Ll_transcript_314026 |
Sequence | GTAACTCCTGAGCAAACGTTGGTTCTTGTTCTTCTTTTTCGTCTCTCGCTCTCGGACCCCACTTTCTAAGAACCCATTGGTTTTTTGATTTCGTAAGAGG ACATGGTTAAGCGGAAGCAGCAGAAGAAGCAATCACACAAGAAGCAAGAACAACCGCAAAATAAGAAGCAAGGAAAACAGGATGATGCTTCACAATTTTG GACTCAGTTGGATGTTCTGGGCCTACGCATTGTTGAAGTGACAGCAGATGGCAATTGTTTCTTCAGAGCCCTTGCTGATCAGTTGGAGGGCAATGAGGAG GAACATCGAAAGTACCGCAGCATGATAGTGAAACACATATTGCTGTTTTTAACAGGACAACCGAGAAATGTTTGAGCCCTTTATTGAAGACGAAGTCCCA TTCGATGAATATTGCCGATCCATGGAAACTGGTGGTACATGGGCTGGACATATGGAATTGCAGGCAGCTTCTCTAGTAACACATAGTAATATATGCATTC ACCGGGTAAGTAATGTACCTGAAGATAATTAATTGTGTTCTCTTATATTCTAACGTGGATTTATTTTATATTTGCTAGCTAATTCATACTGTTACCTAAA GGTATATTAAGACATGTCTTAAGTGGATGTTTTTCCACATTATATCACCTTTGTCCCATGCATTTTTTTAAATGTGTTTAATCTTCATTTATTAATAATG ATGACTAACATTTGTGCAGACACAGACAAGTATTTCTAACTTTTTGGTAGATTTTGCATAACAATGCACCCTAAAGTTAATTGCGATTCACATGCTAATT GGTTTGCTATTGCAGAGCATGACTCCTCGCTGGTACATAAGAAATTTTGATGATCGTGGAGCTCGTATGATCCATTTGTAAGTACTATGGAGTTTATGAT TGTTATGTGAAATTGCACTGCACACTATTTTATCCAAGGCTTTGAGCAGTATATCGATCTTTTTGAAATGCTATATCTATGACTAAGGAAGAAGTAAATA GTTTATGTCTTCAGCTTGCTGGCAGACTCTGGGTCTTAATACCTTAGAATCACATGACCACTGGAAAAAGTTACATTCATTTATCTTCTAATCTTGTCAA TTCAAATAAAATCCAATGGTTTAGATCCTCACCTTTGACAATAACAAGGTGTTCTAAGCTGATATAGTCCCTATACATAAAGGCACACACACACAAACAC ATAGAATAGTAGAGTAATAGTGTATGCTGGTCATGTAGATCAAGGTACGGTGAATTATAATTGGGTGGTGATATAGTTTTATCGCACGATTCATATTGCG AATTGATGCAGCTTTCATCCCCAACAATGCAAATCACAATTCTTATGTGTCTAAAACAGGCAGGTTTCCTGGAAACCCTAGAAAGATGATTTTTTTCTTC TTGTTTTTTTAAAACCCACTTCAGATGGTCTGATTTTACCATTCAGAATGGGCCCAAACCTAATTTCTTACCCTTTGCTCATTTAACATCTGAATTTACT TCTCCCACTTGTAAAAACTATGACGTGAGTATCATCTTCGGTCACTGCCATTTCTTTGTTTTAGCCTACATCTTCTTTATTCCTTTTGTTGTTGTTTCAA CATATTAATTAAGATGAGTCTTATGACTTGAATTTGTGTTTTTTACTGTATGTTTGTTGTTATGAGTCTTATGACTCTTATTTAAGTACTTTTAATTATT GATCATGAATCTTACGGTTCACAATATGATTCCATACATGATTAAGAAAACAGGCCTTCCGATTCATAATCTGAATCCCGTTTCGACTACCATGATATAA TGCAGTTGGGTTATTTGGAAGGAAAATTGATAAAATAAAGGAGCAAACATCCATTCAGCTTTTGTGAATGGAAAAATCTTGTTTATTAATCATTCCAAGG ACCTAGAACCTATGTTTAATTATTTTTGTGATCCTATTTGTATGTGGCTGGAGTAGTATGTACCTCACAGTTTCCTATTAGGTGAATCAGAACATCTTAT CATTTTAGGGAAGACAACCCCTGTAATTTTGTTCTGTGTGCAAGTGTGCAATAGATCTATTTAAACATGAAATTAAAATTTAAGATGCACACAACAATCA GTATTTTCTCTGGTGGATGGCATTGAGGACTTGCGGTGAACTATATATTGTCCTGCGTGCAATATATTGCGAATTTGTGACAAAGATGGGTGGTGCACAA AGAAGGAACAACATATGCATGAAATTGTCAGAAGATAGTATTTCTAACACAATTGTTGAAACTTGTTTAAGAGTAGTAGTACCCATAAACTATGAGGGTG GATGAGATTTCTCACCTTCAAACCCCCATTTCACTCATGGTGCTGCCAAGGCACCATTTGTGTGATGGCTGCCATTACAAAGCTGCCATACTTCAACATT CATACGAAAGGTTTCAGAAAGTCTGCCATGCCGTACGACCATGGCCGTCATTTTATATGAACTTTATTTGTTTATGTTTGGGTATATATGTTTTTCCAGG TCTTATCATGATGGGGAGCATTATAATAGCGTGCGGTTAAAGGATGATCCTTGTGACGGGCCTGCAAAGTCAATTGTAATTAAGGCTGATGCTGATCTTT CAGCGACATCACATCAAGCAAAAGTTACAGCTAACAAATCCCGTGAGCGGACTGATAAAGGAACTTGTCTGCCAGGGTCCATAAAGTTGGTTATGGCTGG AAGTGGATGTGAAAACACTGAAAAAGTCGAACAGATTCTAGAGCAGGTAAATGGAAATGTTGACGCTGCAATAGAGTTTCTTATAGCAGAACAAGGAAGA GAAGAGTGCTCTGCAACATCTGATTTCTTTCCGAGTCAGGCTGATGCTGATGGACATGATGAAAATGAGAATCTCGAACACAAAGAACACACAGTAGAGG ACAGCGTTAATGCCAAATCAAATGATAGGTCCACGAAGACCAATAACAATAGCACATTGCAACCAACCGACAAGATTCCCAGAAACAAGTTCTGCCCATG TGGTTCAAAAAAGAAATACAAAGCTTGTTGTGGATCTGTCTTGGGAAAACAACATGCTAAGCTTGTAATTAACCAAGCAGATGACTCCAGAAAGGGCAAA AAAGAGAGGAAGCAAGGAAAGAAAGGGATTTCCTCAAAAGCTGAAGCCCCATATGAATATGACTCGGTGACACTTGACGTGGGCGCACTTTGTATTTGAA TTGATTATAAACAAGTTAATTGTGTGCTCCCCCTGAGAGAGAAACTACTTTTAGGCCAATTTGCTTTTGGCACAAGGAAAATTTGGAACAGCAAAAACAT AGACAAAAGAAGAAATAGTGGTTTAAAATCATTTTTAGTCTTTCTAGTTGAAGCAAGAAGATGCATTTGTGAAGAATGTGCAAGTTTTGATTAATTTTTA TGTGATGTCATGAGTGAGAATCTGTGTTGCACAAAATATAAAGGTGGAATACATATTGATAGTGATTTATGATTACAAAAGAGTAGCTCAATAATCAATT ACAAAGTTAAGCTAACCGA BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_148233; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_314026
Blastp | - |
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Blastx | OTU domain-containing protein 3 from Mus with 51.02% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019422192.1) |
Pfam | SEC-C motif (PF02810.14) |
Rfam | - |
GO | - |