| Id Trinity | TRINITY_DN46936_c8_g1_i5 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_312069 |
| Sequence | AAACATCTATATAAACTCTTACTCCAAATGCTTTGAACTCAAACTTGTATCTAGCATTTGCCATTGAAAAAAAGAGAGAGAGAGAAACAAATCAAGCATG GAAGAGAATGGAGAAAGAAATAGCAAAAATGGTAGCTTCAAGTTAGGAGTGAAAGATGTAAAAATTCACACAGTGGTTGAGCTTAGTAATGTGGACACAC ACAATCTTCTTGTAGATTATTGTAGTGATGTTGAAGAAGATAGAGAGAAAGAGAAAAAACCCTTCAAAAACTCTCTCTCACAAAGGCAAATGAAGTCTCT TGTTGCTATTTGTGACACTCTCTTACCTTCCATTGTTAAGGACCACACAGTTGTTGATGAATCTGTGGCTAATTTCTACCAAACTTCAGCTTCCATGGCT GGAACACCTGAGCTTGTAGGGCTAGCAACCTTCAACCTTTCAAGTTTTCTATTTCACCCTCTTTCTTTCTTCTTTTTTTCTTAATTATCGTCGGTTTCCG AGTTGAATTTTAGAGTACACGGAAGAGAAAAGAAGACTTGAAAGTTATGCTATATTTATGAGATAACTCTAAATATTTTCATTTCTCTTCTTTTCACTCC GAAATTCAACTCGCACAAAGATCATTAAGGTGCATTTGCGAAATAAGTTTTAAAAATGAATGAATGAAACATGAAAGAATTTGGGTATCTCGTAAATGTA TTTTATGTAAGTGTTTTTTTTTCTTTTTTTCCTCAAAAACTTAATTCCTAATTTAACTTATGGTGTTTTACTATAATATATTCGGTGATAGTATTATATG AAGAATCTCACTCCACAATTTTTCAGGTAAGTCAAAATTTGTCATTGGAGAAAATTTAACTCAAGGATGATAAGTTTTTTATGAATAAAATTAAAACGTT TTTACAATGTGCTTTTGTGATTTGAAGTTTTCTTGCATTTCTATGGAGAATACAAGAAGATTAAAACATTCTAGAAGGATATGTTGTCTCCAAACACGTA TTTAAGTCTACTTTTAAATTAATTAAAATGAAACAAAAATAGAAAAAATCATAAATATGTAATTTTTTAACTGACATAAAATATTTTGATTAGTGTAGAA CAAACTTACAGAAATGTTTGGGGGCACCAAATTATTATCTTAAAACTTTTTCTAATGTTCCTTTTTTTAGTTATGCATGTTTATCTACCATAAAGGTTGA AACAATAAAATGCACACACAGAAGTTTTAGAAAATTCTCACAAAATGTCAAAGGTATAGTTCAGACAATTTGTACATAATTCTGCTTTGTCCATCAATAA TATCTCAAAAAGTAATATGATTCTTATGTCAAATGCAATTCCTTTTTTTTAAAAGTGTTTAAATGAAAATCTTTGGGTAATGGCTAAAATTTAATTTTGT GATCATATATTTAATTATTTCAATTTAGAACTTCATTAAAATATAGTTAACAAATACCTTTGTAGCATACTCTTTCTCCTATATTAACTTTTCTTATCAT ATATTGTTATAACATTTCTATATGGTTTTTTACTTTAATTTTGTAGCTAGGAATTTTAATAATTGAGAAACTCCAACACCAAATAAATAAAAAATACTTT TTGTAAGTAAAATTATTCCTATATTAATTTTTGTTATATCCTATATTGTAACATCTCTATGTGTGTTTTAATTTGTAGATTGGGACATTGATAAGTGAGA AATTGCAACACCCAAATACATGGTTGTTGAAATTAACATTATGGCTACTATCAACATGGTTTGGAACATTGATACTATGTGGCATTTCAAGTTTCTCATT GAATTTCCCTTTCTTTCATAGTTTCTCTCAACTTTCTCTTCAAAAAAGACAACAAATTATGTTATCTTGGTCTCTCAGTTACTTTAATCTCCTTAGGATG TTCTTCAGAAGTGTCAAGCTTCTCACTCTACTTATCTTCTTTACTCAGGTAAATTAAATAAATAATATTGCCCTCATTAATTAATTAATTTATTATTATT ATTATACATCAACAAGAGCATGTTTTATTTAAATGAATAATTGTTGGGTGGTATTCATTCATGGACTATAACATGTCTCAATGAGTTAAGTGAAAGAAGC ATATAAGTGGATTTGACATCACATTTTGATCAAAAATCTTGAGGTATTAGGTCTATGGGTTCATTCGTGTATATCATCTTTAACTTATTCACTTTTACAT AATATGAGACTTCTTTATTCACATTTGAAATACCGAGCAATAATAAACATAGTGGTGTATTTAATGTGTTTTGACATATGTTAATGTTTCTTCATGTTAT TTATGATATTAATAAGAATTGCTTTGTTTGATTTTCTATGTTGCATGTCTTGTGATTGTACGTAACTCAATTGTTTGTTTGGACATGCTAAAGGTGTGTC CAATTAATACACTAATGATTTTAAAAGATGTGTAAGTATAAATAAATATTTTAAAGTGAGTTAAAAAATGATATAAATGGCATGATAGTTTAATATATTG TAGTAGTAGTAGTAATTAATTAGGGTAAAGATTGAACTTATAATTGATCTAATTCAGCAAAAGATTTGAAGTTGTTTCAACTTTAAATAACTATTTGCTA CTTGAGTATAGATAGATAATACGAGAATTAAATGGAAAGCTTCAAAACCATTTCACATATATATTTAATGATTTTTAAACATTTTTTTTCTCTCGTTATC CTAGAAAAACTCGTAAGTAGGCTCTATGAATATTTTAATAACAAATTTGTGCAACAACCCTAATAATATTTAAAGAACAATTTTTGTTAATCGGTATAAT AATATACTTAATACACATACTTAAGGATGATAAAGAACCTCAAACCCGTGTTTACCCGATTCACATGGGAATGGATCACAAATGAGTATTTGTAGGTTTA AGAAAAGAATTCTTCGAATTACTCAGAATTACTCTCGTATCTTATTGAATTTGAATTTTAAATTTGTA BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_148423; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_312069
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Long-chain-alcohol oxidase FAO4A from Arabidopsis with 53.85% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019446944.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |